Rahasta, Atika Hanoum (2018) Peran Bioaktif Peptida Csn1s2 Dari Susu Kambing Ethawah Pada Metabolisme Glikolisis. Sarjana thesis, Universitas Brawijaya.
Abstract
Kerusakan Insulin merupakan salah satu penyebab penyakit diabetes melitus tipe II (DMTII), salah satu enzim yang menjadi alternatif untuk memproses glukosa pada pengobatan penyakit ini adalah glucokinase (GCK). CSN1S2 dari susu kambing ethawah merupakan salah satu nutrisi alam yang terbukti mampu memperbaiki kondisi pasien dengan penyakit degeneratif seperti DMTII. Oleh karena itu tujuan penelitian ini adalah menganalisis peningkatan aktivitas glucokinase oleh bioaktif peptida CSN1S2 pada metabolisme glikolisis. mengidentifikasi peran dari bioaktif peptida dari protein CSN1S2 dari susu kambing Ethawah terhadap enzimatik glucokinase. Protein GCK yang digunakan pada penelitian ini diambil dari RCSB Protein Database dengan Protein ID:1v4s yang kemudian dipreparasi dengan Vega ZZ. Kemudian protein didocking dengan 8 bioaktif peptida CSN1S2 dari susu kambing ethawah yang telah diperoleh dari studi sebelumnya. Docking dilakukan dengan Cluspro 2.0 dan Hex 8.0. Analisis dilakukan dengan menggunakan LigPlot+ dan Discovery Studio. Ada tiga bioaktif peptida yang mampu berikatan dengan GCK, namun hanya dua yang berhasil berikatan di sisi alosterik GCK. Peran aktivator CSN1S2 dapat terlihat dari banyaknya ikatan hidrogen yang terbentuk pada kompleks GCK setelah penambahan CSN1S2 dengan glukosa, jarak rata-ratanya pun juga dekat. Sehingga studi ini membuktikan peran aktivator oleh CSN1S2 terhadap glucokinase.
English Abstract
Insuline defect is one of the main reason a patient diagnose with Diabetes Mellitus type II. This defect lead to inability of insulin to process glucose into smaller molecules. Therefore it is need to seek for an alternative enzyme that can proceed glucose in blood. One of the enzyme that have the ability to convert glucose into smaller molecules is Glucokinase (GCK) but this enzyme has low affinity to sugar. CSN1S2 from Ethawah goat Milk is one of the natural nutrition which has proven can fix degenerative patient’s condition. Therefore in this study is aiming to analyze what roles of CSN1S2’s bioactive peptides in glucokinase enzymatic activity. This study done using in-silico approach. Glucokinase used for this study have protein ID:1v4s. It then prepare using Vega ZZ. Cluspro will use to dock 8 bioactive peptides and later using Ligplot+ and Discovery Studio to screening the complex. Docking also done between these complexes with glucose to see its effectiveness. Result of this study show only 3 bioactive peptide from CSN1S2 can integrated with GCK. Yet only two of it is attached to the allosteric site. The activation activity can be measured by the shortert distances made between glucose and GCK-bioactive peptides and also number of hydrogen bonds increase. Therefore this study is proving activator role of CSN1S2 to Glucokinase.
| Item Type: | Thesis (Sarjana) |
|---|---|
| Identification Number: | SKR/FMIPIA/2018/541/051800429 |
| Uncontrolled Keywords: | CSN1S2, Diabetes Mellitus tipe II, Glikolisis, Glucokinase, In silico. CSN1S2, Diabetes Mellitus type II, Glycolysis , Glucokinase, In silico |
| Subjects: | 500 Natural sciences and mathematics > 572 Biochemistry > 572.7 Enzymes |
| Divisions: | Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam > Biologi |
| Depositing User: | Nur Cholis |
| Date Deposited: | 09 Feb 2018 07:20 |
| Last Modified: | 10 Oct 2020 15:30 |
| URI: | http://repository.ub.ac.id/id/eprint/8852 |
Actions (login required)
 |
View Item |