Fadilah., Sania Nur and Dr. Ir. Joni Kusnadi, M.Si and Dr. Ir. Sesanti Basuki, M. Phil (2020) Analisis Kekerabatan Pada Plasma Nutfah Wijen (Sesamum indicum) Menggunakan Marka Inter Simple Sequence Repeat (ISSR). Sarjana thesis, Universitas Brawijaya.
Abstract
Plasma nutfah wijen (Sesamum indicum) di Indonesia sangat beragam dengan karakteristik morfologi yang terlihat sama. Karakteristik morfologi dapat dipengaruhi oleh lingkungan sehingga menghasilkan inkonsistensi data. Analisis kekerabatan dapat dilakukan berdasarkan penanda genetik seperti Inter Sequence Simple Repeats (ISSR). Tujuan : Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui hubungan kekerabatan genetik dari 81 aksesi tanaman wijen menggunakan marka ISSR. Metode : Metode yang digunakan adalah deskriptif kualitatif dengan sampel 81 aksesi wijen yang dianalisis menggunakan tiga primer ISSR yaitu I2, T21, T22 dan satu primer RAPD sebagai pembanding yaitu S1. Skoring pita DNA dilakukan berdasarkan hasil amplifikasi dan dianalisa menggunakan metode Unweighted Pair-Group Method Arithmetic Averages (UPGMA). Hasil : Data hasil analisis menghasilkan 300 pita DNA yang 100% merupakan pita polimorfik. Dendogram hasil kekerabatan menunjukan bahwa 81 aksesi wijen dikelompokkan menjadi 2 kelompok dengan koefisien similaritas yang tinggi yaitu pada kisaran 0,56 hingga 1,00. Aplikasi : Marka ISSR dapat digunakan untuk mengidentifikasi kekerabatan plasma nutfah wijen dan dapat memberikan informasi yang berguna untuk program pemuliaan tanaman wijen dan pengelolaan plasma nutfah wijen.
English Abstract
Sesame (Sesamum indicum) germplasm in Indonesia is very diverse with morphological characteristics that looks the same. Morphological characteristic are affected by the environment that oftenly resulted into data inconsistencies. Analysis of genetic relationship can be done based on genetic markers such as Inter Simple Sequence Repeats (ISSR). Objective : The purpose of this study was to determine the genetic relationship between 81 accessions of sesame plants using ISSR markers. Method : The method used in this study is descriptive qualitative with a sample of a 81 sesame accessions were analyzed using three ISSR primers namely I2, T21, T22 and one RAPD primer as a comparison namely S1. DNA bands scoring is based on the results of amplification and analyzed using the UPGMA (Unweighted Pair-Group Method Arithmetic Averages) method. Result : The analysis produced 300 DNA bands which 100 % are polymorphic bands. Dendogram of genetic relationship results shows that 81 sesame accessions are grouped into 2 groups with a high similarity coefficient that is in the range 0,56 to 1,00. Application : ISSR markers can be used to identify sesame germplasm diversity and can provide useful information for sesame breeding and sesame germplasm management programs.
| Item Type: | Thesis (Sarjana) |
|---|---|
| Identification Number: | 0520100146 |
| Uncontrolled Keywords: | ISSR, Kekerabatan, Wijen, ISSR, Genetic Relationship, Sesame |
| Subjects: | 300 Social sciences > 338 Production > 338.1 Agriculture > 338.16 Production efficiency |
| Divisions: | Fakultas Teknologi Pertanian > Teknologi Hasil Pertanian |
| Depositing User: | Zainul Mustofa |
| Date Deposited: | 12 Jul 2022 04:57 |
| Last Modified: | 03 Oct 2024 07:27 |
| URI: | http://repository.ub.ac.id/id/eprint/191939 |
![[thumbnail of Sania Nur Fadilah.pdf]](http://repository.ub.ac.id/style/images/fileicons/text.png) |
Text
Sania Nur Fadilah.pdf Download (2MB) |
Actions (login required)
 |
View Item |