Widyantoro, Anatasha Reza (2019) Eksplorasi Polimorfisme Merak India (Pavo Cristatus) Leucistic Dan Non-Leucistic Berdasarkan Gen Tyrosinase (Tyr) Dengan Metode Polymerase Chain Reaction Di Eco Green Park Kota Batu. Sarjana thesis, Universitas Brawijaya.
Abstract
Merak India (Pavo cristatus) merupakan salah satu jenis merak yang populasinya terus mengalami penurunan di alam liar. Merak India seringkali mengalami kondisi yang disebut dengan leucistic yang ditandai dengan warna bulu yang berwarna putih akibat kurangnya pigmentasi melanin. Gen Tyrosinase (TYR) merupakan gen terkait melanogenesis utama untuk kulit atau warna bulu. Gen TYR merupakan gen yang mengkode enzim tirosinase yang terletak di melanosit, sebagai sel yang menghasilkan pigmen yang disebut melanin. Perubahan atau mutasi pada gen ini dapat menghasilkan enzim yang rusak yang dapat mengganggu laju produksi melanin. Penelitian ini bertujuan untuk menentukan perbedaan sekuen gen TYR pada Merak India dalam kondisi leucistic dan non-leucistic berdasarkan menggunakan metode PCR. Sampel yang digunakan berupa 2 sampel bulu merak leucistic dan 2 sampel bulu merak non-leucistic. Amplifikasi DNA dilakukan dengan metode PCR menggunakan primer forward (TYR_F) 5’-TCA TGG GGT TCA ACT GTG GG-3’ dan primer reverse (TYR_R) 5’-TCT CAC GTT CCC ATA GCA GC-3’ kemudian dilanjutkan proses sekuensing produk PCR. Analisis hasil sekuen dilakukan menggunakan software BioEdit dan NCBI BLAST. Hasil penelitian menunjukkan adanya perbedaan sekuen antara Merak India leucistic dan Merak India non-leucistic pada basa ke-44 namun tidak menyebabkan terjadinya perubahan asam amino sehingga mutasi yang terjadi disebut mutasi diam atau silent mutation. Perubahan basa sitosin (C) menjadi timin (T) pada basa ke-44 tidak mempengaruhi perubahan asam amino sehingga tidak mengakibatkan perubahan protein. Kesimpulan dari penelitian ini adalah perbedaan sekuen gen TYR antara Merak India leucistic dan Merak India non-leucistic tidak menyebabkan perubahan warna bulu pada merak di Eco Green Park, Kota Batu.
English Abstract
Indian Peafowl (Pavo cristatus) is one type of peacock whose population continues to decrease in the wild. Indian Peafowl often experience a condition called leucistic which is characterized by the color of white feathers due to lack of melanin pigmentation. Tyrosinase gene (TYR) is a major gene associated with melanogenesis. The TYR gene is a gene that encodes the enzyme tyrosinase which is located in melanocytes, special cells that produce pigments called melanin. Changes or mutations in the TYR gene can produce damaged enzymes that can interfere melanin production. This study aims to determine the differences in TYR gene sequences in leucistic Indian Peacock and in non-leucistic Indian Peafowl using the PCR method. The samples to be used are feathers from 2 leucistic peafowl and 2 non-leucistic peafowl. DNA amplification was carried out by PCR method using forward primer (TYR_F) 5’-TCA TGG GGT TCA ACT GTG GG-3’ and reverse primer (TYR_R) 5’-TCT CAC GTT CCC ATA GCA GC-3’ then continued with sequencing process. Analysis of the results of DNA sequences was carried out using BioEdit software and NCBI BLAST. The results showed a sequence difference between leucistic Indian Peacock and non-leucistic Indian Peacock in 44th base but did not cause changes in amino acids so that the mutations that occur were called silent mutations. Changes in cytosine (C) to thymine (T) in the 44th base did not affect changes in amino acids nor in protein. The conclusion of this study is the difference in the TYR gene sequence between leucistic Indian Peacock and non-leucistic Indian Peacock does not cause discoloration of peafowl feathers in Eco Green Park, Batu City.
Other obstract
-
| Item Type: | Thesis (Sarjana) |
|---|---|
| Identification Number: | SKR/FKH/2019/7/051908945 |
| Uncontrolled Keywords: | Merak India, gen TYR, leucistic, PCR, Indian Peafowl, TYR Gene, leucistic, PCR |
| Subjects: | 500 Natural sciences and mathematics > 598 Aves (Birds) > 598.6 Galliformes and Columbiformes |
| Divisions: | Profesi Kedokteran > Spesialis Dokter Hewan, Fakultas Kedokteran Hewan |
| Depositing User: | Nur Cholis |
| Date Deposited: | 11 Nov 2020 13:56 |
| Last Modified: | 21 Oct 2021 02:36 |
| URI: | http://repository.ub.ac.id/id/eprint/176613 |
Preview |
Text
ANATASHA REZA WIDYANTORO (2).pdf Download (2MB) | Preview |
Actions (login required)
 |
View Item |