Fatimah, AiImasFaidoh (2012) Highly Sensitive DNA Hybridization Detection Based On Au-Capsule Electrochemical Label. Magister thesis, Universitas Brawijaya.
Abstract
Sejumlah besar nanopartikel emas (AUNPS) dimuat ke dalam mikrokapsul polielektrolyte untuk digunakan sebagai label elektrokimia dalam deteksi hibridisasi DNA. Mikrokapsul polielektrolyte disiapkan oleh perakitan layay-by-layer alternatif dari templat polielektrolit yang dikenakan berlawanan ke inti yang diikuti dengan melepas inti menghasilkan kapsul berongga. Porositas mikrokapsul diatur oleh pH yang memanipulasi dengan menggunakan poli bermuatan positif (allyamine) (PAA). AUNPS bermuatan negatif (diameter ~ 4,89 ± 0,67 nm) dapat diambil oleh daya tarik elektrostatik, menghasilkan sekitar. 5.11 x 10 8 ± 0,65 x 10 8 AU 3+ Molekul per kapsul, yang merupakan salah satu urutan besarnya lebih tinggi bila dibandingkan dengan laporan sebelumnya pemuatan AUNKS ke operator lateks. Deteksi hibridisasi DNA dilakukan dengan menggunakan probe loop stem tunggal di mana salah satu ujung loop probe ditandai dengan kapsul emas dan ujung lainnya dengan biotin. Setelah mengikat dengan DNA target, loop dapat diluruskan, sehingga memungkinkan keterkaitan dari biotin ke elektroda cetak layar yang dilapisi Avidin. Akibatnya, AUNPS kemudian dapat diukur menggunakan voltametri stripping anodik diferensial dengan kondisi yang dioptimalkan (I.E. E DEP = -0.6 V, T dep = 300 S, V = 30 mV S -1). Waktu dan suhu hibridisasi juga dioptimalkan dan ditemukan pada 30 menit dan 25 ° C. Hal ini menyebabkan keberhasilan kami mendeteksi urutan 30-Mer yang umum untuk E. coli pada usia 138 pagi.
English Abstract
A large number of gold nanoparticles (AuNPs) were loaded into polyelectrolyte microcapsules for use as electrochemical labels in DNA hybridization detection. The polyelectrolyte microcapsule was prepared by alternate layer-by-layer assembly of oppositely charged polyelectrolyte templates onto a charged core followed by removing the core resulted hollow capsule. The porosity of microcapsule is governed by pH manipulating by using positively charged poly(allylamine) (PAA). Negatively charged AuNPs (diameter ~ 4.89 ± 0.67 nm) can be taken up by the electrostatic attraction, resulting in approx. 5.11 x 10 8 ± 0.65 x 10 8 Au 3+ molecules per capsule, which is one order of magnitude higher when compared to the previous report of loading AuNPs onto the latex carrier. The DNA hybridization detection was performed by using a single stem-loop probe where one end of the loop probe was tagged with the gold capsule and the other end with biotin. After binding with the target DNA, the loop can straightened out, thus enabling the linkage of the biotin to avidin-coated screen printed electrode. As a result, the AuNPs could then be measured using differential pulse anodic stripping voltammetry under the optimized conditions (i.e. E dep = −0.6 V, t dep = 300 s, v = 30 mV s -1 ). The hybridization time and temperature were also optimized and found to be at 30 min and 25 °C, respectively. This led to our successful detection of a 30-mer sequence common to E. coli at down to 138 aM.
| Item Type: | Thesis (Magister) |
|---|---|
| Identification Number: | TES/572.86/FAT/h/041201273 |
| Subjects: | 500 Natural sciences and mathematics > 572 Biochemistry > 572.8 Biochemical genetics |
| Divisions: | S2/S3 > Magister Teknologi Hasil Pertanian, Fakultas Teknologi Pertanian |
| Depositing User: | Endro Setyobudi |
| Date Deposited: | 16 Aug 2012 13:44 |
| Last Modified: | 16 Aug 2012 13:44 |
| URI: | http://repository.ub.ac.id/id/eprint/157702 |
Actions (login required)
 |
View Item |