Utami, Ristanti Putri (2017) Analisa Gen Tlr9 Dan Konfirmasi Protein Tlr9 Pada Gajah Sumatera (Elephas maximus sumatranus) Di Taman Safari Indonesia 2 Prigen. Sarjana thesis, Universitas Brawijaya.
Abstract
TLR9 (Toll-like Receptors 9) merupakan salah satu anggota dari kelompok TLRs (Toll-like Receptors) berupa protein yang memiliki fungsi sebagai reseptor suatu patogen pada individu. TLR9 merupakan protein yang dikode oleh gen TLR9, berlokasi dibagian intraseluler tepatnya dalam endosom. Analisa TLR9 sangat penting dilakukan untuk mengetahui apakah suatu individu terinfeksi oleh suatu penyakit. Misalnya pada Gajah Sumatera yang bisa terserang oleh penyakit EEHV (Elephant Endothelial Herpes Virus) merupakan penyakit spesifik yang menginfeksi gajah. Analisa gen TLR9 pernah dilakukan pada Gajah Afrika, sehingga penelitian TLR9 pada Gajah Sumatera perlu dilakukan. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisa gen TLR9 berdasarkan sekuen gen dan mengkonfirmasi protein TLR9 pada Gajah Sumatera menggunakan sampel darah dari Gajah Sumatera. Analisa gen dilakukan dengan metode Polymerase Chain Reaction (PCR) menggunakan primer forward (TLR9_F) 5’-GAACTA TCCCTGCCACATGA-3’ dan primer reverse (TLR9_R) 5’-CGTGCACGGAT TCTTGTAGT-3’ sedangkan analisa protein dilakukan dengan melihat profil protein menggunakan metode SDS-PAGE selanjutnya dihitung berat molekul dengan menggunakan rumus Retardation factor (Rf) dan kemudian dianalisa secara deskriptif. Hasil penelitian analisa gen TLR9 menunjukkan terdapat perbedaan sekuen DNA antara Gajah Afrika dan Gajah Sumatera pada urutan basa 1.429 dimana sitosin (C) menjadi timin (T). Hasil analisa profil protein menunjukkan adanya pita protein dengan berat molekul sebesar 116,19 kDa yang ditemukan pada protein yang diisolasi dari darah Gajah Sumatera yang diduga merupakan protein dari TLR9.
English Abstract
TLR9 (Toll-like Receptors 9) is a member of the TLRs (Toll-like Receptors) group of proteins that have function as a receptor for pathogen in human and animals. TLR9 is a protein that encoded by TLR9 gene, located in the intracellular region of the endosome. Analysis of TLR9 is very important to know if an individual is infected by diseases. For example, the Sumateran Elephant that can be attacked by EEHV (Elephant Endothelial Herpes Virus) is specific disease that infects to elephants. The TLR9 gene analysis was performed on the African Elephant, therefore the TLR9 study on the Sumateran Elephant needs to be done. This study was aimed to analyze the TLR9 gene based on gene sequences and confirm TLR9 protein in Sumateran Elephants using blood samples from Sumateran Elephants. The gene were analyzed using Polymerase Chain Reaction (PCR) method with primers forward (TLR9_F) 5’-GAACTATCCCTGCCACATGA-3’ and reverse (TLR9_R) 5’-CGTGCACGGATTCTTGTAGT-3’ and protein analysis was performed by looking at protein profile using SDS-PAGE method then calculated using Retardation factor (Rf) formula and the analyzed descriptively. The result showed there is a difference in DNA sequence between African Elephants and Sumateran Elephants in the order of 1.429 bases wherein cytosine (C) becomes thymine (T). The result of protein profile showed the expression of protein band with molecular weight 116,19 kDa that found in Sumateran Elephant which assumed as TLR9 protein.
| Item Type: | Thesis (Sarjana) |
|---|---|
| Identification Number: | SKR/FKH/2017/139/051709460 |
| Uncontrolled Keywords: | TLR9, Gajah Sumatera, PCR, SDS-PAGE |
| Subjects: | 600 Technology (Applied sciences) > 636 Animal husbandry > 636.08 Specific topics in animal husbandry > 636.089 Veterinary medicine |
| Divisions: | Fakultas Kedokteran Hewan > Kedokteran Hewan |
| Depositing User: | Yusuf Dwi N. |
| Date Deposited: | 18 Oct 2017 03:55 |
| Last Modified: | 28 Dec 2020 12:30 |
| URI: | http://repository.ub.ac.id/id/eprint/3921 |
Actions (login required)
 |
View Item |