Lutfiana, - (2017) Skrining Dan Identifikasi Molekuler Bakteri Penghasil L-Asparaginase Dari Endofit Mangrove Pedada Putih (Sonneratia Alba) Asal Pantai Aeng Sareh Madura Jawa Timur. Sarjana thesis, Universitas Brawijaya.
Abstract
Enzim L-asparaginase merupakan enzim yang dapat mengkatalisis reaksi deaminase asam amino L-asparagin menjadi L-aspartat dan amonia. Enzim L-asparaginase dimanfaatkan dalam dunia klinis untuk terapi kanker sedangkan dalam pangan digunakan untuk mencegah terbentuknya akrilamida. L-asparaginase dapat ditemukan pada bakteri, jaringan hewan, dan tanaman. Mikroorganisme penghasil enzim ini adalah E. coli, Erwinia cartova, Enterobacter aerogenes, Enterobacter clocae dan Bacillus subtilis. Beberapa mikroba ini dapat ditemukan pada endofit mangrove Sonneratia alba. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mendapatkan bakteri dari endofit mangrove pedada putih (Sonneratia alba) yang mampu menghasilkan enzim L-asparaginase dan mengetahui identifikasi bakteri tersebut berdasarkan sekuen 16S rRNA. Metode penelitian yang digunakan adalah deskriptif eksploratif. Hasil isolasi dan skrining diperoleh tiga isolat bakteri dan ketiga isolat tersebut mampu menghasilkan L-asparaginase. Dilanjutkan identifikasi secara molekuler dengan gen 16S rRNA dan didapatkan bakteri yang memiliki 1400 bp. Setelah dilakukan analisis BLAST, bakteri ini merupakan Enterobacter cloacae UB-P dengan strain berbeda yang memiliki query cover sebesar 100 % dan idenity 99 %. Bakteri ini mempunyai hubungan kekerabatan dengan Enterobacter aerogenes dan Enterococcus faecalis, tetapi berkerabat jauh dengan Bacillus subtilis. Enterobacter cloacae UB-P termasuk kedalam bakteri gram negatif dan memiliki morfologi berbentuk batang.
English Abstract
The L-asparaginase enzyme is an enzyme that can catalyze the deaminase reaction of L-asparagine amino acids into L-aspartate and ammonia. L-asparaginase enzyme is used in clinical world for cancer therapy while in food is used to prevent the formation of acrylamide. L-asparaginase can be found in bacteria, animal tissues, and plants. The microorganisms that produce this enzyme are E. coli, Erwinia cartova, Enterobacter aerogenes, Enterobacter clocae and Bacillus subtilis. Some of these microbes can be found on endophytes of mangrove Sonneratia alba. The purpose of this study was to obtain bacteria from white pedicree mangrove endothelium (Sonneratia alba) capable of producing L-asparaginase enzyme and to identify the bacteria based on 16S rRNA sequence. The research method used is descriptive explorative. The isolation and screening results were obtained by three bacterial isolates and the three isolates were able to produce L-asparaginase. Followed by molecular identification with the 16S rRNA gene and obtained bacteria that have 1400 bp. After BLAST analysis, this bacterium is Enterobacter cloacae UB-P with different strain having query cover 100% and 99% idenity. This bacterium has a kinship relationship with Enterobacter aerogenes and Enterococcus faecalis, but is distantly related to Bacillus subtilis. Enterobacter cloacae UB-P is included in gram-negative bacteria and has rod-shaped morphology.
Item Type: | Thesis (Sarjana) |
---|---|
Identification Number: | SKR/FPR/2017/601/051707054 |
Uncontrolled Keywords: | mikroba endofit, enzim L-asparaginase, 16S rRNA, Filogenik DNA, Endophytic microbes, L-asparaginase enzyme, 16S rRNA, Filogenic DNA |
Subjects: | 500 Natural sciences and mathematics > 572 Biochemistry > 572.7 Enzymes |
Divisions: | Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan > Manajemen Sumberdaya Perairan |
Depositing User: | Nur Cholis |
Date Deposited: | 15 Dec 2017 03:05 |
Last Modified: | 27 Nov 2020 07:47 |
URI: | http://repository.ub.ac.id/id/eprint/7091 |
![]() |
Text
BAB IV.pdf Download (1MB) |
![]() |
Text
BAB V.pdf Download (407kB) |
Actions (login required)
![]() |
View Item |