Phylogeography Study Of Asian Pit Vipers In Indonesia Using Mitochondrial Genes (16S rRNA & ND4) And Nuclear Genes (7IβFIB & 3ITBP)

Priambodo, Bagus and Nia Kurniawan, S.Si., MP., D.Sc. and Fu-Guo Robert Liu, Ph.D (2018) Phylogeography Study Of Asian Pit Vipers In Indonesia Using Mitochondrial Genes (16S rRNA & ND4) And Nuclear Genes (7IβFIB & 3ITBP). Magister thesis, Universitas Brawijaya.

Abstract

Sejarah geografis yang unik dari Indonesia dan daerah sekitarnya memainkan peran penting dalam membentuk dari evolusi organisme. Sejarah evolusi ular beludak Asia relevan dengan geografi tersebut perubahan. Pit viper Asia tersebar luas di Asia Selatan, termasuk Indonesia. Ada total 13 spesies ular beludak Asia yang dikenal tetapi tidak dipelajari dengan baik di Indonesia. Demografi mereka informasi diperlukan untuk masalah konservasi. Oleh karena itu, kami mengumpulkan lebih banyak sampel dari Indonesia untuk mengevaluasi filogeni dan biogeografi ular berbisa Asia, dan untuk memperkirakan mereka ukuran populasi. Penelitian ini melibatkan 29 spesies ular pit viper Asia dari Asia Tenggara. Kita mengumpulkan 46 sampel yang terdiri dari 7 spesies ular beludak Asia dari Indonesia. Urutan DNA dari empat gen, 16S rRNA, ND4, 7IβFIB & 3ITBP, digunakan untuk melakukan filogeni analisis. Tambahan 151 urutan dari empat gen yang sama dari 28 spesies ular beludak Asia adalah diperoleh dari Genbank. Filogeni direkonstruksi menggunakan tiga algoritma yang berbeda, kemungkinan maksimum, penghematan maksimum, dan inferensi bayesian. Filogeni berdasarkan ini empat gen diselesaikan dengan baik dengan sebagian besar dukungan cabang tinggi dan membentuk 5 monofiletik kelompok, clade Trimeresurus, clade Parias, clade Popeia, clade Viridovipera, dan Cryptelytrops klade. Ini adalah pertama kalinya untuk menunjukkan dalam filogeni bahwa T. andalasensis adalah saudara taksa T. puniceus. Di sisi lain, kita mungkin mengenali spesies baru di dalam Cryptelytrops insularis. Itu nenek moyang terbaru dari pit viper Asia menyimpang sekitar 17,2 juta tahun yang lalu (Miosen). Kebanyakan clade terdiversifikasi selama zaman Miosen, menunjukkan bahwa ular beludak Asia mengalami lingkungan dengan iklim yang dominan hangat dan vegetasi hutan hujan, sehingga kelompok ini lebih baik kesempatan untuk berevolusi. Analisis cakrawala Bayesian (BSP) memperkirakan ukuran populasi efektif pada 5 spesies yang termasuk dalam 3 genus ular beludak Asia. 3 spesies, C. purpureomaculatus, P. sabahi, dan T. puniceus menunjukkan sedikit peningkatan dan hampir konstan selama Miosen hingga Pliosen (hangat iklim), kemudian pada Pleistosen (iklim dingin) ukuran populasi sedikit berkurang. 2 lainnya spesies, C. albolabris dan C. insularis menunjukkan ekspansi yang signifikan, berarti mereka memiliki kekuatan adaptasi pada periode dingin. Berdasarkan BSP, kami mungkin menyarankan bahwa spesies yang berbeda dari Ular pit viper Asia mungkin memiliki respons yang berbeda karena perubahan iklim.

Item Type:	Thesis (Magister)
Identification Number:	TES/571.657/PRI/p/2018/041803759
Subjects:	500 Natural sciences and mathematics > 571 Physiology and related subjects > 571.6 Cell biology > 571.65 Cytoplasm
Divisions:	S2/S3 > Magister Biologi, Fakultas MIPA
Depositing User:	Budi Wahyono Wahyono
Date Deposited:	17 Oct 2022 02:33
Last Modified:	17 Oct 2022 02:33
URI:	http://repository.ub.ac.id/id/eprint/195724

Text Bagus Priambodo.pdf Download (2MB)

Actions (login required)

View Item