Identifikasi Senyawa Penyusun Ekstrak Etil Asetat Spons Laut Halichondriidae sp. dari Kepulauan Kangean dan Aktivitasnya sebagai Anti-COVID-19 secara In Silico

Zubair, Faizal Muhammad (2021) Identifikasi Senyawa Penyusun Ekstrak Etil Asetat Spons Laut Halichondriidae sp. dari Kepulauan Kangean dan Aktivitasnya sebagai Anti-COVID-19 secara In Silico. Sarjana thesis, Universitas Brawijaya.

Abstract

Sebanyak 219 negara didunia telah terjangkit penyakit COVID-19 yang menyerang sistem pernapasan manusia dengan transmisi virus yang cukup tinggi. Indonesia menjadi salah satu negara yang terjangkit dengan kasus terkonfirmasi sebanyak 1.288.833 orang per tanggal 22 Februari 2021. Namun, sampai saat ini belum ditemukan obat atau vaksin yang cukup efektif dalam mengobati infeksi COVID-19. Ekstrak etil asetat spons laut dari keluarga Halichondriidae sp. yang berasal dari Kepulauan Kangean menjadi salah satu potensi obat untuk COVID-19. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengidentifikasi senyawa penyusun ekstrak berdasarkan uji spektrofotometri UV-Visible, FTIR, LC-MS/MS QTof dan aktivitasnya sebagai anti-COVID-19 melalui penambatan molekul. Pada penelitian ini dilakukan ekstraksi dengan metode sonikasi. Hasil yang diperoleh dari ekstraksi adalah ekstrak kasar sebesar 0,18 g dan rendemen sebesar 0,4528%. Pada Uji spektrofotometri UV-Visible diperoleh panjang gelombang maksimum pda 260 nm disebabkan adanya transisi ℼ → ℼ * yang berasal dari sistem aromatik dan pada 343 nm terjadi transisi n → ℼ * yang berasal pada gugus C=N dan C=O. Uji spektrofotometri FTIR diperoleh adanya gugus O-H, C-H sp2, C-H sp3, C=O, C=N,N-H bending, C-N, C-O, C-Cl dan C-Br. Analisis LC-MS/MS menunjukkan senyawa yang berpotensi sebagai anti-virus adalah (±)-Anabasine, Benzyl urea, tert-Butyl isopropylcarbamate, 3-(4-Hexylcyclohexyl)-5-undecyl-1,2,4-oxadiazole dan 2-[(2E)-2- Octadecen-1-yl]succinic acid. Hasil penambatan molekul terbaik ditunjukkan oleh ligan benzyl urea dengan reseptor 7NEG pada pengulangan ketiga dengan energi ikat sebesar -4,09 kcal/mol. Interaksi ini memiliki beberapa ikatan hidrogen dimana bersifat menstabilkan ikatan dan mempengaruhi ikatannya.

English Abstract

As many as 219 countries in the world have contracted the COVID19 disease which attacks the human respiratory system with a high transmission rate of the virus. Indonesia is one of the infected countries with 1,288,833 confirmed cases as of February 22, 2021. However, until now there has not been found a drug or vaccine that is effective enough to treat COVID-19 infection. Sea sponge ethyl acetate extract from the family Halichondriidae sp. originating from the Kangean Islands is one of the potential drugs for COVID-19. The purpose of this research was to identify the constituent compounds of the extract based on UV-Visible, FTIR spectrophotometric tests, LCMS/MS QTof and its activity as anti-COVID-19 through molecular docking. In this research, the extraction was carried out using the sonication method. The results obtained from the extraction were crude extract of 0.18 g and yield of 0.4528%. In the UV-Visible spectrophotometry test, the maximum wavelength was obtained at 260 nm due to the ℼ → ℼ * transition originating from the aromatic system and at 343 nm the n →ℼ* transition occurred in the C=N and C=O group. FTIR spectrophotometric test obtained the presence of groups O-H, C-H sp2 , C-H sp3 , C = O, C = N, N-H bending, C-N, C-O, C-Cl and C-Br. LC-MS/MS analysis showed compounds that have potential as anti-viral are (±)-Anabasine, Benzyl urea, tert-Butyl isopropyl carbamate, 3-(4-Hexylcyclohexyl)-5-undecyl-1,2,4-oxadiazole and 2- [(2E)-2-Octadecen-1-yl]succinic acid. The best molecular docking results were shown by the benzyl urea ligand with 7NEG receptor on the third iteration with a binding energy of -4.09 kcal/mol. This interaction has several hydrogen bonds which stabilize the bond and affect the bond

Item Type:	Thesis (Sarjana)
Identification Number:	052109
Uncontrolled Keywords:	COVID-19, Ekstrak Etil Asetat Halichondriidae sp. Sonikasi, LC-MS/MS QTof, Penambatan Molekul ", : COVID-19, Ethyl Acetate Halichondriidae sp. Extract, Sonication, LC-MS/MS QTof, Molecular Docking
Divisions:	Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam > Kimia
Depositing User:	Unnamed user with username dedyiskandar
Date Deposited:	21 Oct 2021 03:42
Last Modified:	26 Sep 2024 02:11
URI:	http://repository.ub.ac.id/id/eprint/184535

Text FAIZAL MUHAMMAD ZUBAIR.pdf Download (8MB)

Actions (login required)

View Item