Perbandingan Ekstraksi DNA Metode Manik-Manik Magnetik Silika dan Spin Column Berbasis Kertas Saring Untuk Deteksi Spesies Tikus (Rattus norvegicus) Menggunakan Real Time-PCR

Fitriya, Balqis Az Zahro and Prof. Dr. Ir. Yunianta, DEA and Dr. Ir. Joni Kusnadi, M.Si (2024) Perbandingan Ekstraksi DNA Metode Manik-Manik Magnetik Silika dan Spin Column Berbasis Kertas Saring Untuk Deteksi Spesies Tikus (Rattus norvegicus) Menggunakan Real Time-PCR. Sarjana thesis, Universitas Brawijaya.

Abstract

Indonesia merupakan negara dengan mayoritas penduduk beragama Islam mencapai 82,07%. Data tersebut menunjukkan bahwa kebutuhan akan makanan Halal menjadi syarat mutlak. Pemerintah Indonesia telah Undang-Undang Republik Indonesia Nomor 33 Tahun 2014 tentang Jaminan Produk Halal. Adanya peraturan perundangan mampu memberikan tingkat kepercayaan masyarakat terhadap produk makanan yang beredar. Namun masih ditemukan kasus adulterasi utamanya pada produk daging olahan. Contoh adulterasi pada daging olahan adalah bakso sapi dengan mengganti bahan baku daging menggunakan daging tikus. Dari kasus adulterasi tersebut, maka perlu dilakukan tindakan pencegahan berupa deteksi adulterasi. Real Time-PCR merupakan teknik biologi molekuler sintesis enzimatik dan amplifikasi fragmen DNA tertentu secara in vitro dengan tingkat sensitivitas tinggi. Untuk mendapatkan hasil analisis PCR yang baik perlu memperhatikan faktor ekstraksi DNA. Tujuan penelitian ini untuk membandingkan dua metode ekstraksi DNA untuk analisis spesies tikus Rattus norvegicus menggunakan Real Time-PCR. Pada penelitian ini ekstraksi DNA diakukan menggunakan dua metode yaitu manik-manik magnetik silika dan spin column berbasis kertas saring, dilanjutkan dengan amplifikasi menggunakan Real Time-PCR. Hasil penelitian menunjukkan ekstraksi DNA metode spin column berbasis kertas saring lebih baik daripada metode manik-manik magnetik silika dengan konsentrasi dan kemurnian DNA terbaik masing-masing 21,20 ng/μL dan 1,96. Pada pengujian Real Time-PCR menunjukkan nilai Ct dari kedua metode ekstraksi DNA masing-masing memiliki rata-rata 15,53 dan 16,59

English Abstract

Indonesia is a country with a majority Muslim population reaching 82.07%. This data shows that the need for Halal food is an absolute requirement. The Indonesian government has Law of the Republic of Indonesia Number 33 of 2014 concerning Halal Product Guarantees. The existence of legal regulations is able to provide a level of public trust in the food products in circulation. However, cases of adulteration are still found, especially in processed meat products. An example of adulteration in processed meat is beef meatballs by replacing the raw meat with rat meat. In cases of adulteration, it is necessary to take preventive measures in the form of detecting adulteration. Real Time-PCR is a molecular biology technique of enzymatic synthesis and amplification of certain DNA fragments in vitro with a high level of sensitivity. To get good PCR analysis results, there need to pay attention to DNA extraction factors. The aim of this study was to compare two DNA extraction methods for analysis of the rat species Rattus norvegicus using Real Time-PCR. In this study, DNA extraction was carried out using two methods, namely silica magnetic beads and filter paper-based spin columns, then amplified using Real Time-PCR. The results showed that the filter paper-based spin column method of DNA extraction was better than the silica magnetic bead method with the best DNA concentration and purity obtained is 21.20 ng/μL and 1.96. Real Time-PCR testing shows that the Ct values from the two DNA extraction methods have an average of 15.53 and 16.59, respectively.

Item Type:	Thesis (Sarjana)
Identification Number:	0524100252
Uncontrolled Keywords:	Ekstraksi DNA, Manik-Manik Magnetik Silika, Real Time-PCR, Spin Column, Tikus Rattus norvegicus-DNA Extraction, Rattus norvegicus, Real Time-PCR, Silica Magnetic Beads, Spin Column
Divisions:	Fakultas Teknologi Pertanian > Keteknikan Pertanian
Depositing User:	soegeng sugeng
Date Deposited:	19 Nov 2024 04:16
Last Modified:	19 Nov 2024 04:16
URI:	http://repository.ub.ac.id/id/eprint/228901

Text (DALAM MASA EMBARGO) Balqis Az Zahro Fitriya.pdf Restricted to Registered users only Download (1MB)

Actions (login required)

View Item