Sawiya, - (2019) Bioekologi Karang (Fungiidae ) Pada Ekosistem Terumbu Karang Di Perairan Pulau Mamburit, Kabupaten Sumenep Jawa Timur. Doktor thesis, Universitas Brawijaya.
Abstract
Terumbu karang merupakan tempat berkembang biaknya biota yang ada di laut, menyediakan tempat berlindung, makanan, dan bermacam interaksi bioekologis yang saling medukung untuk tersedianya beragam sumberdaya perikanan. Karang jenis fungiia yang terlalu banyak masyarakat ketahui maka perlu identifikasi agar dapat diketahui dengan pasti nama spesies karang yang ada di perairan pulau Mamburit. Identifikasi karang menggunakan karakter morfologi masih menjadi perdebatan dan meragukan, sehingga perlu menggunakan metode molekuler untuk mendapatkan informasi identifikasi dan pengkalsifikasiannya.Penelitian ini bertujuan. Menjelaskan penyebaran terumbu karang fungiidae di perairan pulau Mamburit . Menjelaskan karakter karang fungia secara morfologi dan molekuler dalam penentuan spesies dari perairan pulau Mamburit. Menganalisis hubungan kerakter morfologi terhadap parameter lingkungan. Sampel yang di ambil menggunakan SCUBA, pada transek kuadrat dengan panjang 10 meter lebar 1 meter selanjutnya sampel terumbu karang di bawah ke lab untuk di identifikasi karakter morfometri dan diskriptif, Data karakter morfometrik dan klaster hierarki dianalisis menggunakan uji kladistik untuk mengetahui pengelompokan spesies terhadap setiap karakter menggunakan perangkat lunak PAST dan pohon kekerabatan dengan metode passimony analysis algoritma Branch and Blond dengan menggunakan 1000 bp replika). Data karakter deskriptif dan morfometrik dari hasil pengkelasan, selanjutnya dianalisis dengan metode Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean (UPGMA) menggunakan perangkat lunak PAUP 4, selanjutnya sampel karang di potong sebanyak 2 cm untuk dilakukan analisis DNA menggunakan gen penanda protein Cytochrome oxidase subunit 1 (CO1). Hasil identifikasi fungiidae yaitu ditemukan ada 6 genera karang fungiidae Ctenactis echinata, Sandolita robusta, Fungia concinna, Fungia scutaria, Fungia paumotensis, Fungia kluzingeri, Fungia fungites, herpolitha weberi, Polyphylia talpina, dan Podabacia crustacea. Kepadatan yang mendominasi yaitu pada spesies fungia scutaria pada lokasi WD2 dan frekwensi kehadiran yang ditemukan rata-rata mulai dari 50 % random ,83,33% berkelompok dan seragam 100%. Pengamatan ciri morfologi terumbu karang fungia dari lima sampel terdapat perbedaan di masing-masing spesies secara bentuk atau fisik, perbedaan karakter morfologi karang fungia di pengaruhi oleh parameter lingkungan dan di buktikan dengan adanya nilai korelasi positif, dari kelimah sampel hanya ada empat sampel yang terbaca sekuen DNA, dari keempat sampel mengidentifkasi menunjukkan setelah dilakukan pensejajaran BLAST terdapat kesamaan antara sampel Fungia paumotensis dan, Fungia concinna, mempunyai nilai (similarity) 99 % dan fungia fungites, dan Fungia scutaria mempunyai kesamaan dengan nilai (similarity) 99%.
English Abstract
Coral reefs are a nursery ground for marine biota, providing shelter, food, and various bioecological interactions that support one another for the availability of a variety of fishery resources. Especially the fungi type corals that not too many people know about it. Identification of corals using morphological characters is still being debated, so it is necessary to use molecular methods to obtain identification and classification information. This study aims to 1). Explain the spread of fungiidae coral at Mamburit island waters, 2) Explain the morphological and molecular function of coral fungia in the determination of species in Mamburit island waters. 3). Analyzing the relationship of morphological characteristics to environmental parameters. Sampling method using SCUBA equipment, identification of coral reef abundance using the quadratic transect method length 10 meters width 1 meter2 and coral reef samples taken to the laboratory for morphometric and descriptive character identification. Morphometric character data were analyzed by hierarchical analysis and cluster using a cladistic test to determine the grouping of species of each character using PAST software and kinship trees with the Passimony analysis with Branch and Blond algorithm using 1000 bpreplika method. Descriptive and morphometric character data from the welding results, then analyzed using the Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean (UPGMA) using PAUP 4 software, then coral samples were cut along 2 cm for DNA analysis using the Cytochrome oxidase sub unit 1 protein marker gene ( CO1). The results of identification of fungiidae was found 6 genera of coral fungiidae Ctenacti sechinata, Sandolita robusta, Fungia concinna, Fungia scutaria, Fungia paumotensis, Fungia kluzingeri, Fungia fungites, herpolithaweberi, polyphyliatalpina, and podabacia crustacea. The most dominant density is fungia scutaria at Windward 2 and the average frequency starts from 16.67%, 83.33% and 100%. Observation of the functional morphology characteristics of five samples there were differences in each species physically, the morphological differences of fungia were influenced by environmental parameters. From the five samples there were only four samples that were read as DNA sequences, from the four samples identified after it was performed alignment of BLAST there are similarities between samples of Fungia paumotensis, and Fungia concinna, have similarity of 99% and Fungia fungites, and Fungia scutaria have similarities of 99%
Other obstract
-
| Item Type: | Thesis (Doktor) |
|---|---|
| Identification Number: | DIS/577.789/SAW/b/2019/061911273 |
| Uncontrolled Keywords: | CORAL REEF ECOLOGY |
| Subjects: | 500 Natural sciences and mathematics > 577 Ecology > 577.7 Marine ecology > 577.78 Nearshore ecology > 577.789 Reef ecology |
| Divisions: | S2/S3 > Doktor Ilmu Perikanan dan Kelautan, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan |
| Depositing User: | Endang Susworini |
| Date Deposited: | 23 May 2022 04:29 |
| Last Modified: | 23 May 2022 04:29 |
| URI: | http://repository.ub.ac.id/id/eprint/190714 |
![[thumbnail of SAWIYA (2).pdf]](http://repository.ub.ac.id/style/images/fileicons/text.png) |
Text
SAWIYA (2).pdf Download (7MB) |
Actions (login required)
 |
View Item |