Analisis Polimorfisme Gen GH dengan Metode PCR-RFLP dan Asosiasinya dengan Sifat Pertumbuhan pada Ayam Sentul Arab dan Ayam Merawang Arab

Irmaya. H, Dika and Prof. Dr. Sc. Agr. Ir. Suyadi, MS, IPU., ASEAN Eng. and Prof. Dr. Ir. Depison, M.P. (2024) Analisis Polimorfisme Gen GH dengan Metode PCR-RFLP dan Asosiasinya dengan Sifat Pertumbuhan pada Ayam Sentul Arab dan Ayam Merawang Arab. Magister thesis, Universitas Brawijaya.

Abstract

Penduduk Indonesia dari tahun ke tahun terus bertambah sehingga perlu diiringi dengan peningkatan produktivitas ternak melalui seleksi ataupun persilangan, dengan harapan mampu menggabungkan masing-masing keunggulan dari tetuanya untuk menghasilkan keturunan yang unggul. Penelitian ini dilakukan untuk mengkaji keragaman fenotipik dan genotipik pada ayam Sentul Arab dan ayam Merawang Arab. Materi yang digunakan adalah masing-masing 50 ekor ayam Sentul Arab dan ayam Merawang Arab pada umur 3 bulan. Metode yang digunakan adalah observasi dan teknik pengambilan sampel yaitu purposive sampling. Penelitian dilakukan di Fakultas peternakan Universitas Jambi dan Laboratorium Bioteknologi Fakultas Peternakan Universitas Brawijaya. Data ukuran tubuh dianalisis menggunakan korelasi Pearson, regresi linear berganda dan analisis komponen utama. Analisis data menggunakan software SPSS version 27. Hasil penelitian keragaman fenotipik menunjukkan nilai korelasi tertinggi pada ayam Sentul Arab adalah lingkar shank, sedangkan pada ayam Merawang Arab adalah panjang dada. Bobot badan dan ukuran tubuh ayam Sentul Arab maupun Merawang Arab memiliki koefisien regresi positif atau mempunyai hubungan yang positif. Analisis komponen utama menunjukkan nilai tertinggi pada PC1 ayam Sentul Arab adalah Panjang shank, sedangkan pada ayam Merawang Arab adalah Panjang dada. Hasil penelitian genotipik menunjukkan bahwa DNA yang diekstraksi memiliki kualitas yang baik, dikarenakan tidak terdapat kontaminasi dari protein, larutan fenol, maupun RNA. Pita DNA yang jelas dan terang, yang menandakan hasil uji kualitatif bernilai positif. Ayam Sentul Arab dan ayam Merawang Arab tidak menunjukkan adanya keragaman genetik atau memiliki sifat monomorfik dengan 100% memiliki genotype AA pada lokus GH-HaeIII dan TT pada lokus GH-Msp1. Tidak terdapat asosiasi sifat pertumbuhan dengan polimorfisme genetik gen GH pada ayam Sentul Arab dan ayam Merawang Arab. Artinya, gen GH pada ayam Sentul Arab dan ayam Merawang Arab tidak dapat dijadikan sebagai gen kandidat dalam Marker Assisted Selection (MAS) untuk sifat pertumbuhan.

English Abstract

Indonesia's population continues to increase from year to year. Hence, this needs to be accompanied by increasing livestock productivity through selection or crossing, hoping to combine each parent's advantages to produce superior offspring. This research examined the phenotypic and genotypic diversity of Sentul Arabian chickens and Merawang Arabian chickens. The material used was 50 Sentul Arabian chickens and Merawang Arabian chickens, each at the age of 3 months. The method used is observation, and the sampling technique is purposive sampling. The research was at the Faculty of Animal Science, Universitas Jambi and the Biotechnology Laboratory, Faculty of Animal Science, Universitas Brawijaya. Body size data were analyzed using Pearson correlation, multiple linear regression and principal component analysis. Data analysis used SPSS version 27 software. The research on phenotypic diversity showed that the highest correlation value in Sentul Arabian chickens was shank circumference, while in Merawang Arabian chickens, it was chest length. The body weight and body size of Sentul Arabian and Merawang Arabian chickens have a positive regression coefficient or have a positive relationship. Principal component analysis shows that the highest value for PC1 for Sentul Arabian chickens is shanked length, while for Arabian Merawang chickens, it is breast length. The results of the genotypic research showed that the extracted DNA was of good quality because there was no contamination from protein, phenol solution, or RNA. A clear and bright DNA band indicates a positive qualitative test result. Arabian Sentul chickens and Arabian Merawang chickens do not show any genetic diversity or have monomorphic traits, with 100% having the genotype AA at the GH-HaeIII locus and TT at the GH-Msp1 locus. There was no association of growth traits with genetic polymorphisms of the GH gene in Sentul Arabian chickens and Merawang Arabian chickens, which means that the GH gene in Sentul Arabian and Arabian Merawang chickens couldn't used as a candidate gene in Marker Assisted Selection (MAS) for growth traits.

Item Type:	Thesis (Magister)
Identification Number:	0424050014
Uncontrolled Keywords:	Ayam lokal, bobot badan, gen GH, Persilangan, Ukuran-ukuran tubuh
Divisions:	S2/S3 > Magister Ilmu Ternak, Fakultas Peternakan
Depositing User:	Unnamed user with username nova
Date Deposited:	08 May 2024 04:33
Last Modified:	08 May 2024 04:33
URI:	http://repository.ub.ac.id/id/eprint/218320

Text (DALAM MASA EMBARGO) Dika Irmaya.pdf Restricted to Registered users only Download (4MB)

Actions (login required)

View Item