Analisis Filogenetik Pada Plasma Nutfah Tembakau (Nicotiana Tabacum) Menggunakan Marka Inter Simple Sequence Repeats (ISSR)

Fahira, Vena Megan and Dr. Ir. Joni Kusnadi, M. Si and Dr. Ir. Sesanti Basuki, M. Phi (2020) Analisis Filogenetik Pada Plasma Nutfah Tembakau (Nicotiana Tabacum) Menggunakan Marka Inter Simple Sequence Repeats (ISSR). Sarjana thesis, Universitas Brawijaya.

Abstract

Plasma nutfah adalah koleksi sumber daya genetik, berupa keanekaragaman tumbuhan, hewan, dan mikroorganisme; merupakan sumber sifat yang diturunkan dan modal dasar dalam program pemuliaan. Plasma nutfah tembakau di Balai Penelitian Tanaman Pemanis dan Serat (Balittas) dikonservasi berupa benih kering (ortodok), diluar habitat aslinya (ex situ). Salah satu upaya untuk menggali informasi tentang keragaman genetik dari plasma nutfah yang dikoleksi secara ex situ adalah melalui analisis filogenetik berdasarkan marka DNA, salah satunya marka Inter Simple Sequence Repeats (ISSR). Tujuan : Tujuan penelitian ini diharapkan dapat mengetahui keberagaman genetik dari 120 aksesi plasma nutfah tembakau menggunakan marka Inter Simple Sequence Repeats (ISSR). Metode : Metode yang digunakan adalah deskriptif kualitatif dengan 120 sampel tembakau yang di analisis menggunakan 3 primer ISSR yaitu I1, I2, dan I7. Skoring pita dianalisa menggunakan metode UPGMA. Hasil : Data hasil analisis menghasilkan pola pita DNA sebanyak 747 yang 100% merupakan pita polimorfik. Pohon filogenik pada setiap primer menunjukkan bahwa 120 aksesi tembakau memiliki tingkat koefisien sedang. Aplikasi : Marka ISSR dapat digunakan untuk mengidentifikasi pengelompokan plasma nutfah tembakau dengan seleksi yang ketat dan dapat digunakan untuk pengelolaan plasma nutfah tembakau dan program pemuliaan tanaman tembakau

English Abstract

Germplasm is a collection of genetic resources, in the form of diversity of plants, animals and microorganisms; is a source of inherited traits and basic capital in breeding programs. Tobacco germplasm in Balai Tanaman Pemanis dan Serat (Balittas) is conserved in the form of dry seeds (orthodox), outside their natural habitat (ex situ). One of the efforts to gather information about the genetic diversity of germplasm collected ex situ is through phylogenetic analysis based on DNA markers, one of which is the Inter Simple Sequence Repeats (ISSR) markers. Objectiv : The purpose of this study is expected to determine the genetic diversity of 120 accessions of tobacco germplasm using the Inter Simple Sequence Repeats (ISSR) markers. Method : The method used in this study is descriptive qualitative with a sample of a 120 tobacco accessions were analyzed using 3 ISSR primers, namely I1, I2, and I7. The band scoring was analyzed using the UPGMA method. Result : The data from the analysis resulted in a DNA band pattern of 747 which was 100% polymorphic. The phylogenic tree in each primer shows that 120 tobacco accessions have a moderate coefficient level. Application : ISSR markers can be used to identify selectively selected tobacco germplasm groupings and can be used for tobacco germplasm management and tobacco plant breeding programs

Item Type:	Thesis (Sarjana)
Identification Number:	0520100024
Uncontrolled Keywords:	Tembakau, Plasma Nutfah, ISSR, Keragaman Genetik, Tobacco, Germplasm, ISSR, Genetic Diversity
Subjects:	300 Social sciences > 338 Production > 338.1 Agriculture > 338.16 Production efficiency
Divisions:	Fakultas Teknologi Pertanian > Teknologi Hasil Pertanian
Depositing User:	Zainul Mustofa
Date Deposited:	04 Jul 2022 07:34
Last Modified:	03 Oct 2024 07:36
URI:	http://repository.ub.ac.id/id/eprint/191482

Text Vena Megan Fahira.pdf Download (5MB)

Actions (login required)

View Item