Rifai, Muhammad Sofyan (2017) Isolasi Dan Identifikasi Molekuler Bakteri Sedimen Perairan Pantai Sarang Rembang Penghasil Enzim Gelatinase. Sarjana thesis, Universitas Brawijaya.
Abstract
Enzim gelatinase adalah suatu enzim yang dihasilkan oleh bakteri yang bermanfaat dalam menguraikan gelatin. Nama lain dari enzim gelatinase adalah pepsin B, parapepsin, gelatinase A/B, matrix metallo proteinase, collagenase dan collagen metallo proteinase. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan spesies bakteri sedimen perairan Pantai Sarang Rembang dan mengetahui sejauh mana bakteri dapat menghasilkan enzim gelatinase. Metode penelitian yang digunakan adalah deskriptif eksploratif yang dilakukan dalam 2 tahapan. Tahap pertama yaitu menemukan bakteri yang dapat menghasilkan enzim gelatinase dari bakteri sedimen pesisir yaitu isolasi dan skrining bakteri. Tahap kedua yaitu mengidentifikasi bakteri penghasil enzim gelatinase berdasarkan uji 16s rDNA. Hasil skrining bakteri menunjukan 3 isolat bakteri yang menghasilkan enzim gelatinase, dan diperoleh hasil terbaik pada isolat bakteri Y dengan ciri-ciri bakteri menghasilkan enzim gelatinase yang ditunjukan dengan kondisi media yang masih cair ketika disimpan pada suhu rendah maupun suhu ruang. Sehingga isolat bakteri Y digunakan untuk identifikasi secara molekuler berdasarkan gen 16S rDNA. Data sekuen 16S rDNA isolat uji kemudian dibandingkan dengan data sekuen 16S rDNA bakteri yang diperoleh dari bank data sekuen DNA di NCBI. Hasil penelitian menunjukkan bahwa konfirmasi BLAST dari isolat bakteri yang diuji mempunyai query cover sebesar 100% dan identity sebesar 99% hal ini menunjukkan bahwa isolat bakteri tersebut adalah Proteus penneri dengan strain berbeda dan diberi nama Proteus penneri UB-11.
English Abstract
Enzyme gelatinase is an enzyme that produced by the bacterium has beneficial for gelatin. Another name of an enzyme gelatinase is pepsin B, parapepsin, gelatinase A / B, the matrix metalloproteinase, proteinase collagenase and collagen metalloproteinase. This study attempts to get a species of bacterium sediment coastal waters the Rembang nests and understand the extent of bacteria can gelatinase producing enzymes. Research methods that were used are descriptive explorative have done stage 2.The first phase that a bacterium that can produce enzymes gelatinase from bacteria sediment coastal namely isolation and screening bacteria.The second phase is identification bacteria producing an enzyme gelatinase based on the 16s rDNA. The results of screening bacteria showed 3 isolates bacteria that produce enzymes gelatinase, and the results best in isolates bacteria Y with the characteristics of bacteria producing an enzyme gelatinase indicated with the condition of the media still liquid when stored at low temperatures and room temperature.So that isolates bacteria he used to identify molecular based on genes 16s rDNA. Data sequence 16s rDNA isolates test is compared with the data sequence 16s rDNA bacteria obtained from gen bank a DNA sequence in NCBI. The research results showed that confirmation blast of isolates bacteria that tested have query cover equal to 100% and identity at 99% this indicates that isolates the bacteria is Proteus penneri with strain differing and named Proteus penneri UB-11.
| Item Type: | Thesis (Sarjana) |
|---|---|
| Identification Number: | SKR/FPR/2017/1102/051800153 |
| Uncontrolled Keywords: | Sedimen pantai, Gelatinase , 16S rDNA, Proteus penneri, Coastal Sediment, Gelatinase , 16S rDNA, Proteus penneri |
| Subjects: | 500 Natural sciences and mathematics > 577 Ecology > 577.5 Ecology of miscellaneous environments > 577.51 Coastal Ecology |
| Divisions: | Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan > Manajemen Sumberdaya Perairan |
| Depositing User: | Nur Cholis |
| Date Deposited: | 16 Jan 2018 02:02 |
| Last Modified: | 13 Dec 2020 07:50 |
| URI: | http://repository.ub.ac.id/id/eprint/8066 |
Actions (login required)
 |
View Item |