Kadafi, Ahmad Muammar (2018) Filogenetik Ular Tanah Calloselasma Rhodostoma (Kuhl, 1824) (Serpentes: Viperidae: Crotalinae) Berdasarkan Analisis Morfometri Dan Dna Mitokondria (Gen Nd4) Di Asia Tenggara. Magister thesis, Universitas Brawijaya.
Abstract
Dinamika geologi yang berdampak pada perubahan topografi di Asia Tenggara (Sundaland) diduga bertanggung jawab penuh terhadap pola distribusi Malayan Pit Viper (Calloselasma rhodostoma) di Indonesia. Evaluasi terhadap terputusnya aliran gen sebagai dampak dari kondisi ini sangat penting dilakukan untuk menganalisis profil filogenetik, zoogeografi, dan waktu divergensi C. rhodostoma yang didukung melalui analisis DNA gen ND4 dan perbandingan morfologi. Sejumlah 23 sekuen sampel digunakan dalam konstruksi pohon filogenetik Bayesian Inference (BI), p-distance, dan waktu divergensi dari 7 lokasi di Asia Tenggara. Sebanyak 2 sekuen tambahan diambil dari GenBank dari Thailand dan 4 sekuen sampel sebagai outgroup. Spesies C. rhodostoma ditemukan kembali di Kalimantan Barat sejak sampel terakhir ditemukan tahun 1912, dengan habitat hutan dataran rendah, dan perkebunan sawit. Pengelompokan yang mengacu pada karakter morfologi dan topologi filogeni (politomi) menunjukkan pengelompokan masing-masing sampel berdasarkan lokalitas, dimana nilai p-distance rendah (minimum: 0.27%, maksimum: 0.39%), sehingga dapat disimpulkan bahwa spesies ini masih dalam satu spesies. Variasi morfologi ditunjukkan dengan adanya variasi sisik kepala, dimana terdapat dua variasi, yaitu 3 tipe variasi sisik aksesoris kecil dan 4 tipe variasi sisik anterior temporal. Hipotesis persebaran C. rhodostoma diketahui dari waktu pemisahan (Divergence time) antara masing-masing populasi sampel. Populasi C. rhodostoma tersebar pada Pleistosen (1.8 juta tahun yang lalu) dimulai dari populasi Jawa menuju populasi Kalimantan sekitar 1.2 juta tahun yang lalu, kemudian populasi Kalimantan berkembang menuju populasi Thailand dan populasi Kangean sekitar 1 juta tahun yang lalu. Sedangkan populasi Thailand dan Kangean terpisah sekitar 0.8 juta tahun yang lalu.
English Abstract
The geological history of Southeast Asia is predicted to be responsible for the distribution pattern of Malayan Pit Viper (Calloselasma rhodostoma) in Indonesia. Evaluation on the disconnection of gene flow as the result of geological history is important to analyse phylogenetic, zoogeography, and time divergence of C. rhodostoma as revealed by mitochondrial DNA, ND4, and morphological analysis. Total of 23 sequences was analysed and used to construct phylogenetic tree with Bayesian Inference (BI), p-distance, and time divergence of C. rhodostoma from 7 locations in Southeast Asia. Two sequences originated from Thailand and 4 sequences as outgroup were downloaded from GenBank. Calloselasma rhodostoma is rediscovered in West Kalimantan since the first sample discovered in 1912. This snake is mostly found in lowland forest and palm plantation. The result of this research has discovered that C. rhodostoma grouped based on the locality, both according to morphological analysis or phylogenetic tree. In addition, p-distance score is considered as low (minimum: 0.27%, maximum: 0,39%), so it can be concluded that all samples used in this study still belong to the same species. Morphological variation is indicated by variation on the head scale, where there are 2 variations: 3 types of small accessories scales and 4 types of anterior temporal scale. According to the divergence them, the hypothesis for C. rhodostoma distribution is predicted to be spread in Pleistocene (1.8 mya) and originated from Java, then spread to Kalimantan in 1.2 mya. Kalimantan population was then predicted to develope and spread to Thailand and Kangean in mya. Thailand and Kangean population is estimated to be separated in 0.8 mya.
Other obstract
-
| Item Type: | Thesis (Magister) |
|---|---|
| Identification Number: | TES/597.96/KAD/f/2018/041808936 |
| Uncontrolled Keywords: | REPTILIA, SNAKES |
| Subjects: | 500 Natural sciences and mathematics > 597 Cold-blooded vertebrates > 597.9 Reptilia (Reptiles) > 597.96 Serpentes (snakes) |
| Divisions: | S2/S3 > Magister Biologi, Fakultas MIPA |
| Depositing User: | Endang Susworini |
| Date Deposited: | 31 Dec 2019 01:59 |
| Last Modified: | 19 Nov 2020 03:44 |
| URI: | http://repository.ub.ac.id/id/eprint/177430 |
Actions (login required)
 |
View Item |