Besari, Amalda Widia (2019) Uji Ikatan Antara Kuersetin dalam Benalu Mangga (Dendrophthoe pentandra) dengan β-tubulin III (TUBB3) Sebagai Agen Kokemoterapi Paclitaxel pada Sel Kanker Payudara Secara In Silico. Sarjana thesis, Universitas Brawijaya.
Abstract
Kanker payudara merupakan keganasan pada jaringan payudara yang bisa berasal dari epitel duktus maupun lobulusnya. Pada kanker payudara terdapat ekspresi β-TUBULIN III (TUBB3) yang merupakan salah satu protein penting yang terkait dengan penyusunan mikrotubulus. Salah satu terapi kanker payudara adalah kemoterapi menggunakan paclitaxel. Paclitaxel bekerja dengan mengikat tubulin yang merupakan komponen protein mikrotubulus, sekaligus mempromosikan penyusunan dan pembongkaran tubulin untuk membentuk mikrotubulus yang stabil dan tidak berfungsi sehingga menyebabkan kematian sel. Namun, pemberian kemoterapi tunggal menimbulkan berbagai efek samping serta kurang memberikan efek yang adekuat sehingga perlu dikombinasikan dengan agen yang dapat bekerja sinergis sebagai agen kokemoterapi. Kuersetin pada benalu mangga memiliki potensi sebagai antikanker dengan cara menghambat proliferasi sel kanker dan menipiskan mikrotubulus seluler. Penelitian ini dilakukan untuk memprediksi secara molekuler peran kuersetin dalam berikatan dengan TUBB3 sehingga terjadi apoptosis dan berperan sinergis sebagai kokemoterapi kanker payudara. Penelitian ini merupakan penelitian eksperimental in silico melalui metode docking menggunakan sampel dari database pubchem dan Protein Data Bank, yang bertujuan untuk mengetahui daya ikatan kuersetin dengan TUBB3. Metode molecular docking dalam penelitian ini dilakukan menggunakan software PyRX 0.8, untuk mengetahui afinitas ikatan, PyMOL 2.0.6 untuk melihat dalam 3 dimensi dan Ligplot untuk melihat ikatan asam amino. Hasilnya docking didapatkan afinitas ikatan kuersetin dengan TUBB3 sebesar -9,4 kkal/mol sementara afinitas ikatan TUBB3 dengan GTP (kontrol) sebesar -8,9. Kuersetin memiliki afinitas ikatan yang lebihi tinggi maka, kuersetin berpotensi menggantikan posisi ligan control dan menimbulkan efek anti kanker nya.
English Abstract
Breast cancer originates from breast tissue which can originate from the ductal epithelium and lobules. In breast cancer there is β-TUBULIN III (TUBB3) which is one of the important proteins associated with microtubules. One therapy for breast cancer is chemotherapy using paclitaxel. Paclitaxel works by binding to tubulin which is a component of the microtubule protein, while regulating and dismantling tubulin to make microtubules that are stable and do not function causing cell death. However, administration of different side effects provides side effects that need to be improved with agents that can work well as cocemotherapy agents. If you have the potential as an anticancer by inhibiting the proliferation of cancer cells and diluting cellular microtubules. This research was conducted to predict the molecular role in binding to TUBB3 so that apoptosis occurs and synergistically involves as cocemotherapy for breast cancer. This research is an experimental study in silico through the docking method using samples from the pubchem database and Protein Data Bank, which aims to study the power of quercetin bonding with TUBB3. The molecular docking method in this study was carried out using PyRX 0.8 software, to study bonds, PyMOL 2.0.6 to see in 3 dimensions and Ligplot to see amino acid bonds. Docking obtained from bonds with TUBB3 of -9.4 kcal / mol while bonds with TUBB3 with GTP (control) of -8.9. Quercetin has higher bond affinity, quercetin which determines the position of the control ligand and has anti-cancer effect.
| Item Type: | Thesis (Sarjana) |
|---|---|
| Identification Number: | SKR/FK/2019/455/052001279 |
| Uncontrolled Keywords: | kuersetin, β-TUBULIN III (TUBB3), paclitaxel, benalu mangga (Dendrophthoe pentandra)-quercetin, β-TUBULIN III (TUBB3), paclitaxel, mango parasite (Dendrophthoe pentandra) |
| Subjects: | 600 Technology (Applied sciences) > 616 Diseases > 616.9 Other disease > 616.99 Tumors and miscellaneous communicable diseases > 616.994 Cancers > 616.994 49 Breast cancer |
| Divisions: | Fakultas Kedokteran > Pendidikan Dokter |
| Depositing User: | soegeng sugeng |
| Date Deposited: | 10 Aug 2020 07:41 |
| Last Modified: | 22 Oct 2021 02:19 |
| URI: | http://repository.ub.ac.id/id/eprint/179867 |
Preview |
Text
Amalda Widia Besari.pdf Download (5MB) | Preview |
Preview |
Text
MAJALAH_Amalda_165070107111034.pdf Download (3MB) | Preview |
Actions (login required)
 |
View Item |