Eksplorasi Keragaman Gen Tirosin Kinase pada Sapi Limousin (Bos taurus) Jantan terkait Kualitas Semen Segar dengan Metode Polymerase Chain Reaction Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP)

Ramadhani, Ageng Ilham (2020) Eksplorasi Keragaman Gen Tirosin Kinase pada Sapi Limousin (Bos taurus) Jantan terkait Kualitas Semen Segar dengan Metode Polymerase Chain Reaction Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP). Sarjana thesis, Universitas Brawijaya.

Abstract

Tirosin kinase (TEK) merupakan subgrup dari kelas protein kinase. TEK merupakan salah satu protein membran plasma spermatozoa yang memiliki fungsi sebagai mediator pertemuan antara spermatozoa dengan sel telur pada zona pelusida 3 (ZP3). Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis adanya variasi gen tirosin kinase spermatozoa pada semen segar sapi limousin jantan menggunakan metode Polymerase Chain Reaction Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP) berdasarkan hasil fragmen DNA yang menggunakan enzim restriksi HindIII. Penelitian ini menggunakan 20 sampel darah dan semen segar yang didapat dari BBIB Singosari, Malang. Amplifikasi DNA dilakukan dengan metode PCR menggunakan primer forward (TEK_F) 5'-TAGATTGTCGCTTGCCTGGG-3’ dan reverse (TEK_R) 5'-CCTGTGCCGACAGGTTTACT-3’. Analisis data dilakukan dengan menghitung jumlah fragmen DNA yang terbentuk dan korelasinya terkait kualitas semen segar dianalisis dengan uji Spearman. Variasi gen tirosin kinase ditunjukkan dengan terbentuknya fragmen DNA. Fragmen DNA polimorfik berada pada kisaran 136 bp, 88 bp, 72 bp, dan 12 bp, sedangkan fragmen DNA monomorfik berada pada kisaran 39 bp. Koefisien korelasi (r) antara jumlah fragmen DNA pada RFLP dengan pH semen bernilai -0,158 (tidak searah) dengan nilai signifikansi 0,912; volume semen bernilai -0.105 (tidak searah) dengan nilai signifikansi 0,659; motilitas spermatozoa bernilai -0,050 (tidak searah) dengan nilai signifikansi 0,831; dan konsentrasi spermatozoa 0,044 (searah) dengan nilai signifikansi 0,852. Jumlah fragmen DNA pada RFLP dengan beberapa parameter uji kualitas semen segar tersebut memiliki korelasi sangat rendah dan tidak signifikan (signifikansi >0,05).

English Abstract

Tyrosine kinase (TEK) is a group of protein in spermatozoa that functions as mediator between spermatozoa and an ovum in penetrating pellucide zone 3 (PZ3). This study attempted to analyse the correlation of tyrosine kinase encoding gene polymorphism from limousine bulls’ spermatozoa analysed by Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP) towards several fresh limousine bull semen quality parameters. The research used twenty blood samples of limousine bull from BBIB Singosari Malang. The gene amplification was carried out by PCR method using forward primer (TEK_F) 5'-TAGATTGTCGCTTGCCTGGG-3’ and reverse primer (TEK_R) 5'-CCTGTGCCGACAGGTTTACT-3’ followed by restriction reaction using HindIII. The gene polymorphism was determined by analysing the number of amplicon fragments after restriction indicating the presence of TEK gene variation. The restriction reaction resulted a series of band at 136 bp, 88 bp, 72 bp, and 12 bp according to ladder which was then deemed as a polymorphic gene whereas monomorphic gene only yielded a single 39-bp-band. The correlation analysis among quality of the fresh semen parameters and the number TEK gene RFLP fragment were calculated using Spearman test. Correlation coefficients of the number of RFLP fragment towards semen pH, semen volume, sperm motility, sperm concentration were respectively -0.158, -0.105, -0.050, and 0.044. All results showed p-values higher than 0.05 as significance cut-off. In conclusion, the number of tyrosine kinase gene RFLP fragment with several fresh semen evaluation parameters had no significant correlation.

Other obstract

-

Item Type:	Thesis (Sarjana)
Identification Number:	SKR/FKH/2020/39/052003842
Uncontrolled Keywords:	HindIII, sapi limousin, PCR, RFLP, gen TEK, HindIII, limousine bull, PCR- RFLP, TEK gene
Subjects:	600 Technology (Applied sciences) > 636 Animal husbandry > 636.2 Cattle and related animals > 636.21 Cattle for specific purposes
Divisions:	Fakultas Kedokteran Hewan > Kedokteran Hewan
Depositing User:	Budi Wahyono Wahyono
Date Deposited:	10 Aug 2020 06:35
Last Modified:	11 Oct 2024 02:08
URI:	http://repository.ub.ac.id/id/eprint/181310

Text Eriska Ramadhani (2)..pdf Download (7MB)

Actions (login required)

View Item