Studi In Silico Aktivitas Antibakteri dan Prediksi Profil Farmakokinetik (ADME-T) Senyawa Brazilein pada Kayu Secang (Caesalpinia sappan L.) Terhadap Bakteri Streptococcus mutans

Sunarto, Laurentia Monica Hysinta. and Prof. Dr. Dra. apt. Sri Winarsih, M.Si. and apt. Uswatun Khasanah, S.Farm.,M.,Farm. (2021) Studi In Silico Aktivitas Antibakteri dan Prediksi Profil Farmakokinetik (ADME-T) Senyawa Brazilein pada Kayu Secang (Caesalpinia sappan L.) Terhadap Bakteri Streptococcus mutans. Sarjana thesis, Universitas Brawijaya.

Abstract

Karies gigi merupakan salah satu masalah kesehatan pada area gigi dan mulut yang hampir di alami setengah dari populasi penduduk di dunia yakni 3,58 milyar jiwa, salah satu pemicu terjadinya karies gigi adalah bakteri Streptococcus mutans. Usaha untuk mengontrol adanya plak gigi dapat dilakukan menggunakan obat kumur atau pasta gigi dan terapi yang digunakan yakni klorheksidin dan xylitol sedangkan ada beberapa tanaman yang mempunyai aktivitas sebagai antibakteri salah satunya kayu secang dengan salah satu senyawa aktifnya adalah brazilein. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui kelayakan senyawa brazilein untuk dapat dijadikan kandidat terapi obat oral atau obat kumur pada karies gigi. Penelitian ini merupakan eksperimental menggunakan metode docking yang dibantu dengan komputer. Pada reseptor dan ligan terlebih dahulu dilakukan validasi nilai RMSD dengan parameter kurang dari 2 A, selanjutnya dilakukan visualisasi ikatan antara residu asam amino dan ligan, analisis druglikeness, dan analisis sifat farmakokinetika (ADME�T). Hasil penelitian menunjukkan dari docking senyawa brazilein mempunyai nilai binding affinity paling kecil pada protein glucan binding protein -8,3 kcal/mol sedangkan untuk ligan kontrol (klorheksidin) -9,4 kcal/mol dan untuk ligan kontrol (xylitol) -5,2 kcal/mol. Pada hasil analisis interaksi senyawa brazilein dan target protein menunjukkan bahwa senyawa brazilein mampu bekerja pada sisi aktif aktif target protein dan mampu berinteraksi dengan baik, hasil analisis dari Druglikeness juga menunjukkan bahwa senyawa brazilein telah memenuhi persyratan Lipinski Rule of five sedangkan hasil sifat farmakokinetika (ADME-T) menunjukkan bawa senyawa brazilein mampu diserap baik oleh usus, terdistribusi secara merata, tidak ada hambatan pada enzim CYP450 dan mempunyai sifat toksisitas yang rendah.

English Abstract

Dental caries is one of the health problems in the dental and oral area, which is almost experienced by half of the world's population of 3.58 billion people. One of the triggers for dental caries is the bacterium Streptococcus mutans. Efforts to control the presence of dental plaque can be made using mouthwash or toothpaste; the therapy used is chlorhexidine and xylitol. At the same time, some plants have antibacterial activity, one of which is secang wood, with one of the active compounds is brazilein. This study aims to determine the feasibility of using brazilein compounds as therapeutic candidates for oral drugs or mouthwashes in dental caries. This research is experimental using a computer�aided docking method. At receptors and ligands, RMSD value validation with parameters less than 2 A was first carried out, then visualization of the bond between amino acid residues and ligands, drug-likeness analysis, and pharmacokinetic properties analysis (ADME-T). The results showed that from docking, brazilein compounds had the smallest affinity binding value in glucan protein-binding proteins of -8.3 kcal/mol, while for control ligands (chlorhexidine) - 9.4 kcal/mol and control ligands (xylitol) -5.2 kcal/mol. The results of the analysis of the interaction of brazilein compounds and protein targets showed that brazilein compounds could work on the active site of the protein target and can interact well; the results of the analysis of Druglikeness also show that brazilein compounds have met the requirements of the Lipinski Rule of five while the effects of pharmacokinetic properties (ADME-T) show that brazilein compounds can be absorbed well by the intestines, evenly distributed, there is no resistance to the CYP450 enzyme and has low toxicity properties.

Item Type:	Thesis (Sarjana)
Identification Number:	052206
Uncontrolled Keywords:	Karies gigi, Brazilein, Streptococcus mutans, In Silico, Druglikeness, ADME-T , Dental caries, Brazilein, Streptococcus mutans, In Silico, Druglikeness, ADME-T
Subjects:	600 Technology (Applied sciences) > 615 Pharmacology and therapeutics > 615.1 Drugs (materia medica)
Divisions:	Fakultas Kedokteran > Farmasi
Depositing User:	soegeng sugeng
Date Deposited:	07 Jun 2023 03:47
Last Modified:	07 Jun 2023 03:47
URI:	http://repository.ub.ac.id/id/eprint/201075

Text (DALAM MASA EMBARGO) Laurentia Monica Hysinta Sunarto.pdf Restricted to Registered users only until 31 December 2024. Download (43MB)

Actions (login required)

View Item