Potensi Senyawa Binahong (Anredera cordifolia) Sebagai Inhibitor Metastasis Sel Kanker Payudara Target MMP-2 Secara In Silico

Ilmiyah, Silvi Zakiyatul and Agustina Tri Endharti, S.Si, Ph.D, and Drs. Sofy Permana, M.Sc., D.Sc. (2024) Potensi Senyawa Binahong (Anredera cordifolia) Sebagai Inhibitor Metastasis Sel Kanker Payudara Target MMP-2 Secara In Silico. Magister thesis, Universitas Brawijaya.

Abstract

Kanker payudara merupakan jenis kanker yang dominan terjadi pada wanita dengan persentase tertinggi. Kanker payudara adalah pertumbuhan sel abnormal yang melapisi saluran dan lobulus payudara. Klasifikasi kanker payudara didasarkan pada asal sel kanker dari saluran atau lobulus, invasif atau non-invasif, dan penampakan mikroskopis kanker. Saat ini banyak penelitian mengenai target terapi kanker payudara, salah satunya adalah MMP-2. MMP-2 merupakan protein heterodimerik yaitu protein MMP-2 yang sangat diekspresikan dalam sirkulasi sel tumor pasien karsinoma pankreas, sehingga menjadi target potensial untuk terapi kanker payudara. Binahong (Anredera cordifolia) merupakan tanaman yang mempunyai khasiat obat untuk berbagai penyakit karena mengandung saponin, alkoloid dan flavonoid untuk antikanker khususnya pada kanker payudara. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui potensi senyawa daun binahong sebagai kandidat obat dalam afinitas pengikatannya dalam menghambat jalur metastasis protein MMP-2 kanker payudara. Metode yang digunakan adalah pengujian LCMS, screening senyawa dan preparasi ligan, analisis ADMET, analisis interaksi jaringan jalur protein, docking molekuler dan dinamika molekuler. Hasil penelitian ini adalah saponin berdasarkan analisis LC-MS memiliki komponen massa yang paling tinggi diantara senyawa target lain, 6 senyawa dalam binahong (Anredera cordifolia) yang didocking dengan protein MMP-2 menunjukkan hasil tertinggi yaitu senyawa saponin dengan nilai afinitas pengikatan -10, Asam ursolat -9,1, Vitexin - 8,8 . Dinamika molekul rata-rata semua senyawa berada pada grafik stabil yaitu 1- 3 Å. Kesimpulan penelitian ini menunjukkan bahwa senyawa dalam ekstrak binahong (Anredera cordifolia) mampu berikatan baik dengan protein MMP-2.

English Abstract

Breast cancer is the dominant type of cancer that occurs in women with the highest percentage. Breast cancer is the growth of abnormal cells that line the ducts and lobules of the breast. Classification of breast cancer is based on the origin of the cancer cells from the ducts or lobules, invasive or non-invasive, and the microscopic appearance of the cancer. Currently, there is a lot of research regarding breast cancer therapy targets, one of which is MMP-2. MMP-2 is a heterodimeric protein, namely the MMP-2 protein which is highly expressed in circulating tumor cells of pancreatic carcinoma patients, making it a potential target for breast cancer therapy. Binahong (Anredera cordifolia) is a plant that has medicinal properties for various diseases, including saponins, alkoloids and flavonoids for anticancer, especially breast cancer. The aim of this research is to determine the potential of binahong leaf compounds as drug candidates in terms of their binding affinity in inhibiting the breast cancer MMP-2 protein metastasis pathway. The methods used are LC-MS testing, compound screening and ligand preparation, ADMET analysis, protein pathway network interaction analysis, molecular docking and molecular dynamics. The results of this research are that saponins based on LC-MS analysis have the highest mass component among other target compounds, 6 compounds in binahong (Anredera cordifolia) docked with MMP-2 protein show the highest results, namely saponin compounds with a binding affinity value of -10, Ursolid acid -9.1, Vitexin -8.8 . The average molecular dynamics of all compounds is on a stable graph, namely 1-3 Å. The conclusion of this study shows that the compounds in binahong (Anredera cordifolia) extract are able to bind well to the MMP-2 protein.

Item Type:	Thesis (Magister)
Identification Number:	0424060107
Divisions:	S2/S3 > Magister Ilmu Biomedis, Fakultas Kedokteran
Depositing User:	Unnamed user with username nova
Date Deposited:	22 Oct 2024 02:29
Last Modified:	22 Oct 2024 02:29
URI:	http://repository.ub.ac.id/id/eprint/231889

Text (DALAM MASA EMBARGO) Silvi Zakiyatul Ilmiyah.pdf Restricted to Registered users only Download (5MB)

Actions (login required)

View Item