Uji In Silico Potensi Afzelin Dan Quercitrin sebagai Agen Ko-kemoterapi Paclitaxel pada Reseptor Estrogen α (ERα)

Zein, Dicky Faisal Moh Al (2020) Uji In Silico Potensi Afzelin Dan Quercitrin sebagai Agen Ko-kemoterapi Paclitaxel pada Reseptor Estrogen α (ERα). Sarjana thesis, Universitas Brawijaya.

Abstract

Kanker payudara timbul akibat terjadinya proliferasi sel yang tidak terkontrol. Pengobatan yang bermanfaat untuk mencegah pertumbuhan sel kanker payudara adalah kemoterapi. Paclitaxel yang umumnya digunakan sebagai obat kemoterapi memiliki efek samping. Efek samping paclitaxel dapat dihindari menggunakan ko-kemoterapi. Senyawa yang diduga memiliki potensi sebagai agen ko-kemoterapi adalah quercitrin dan afzelin. Tujuan penelitian untuk mengetahui potensi dan binding affinity afzelin dan quercitrin dengan ERα sebagai agen ko-kemoterapi paclitaxel pada kanker payudara secara in silico. Metode yang digunakan yaitu data mining (PDB dan PubChem), preparasi ligan dan protein (Pyrx), docking (HEX 8.0) dan visualisasi (DS 3.5). Hasil yang didapatkan afzelin mampu menghambat ikatan estradiol dengn ERα dengan berikatan pada active site ERα pada residu asam amino Trp 383, Met 528 dan Leu 536 dengan ikatan hidrofobik. Binding affinity afzelin dengn ERα lebih negatif dari estradiol yaitu -287.91 kkal/mol. Quercitrin berikatan dengan ERα pada asam amino Met 528 yang menyebabkan estradiol tetap berikatan dengan reseptor, meskipun memiliki binding affinity lebih negate dari afzelin -291.44 kkal/mol. Dua senyawa diatas kurang sesuai jika komplekan dengan paclitaxel berdasarkan interaksinya dengan ERα sebagai agen ko-kemoterapi, dikarenakan senyawa komplek yang terbentuk struktur kimianya telah berubah.

English Abstract

Breast cancer arises due to changes in normal cells that experience become abnormal growth. Chemotherapy is a one of useful treatment for breast cancer cells over proliferasion. Paclitaxel which is commonly using as a chemotherapy agent some effects, co-chemotherapy agents that are thought to have potential are quercitrin and afzelin compounds. The purpose of this study is to determine the potential and binding affinity of afzelin and quercitrin with ERα as a paclitaxel cocemotherapy agent in breast cancer in silico. The methods used are data mining (PDB and PubChem), ligand and protein preparation (Pyrx), docking (HEX 8.0) and visualization (DS 3.5). The results obtained afzelin can inhibit estradiol binding with ERα by binding to the active site ERα on amino acid residues Trp 383, Met 528 and Leu 536 with hydrophobic bonds. Afzelin affinity bind with ERα is more negative than estradiol which is -287.91 kcal / mol. Quercitrin binds with ERα to the amino acid Met 528 which causes estradiol to remain bound to the receptor, even though it has a negative affinity binding than afzelin -291.44 kcal / mol. The two compounds above are not suitable if they are complexed with paclitaxel based on their interactions with ERα as a co-chemotherapy agent, because the complex compounds formed by their chemical structure have changed.

Other obstract

-

Item Type:	Thesis (Sarjana)
Identification Number:	0520090175
Uncontrolled Keywords:	afzelin, Erα, in silico, pclitaxel, quercitrin
Subjects:	500 Natural sciences and mathematics > 571 Physiology and related subjects > 571.9 Diseases
Divisions:	Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam > Biologi
Depositing User:	ismanto
Date Deposited:	12 Feb 2021 13:29
Last Modified:	08 Oct 2024 07:36
URI:	http://repository.ub.ac.id/id/eprint/182923

Text 0520090175- Dicky Faisal Moh Al Zein_unlocked (1).pdf Download (2MB)

Actions (login required)

View Item