Fitriyah, Umaya Rizka (2017) Isolasi Dan Identifikasi Molekuler Bakteri Endofit Akar Mangrove Sonneratia Alba Penghasil Enzim Gelatinase. Sarjana thesis, Universitas Brawijaya.
Abstract
Enzim gelatinase merupakan enzim yang menghidrolisis gelatin menjadi polipeptida, peptida dan asam amino.Enzim gelatinase merupakan salah satu enzim yang penting karena perannya dalam menghasilkan hidrolisat gelatin.Hidrolisis gelatin secara enzimatis menghasilkan hidrolisat gelatin yang mengandung asam amino glisin, prolin, dan hidroksiprolin yang mempunyai sifat sebagai antioksidan dan antihipertensi.Salah satu sumber enzim gelatinase yaitu bakteri endofit.Bakteri endofit merupakan bakteri yang hidup di dalam jaringan tumbuhan dan mampu untuk membentuk suatu koloni dalam jaringan tumbuhan tanpa memberi efek negatif pada tumbuhan yang ditempatinya sebagai inang.Bakteri endofit yang didapatkan diidentifikasi molekuler gen penyandi 16S rRNA. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mendapatkan bakteri endofit akar mangrove Sonneratia albayang mampu menghasilkan enzim gelatinase serta untuk mengetahui homologi atau kemiripan bakteri endofit mangrove Sonneratia alba berdasarkan hasil identifikasi molekuler gen penyandi 16S rRNA. Metode yang digunakan adalah metode deskriptif eksploratifdengan dua tahap penelitian.Tahap pertama dimulai dari pengambilan sampel akar mangrove Sonneratia alba dari Pantai Aeng Sareh, Madura, kemudian isolasi bakteri endofit dari akar mangrove Sonneratia alba, dan skrining gelatinase. Tahap kedua penelitian adalah identifikasi molekuler, dan konfirmasi dengan pewarnaan gram.Berdasarkan isolasi bakteri diperoleh 4 isolat bakteri.Hasil dari skrining aktivitas enzim gelatinase diperoleh 4 isolat bakteri mampu menghasilkan enzim gelatinase.Hasil terbaik terdapat pada isolat bakteri A2, sehingga diidentifikasi untuk mengetahui jenis spesiesnya berdasarkan 16S rRNA.Berdasarkan hasil identifikasi molekuler gen penyandi 16S rRNA isolat bakteri A2 memiliki kemiripan dengan bakteri Lysinibacillus fusiformis dengan nilai similaritas 87% dan diberi nama sebagai Lysinibacillus fusiformis UB-U. Berdasarkan hasil filogenetik, Lysinibacillus fusiformis UB-U memiliki hubungan yang lebih dekat dengan Lysinibacillus boronitolerans strain DNP-20 dengan nilai bootstrap 87%. Lysinibacillus fusiformis UB-U adalah gram negatif dan berbentuk batang (basil).
English Abstract
Gelatinase enzyme produced by microorganism hydrolyze gelatin into its sub-compounds (polypeptides, peptides, and amino acids). Gelatinase enzyme is an important enzyme because of their potential role in producing gelatin hydrolysate. Gelatin derived peptides that have repeated unique glycine proline and hydroxyproline in their structure who have antioxidant and antihypertensive activity. Endophytic bacteria occupy internal tissues of plants without causing damage to their hosts. Endophytic bacteria were isolated and identified, through partial sequencing of the 16S rRNA encoding gene. This research used a descriptive explorative method with two stages of research. The first stage is started from a sampling of root mangroves Sonneratia alba from Aeng Sareh Beach, Madura, then isolation of endophyte bacterial from root mangrove Sonneratia alba, and screening of gelatinase. The second stage of research is molecular identification and confirmation by gram staining. The results of the screening are obtained 4 isolates that produced activity of gelatinase which the best gelatinase activity is producing by isolate A2, so it is identified to know its species type based on 16S rRNA. Based on the results of molecular identification, isolate A2 has similarities with Lysinibacillus fusiformis with a similar value of 87% and a value of 13% can be used to distinguish strains with other bacteria so named Lysinibacillus fusiformis UB -U. Based on phylogenetic results, Lysinibacillus fusiformis UB-U has a close relation with Lysinibacillus boronitolerans strain DNP-20 with bootstrap value of 87%. Lysinibacillus fusiformis UB-U is a gram-negative and rod-shaped (bacillus)
| Item Type: | Thesis (Sarjana) |
|---|---|
| Identification Number: | SKR/FPR/2017/1136/051800247 |
| Uncontrolled Keywords: | Bakteri Endofit, Mangrove Sonneratia alba, Gelatinase, 16S rRNA, Filogenetik, Bacterial Endophyte, Mangrove Sonneratia alba, Gelatinase, 16S rRNA, Phylogenetic |
| Subjects: | 500 Natural sciences and mathematics > 572 Biochemistry > 572.7 Enzymes |
| Divisions: | Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan > Manajemen Sumberdaya Perairan |
| Depositing User: | Nur Cholis |
| Date Deposited: | 22 Jan 2018 03:49 |
| Last Modified: | 28 Sep 2020 17:22 |
| URI: | http://repository.ub.ac.id/id/eprint/8245 |
Actions (login required)
 |
View Item |