Ardiansyah, Randy Fahrudin (2017) Isolasi Dan Identifikasi Molekuler Bakteri Endofit Mangrove Buta-Buta (Excoecaria Agallocha) Penghasil Enzim L-Asparagianse. Sarjana thesis, Universitas Brawijaya.
Abstract
L-asparaginase adalah enzim yang mengkatalisis hidrolisis asparagin menjadi asam aspartat dan amonia. L-asparaginase adalah enzim yang paling penting untuk pengobatan leukemia limfoblastik akut dan mengurangi akrilamida dalam makanan. Sumber l-asparaginase berasal dari hewan, tumbuhan dan mikroorganisme. Banyak bakteri telah diisolasi untuk aktivitas l-asparaginase. Bakteri endofitik adalah bakteri yang tumbuh di tanaman dan memberikan banyak manfaat bagi inangnya. Mangrove adalah tanaman yang tumbuh dalam kondisi ekstrim dan bisa dijadikan tempat tumbuh untuk bakteri endofit. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengisolasi bakteri endofit mangrove Excoecaria agallocha yang mampu menghasilkan enzim l-asparaginase dan memperoleh informasi tentang sepesies bakteri ini. Penelitian ini menggunakan metode deskriptif dengan dua tahap penelitian. Tahap pertama dimulai dari pengambilan sampel mangrove Excoecaria agallocha dari Pantai Bajul Mati, Malang, kemudian isolasi bakteri endofit dari mangrove Excoecaria agallocha, dan skrining l-asparaginase. Tahap kedua penelitian adalah identifikasi molekuler, dan konfirmasi dengan pewarnaan gram. Bagian dari mangrove yang digunakan dalam penelitian ini adalah akar, daun, batang dan kulit kayu. Hasil skrining diperoleh 5 isolat yang menghasilkan aktivitas zona l-asparaginase yaitu kode D.104, D.105, B.103, B.104, dan B.105. Kode isolat bakteri D.104 memiliki zona aktivitas terluas, sehingga diidentifikasi untuk mengetahui jenis spesiesnya berdasarkan 16S rRNA. Berdasarkan hasil identifikasi molekuler, isolat D.104 memiliki kemiripan dengan Enterobacter cloacae dengan nilai similartas 99% dan nilai 1% dapat digunakan untuk membedakan strain dengan bakteri lain sehingga diberi nama Enterobacter cloacae UB-B. Berdasarkan hasil filogenetik, Enterobacter cloacae UB-B memiliki hubungan yang lebih dekat dengan Enterobacter cloacae strain YS60, Enterobacter cloacae strain IITRC, dan Enterobacter cloacae strain SR-07 dengan nilai bootstrap 96%. Enterobacter cloacae UB-B adalah gram negatif dan berbentuk batang (basil).
English Abstract
L-asparaginase is an enzyme that catalyze the hydrolysis of asparagine into aspartic acid and ammonia. Lasparaginase is the most important enzyme for the treatment of acute lymphoblastic leukemia and reduces acrylamide in food. The source of l-asparaginase comes from animals, plants and microorganisms. Many bacteria have been isolated for l-asparaginase activity. Endophytic bacteria are bacteria that grow in the plant and provide many benefits for its host. Mangrove is a plant that grows in extreme conditions and can be used as a growing place for bacteria endophytic. The purpose of this study was to isolate the endophytic mangrove bacteria Excoecaria agallocha which capable of producing lasparaginase enzymes and obtaining information on these bacterial sepesies. This research used descriptive method with two stages of research. The first stage started from sampling of mangroves Excoecaria agallocha from Bajul Mati Beach, Malang, then isolation of endophyte bacterial from mangrove Excoecaria agallocha, and screening of l-asparaginase. The second stage of research is molecular identification and confirmation by gram staining. Part of the mangroves that are used in this research are the roots, leaves, stems and bark. The results of the screening are obtained 5 isolates that produced zone activity of l-asparaginase is a code D.104, D.105, B.103, B.104, and B.105.The bacterial isolate code D.104 has the widest activity zone, so it is identified to know its species type based on 16S rRNA. Based on the results of molecular identification, isolate D.104 has similarities with Enterobacter cloacae with a similarty value of 99% and a value of 1% can be used to distinguish strains with other bacteria so named Enterobacter cloacae UB-B. Based on phylogenetic results, Enterobacter cloacae UB-B has closerelation with Enterobacter cloacae strain YS60, Enterobacter cloacae strain IITRC, and Enterobacter cloacae strain SR-07 with bootstrap value of 96%. Enterobacter cloacae UB-B is a gram-negative and rod-shaped (bacillus).
| Item Type: | Thesis (Sarjana) |
|---|---|
| Identification Number: | SKR/FPR/2017/745/051710291 |
| Uncontrolled Keywords: | Bakteri Endofit, Mangrove Excoecaria agallocha, L-asparaginase, 16S rRNA, Filogenetik, Bacterial Endophyte, Mangrove Excoecaria agallocha, L-asparaginase, 16S rRNA, Phylogenetic |
| Subjects: | 500 Natural sciences and mathematics > 572 Biochemistry > 572.7 Enzymes |
| Divisions: | Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan > Manajemen Sumberdaya Perairan |
| Depositing User: | Nur Cholis |
| Date Deposited: | 23 Nov 2017 04:15 |
| Last Modified: | 02 Dec 2020 01:15 |
| URI: | http://repository.ub.ac.id/id/eprint/5900 |
Actions (login required)
 |
View Item |