Istiqfarin, Ninggarwati (2017) Isolasi Dan Identifikasi Molekuler Bakteri Penghasil Enzim Gelatinase Dari Sedimen Pantai Mandaranrejo Pasuruan. Sarjana thesis, Universitas Brawijaya.
Abstract
Gelatinase merupakan enzim yang dapat menghidrolisis gelatin menjadi hidrolisat gelatin. Enzim gelatinase ini dapat ditemukan pada bakteri gelatinolitik. Enzim gelatinase memiliki manfaat dalam bidang kesehatan yaitu berperan sebagai anti kanker. Pengambilan sampel dilakukan di pantai Mandaranrejo Pasuruan, karena di daerah pesisir ini merupakan daerah yang dekat dengan pembuangan limbah perikanan dan belum banyak data yang diambil mengenai isolasi dan identifikasi bakteri sedimen pantai penghasil enzim gelatinase. Tujuan penelitian ini adalah untuk mendapatkan bakteri penghasil enzim gelatinase dari sedimen pantai Mandaranrejo Pasuruan yang selanjutnya dilakukan tahap identifikasi molekuler. Penelitian ini dibagi menjadi dua tahap utama, tahap pertama yaitu isolasi mikroorganisme dan tahap kedua yaitu skrining enzim gelatinase, uji pewarnaan gram, dan identifikasi molekuler 16S rDNA. Hasil isolasi bakteri dari sedimen pantai Mandaranrejo didapatkan empat isolat bakteri dengan kode PSR.1, PSR.2, PSR.3, dan PSR.4. Dan hasil pengujuian menunjukkan bahwa bakteri yang memiliki kemampuan hidrolisis gelatin atau aktivitas gelatinase yaitu isolat kode PSR.1. Isolat yang positif menghasilkan enzim gelatinase, kemudian dilakukan identifikasi molekuler menggunakan metode 16S rDNA dan untuk mengetahui kekerabatannya menggunakan aplikasi NCBI Blast . Hasil bakteri yang didapatkan adalah bakteri yang memiliki kekerabatan dengan Proteus vulgaris dengan tingkat kekerabatan pada NCBI Blast dengan nilai Query Cover sebesar 99% dan nilai Identity sebesar 98%, dan hasil analisis kekerabatan dengan pohon filogenik juga menunjukan kekerabatan terdekat dengan Proteus vulgaris dengan nilai 0,85%, sehingga isolat bakteri PSR.1 diberi nama Proteus vulgaris UB-N. Untuk penelitian selanjutnya diharapkan dapat dilakukan uji tambahan secara spesifik yaitu uji fenotip microbacth dan uji aktivitas enzim dengan optimasi produksi bakteri sedimen perairan pantai yang mampu menghasilkan enzim gelatinase.
English Abstract
Gelatinase is an enzyme that hydrolyze gelatin into gelatin hydrolyzate. This gelatinase can be found in gelatinolytic bacteria. Gelatinase enzyme has benefits in the health sector that acts as an anti-cancer. The aims of this study were isolating and identifying the gelatinase-producing bacteria isolated from coastal sediment. Sampling was conducted on the coast of Mandaranrejo Pasuruan, because this coastal area is close to the disposal of fishery waste and not much data have been taken on sediment-producing bacteria gelatinase enzyme. This research was divided into two main steps, the first steps was the isolation of microorganisms and the second steps was gelatinase screening, gram staining test, and molecular identification of 16S rDNA. The result of bacterial isolation from Mandaranrejo coastal sediments was found four bacterial isolates with PSR.1, PSR.2, PSR.3, and PSR.4 codes. The results of the research showed that bacteria having gelatin hydrolysis ability or gelatinase activity were PSR.1 isolates. Positive isolate produced gelatinase enzyme, then molecular identification was done using 16S rDNA method and to know its kinship using NCBI Blast application. The result of bacteria obtained is bacteria that have phylogenetic relationship with Proteus vulgaris with level of kinship on NCBI Blast with query cover 99% and identity 98%, and the result of phylogenetic relationship analysis with phylogenic tree also shows phylogenetic relationship closest to Proteus vulgaris with value 0,85%, so the isolate of bacteria PSR.1 is named Proteus vulgaris UB-N. For further research, it is hoped that additional specific test will be performed enzyme activity test by optimizing the production of coastal sediment bacteria capable of producing gelatinase enzyme.
| Item Type: | Thesis (Sarjana) |
|---|---|
| Identification Number: | SKR/FPR/2017/1065/051800144 |
| Uncontrolled Keywords: | Gelatinase, Sedimen Pantai, 16S rDNA, Proteus vulgaris. Gelatinase, Coastal Sediment, 16S rDNA, Proteus vulgaris. |
| Subjects: | 500 Natural sciences and mathematics > 572 Biochemistry > 572.7 Enzymes |
| Divisions: | Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan > Manajemen Sumberdaya Perairan |
| Depositing User: | Nur Cholis |
| Date Deposited: | 11 Jan 2018 01:08 |
| Last Modified: | 04 Dec 2020 07:48 |
| URI: | http://repository.ub.ac.id/id/eprint/7881 |
Actions (login required)
 |
View Item |