Studi Molecular Docking Senyawa Eugenol dan Turunannya sebagai Obat Antileishmaniasis

Ramadhon, Yuda Alldiansyah (2020) Studi Molecular Docking Senyawa Eugenol dan Turunannya sebagai Obat Antileishmaniasis. Sarjana thesis, Universitas Brawijaya.

Abstract

Penyakit leishmaniasis merupakan penyakit yang diakibatkan oleh parasit dari genus Leishmania. Parasit ini membutuhkan poliaminaa untuk tumbuh dan berkembang. Poliaminaa disintesis dari hidrolisis senyawa L-arginine menjadi L-ornithine dan urea dengan bantuan enzim arginase. Penghambatan enzim arginase sangat diperlukan untuk menghentikan biosintesis poliaminaa. Pada penelitian ini, molecular docking digunakan untuk menentukan potensi senyawa eugenol beserta turunannya ( metil eugenol, asetil eugenol, eugenol benzoat dan juga eugenol benzil eter) sebagai penghambat Leishmania maxicana Arginase (LmArg). Hasil yang diperoleh dari molecular docking adalah nilai Konstanta Inhibisi, RMSD, dan juga visualisasi ligan secara 2D ataupun 3D. Nilai Ki paling rendah dari senyawa eugenol dan turunannya ditunjukkan oleh senyawa asetil eugenol yaitu sebesar 36,05 μM yang jauh lebih baik daripada nilai Ki pentamidine sebagai obat antileishmaniasis standar. Visualisasi 2D ligan juga menunjukkan interaksi yang sama dengan ion Mn2+ pada sisi aktif LmArg.

English Abstract

Leishmaniasis disease is a disease caused by parasites of the genus Leishmania. This parasite requires polyamine to grow and develop. Polyamine is synthesized from the hydrolysis of L-arginine to L-ornithine and urea with the aid of the arginase enzyme. Inhibition of arginase enzyme is indispensable to stop the biosynthesis of polyamine. In this research, molecular docking used to determine the potential of eugenol and its derivatives (methyl eugenol, acetyl eugenol, eugenol benzoate, and eugenol benzyl ether) as an inhibitor for Leishmania maxicana Arginase (LmArg). Results from molecular docking are inhibition constant value, RMSD, and ligand visualization in both 2D and 3D. The lowest Ki value from eugenol and its derivatives is shown by acetyl eugenol at 36.05 μM in which has far better Ki value than pentamidine as the standard anti-leishmaniasis cure. Two-dimensional ligand visualization also shows the same interaction with Mn2+ ion on the active side of LmArg

Other obstract

-

Item Type:	Thesis (Sarjana)
Identification Number:	0520090269
Uncontrolled Keywords:	Leishmania, Arginase, Molecular docking, Eugenol
Subjects:	500 Natural sciences and mathematics > 546 Inorganic chemistry > 546.7 Group 15, 16, 17, 18
Divisions:	Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam > Kimia
Depositing User:	ismanto
Date Deposited:	19 Feb 2021 14:40
Last Modified:	16 Oct 2024 04:16
URI:	http://repository.ub.ac.id/id/eprint/183427

Text Yuda Alldiansyah Ramadhon..pdf Download (2MB)

Actions (login required)

View Item