Rahman, Rifqi (2018) Analisa warna rambut Banteng Jawa (Bos javanicus) berdasarkan gen Melanocortin-1 receptor (MC1R) dengan metode Polymerase Chain Reaction (PCR). Sarjana thesis, Universitas Brawijaya.
Abstract
Banteng Jawa (Bos javanicus) merupakan mamalia endemik Pulau Jawa yang memiliki perubahan warna rambut menjadi lebih gelap pada umur dewasa. Melanocortin-1 Receptor (MC1R) merupakan gen penentu yang meregulasi warna rambut dan kulit pada mamalia. Gen MC1R meregulasi melanogenesis untuk memproduksi pigmen melanin. Banteng Jawa jantan dewasa memiliki pigmen eumelanin lebih dominan daripada betina dan anakan sehingga memiiki warna rambut lebih gelap. Penelitian ini bertujuan untuk menentukan perbedaan warna rambut Banteng Jawa berdasarkan sekuen gen MC1R metode PCR. Sampel yang digunakan adalah DNA yang diisolasi dari sampel darah. Amplifikasi DNA dilakukan dengan metode PCR menggunakan primer Forward (MC1R_F) 5’-ACA ATG TCA TCG ACG TGC TC-3’ dan Reverse (MC1R_R) 5’-AGC TAT GAA GAG GCC AAC GA-3’ dan dilanjutkan dengan sekuensing terhadap produk PCR. Analisa hasil sekuen DNA dilakukan dengan menggunakan software BioEdit dan NCBI BLAST. Hasil penelitian menunjukan hasil analisa gen sampel JD (Banteng Jawa Jantan Dewasa) mengalami mutasi gen delesi pada sekuen ke-537 yakni hilangnya basa nukleotida Thimyn (T) c.537delT menyebabkan perubahan delesi susunan asam amino phenylalalnine (F) p.179delF pada daerah transmembrane region gen MC1R. Terjadinya perubahan asam amino phenylalanine (F) p.179delF diprediksi dapat meningkatkan produksi eumelanin sehingga Banteng Jawa jantan dewasa dapat mensintesiskan melanin menjadi eumelanin. Kesimpulan dari penelitian ini adalah terdapat perbedaan sekuen gen DNA dan asam amino antara sampel Banteng Jawa jantan dewasa rambut gelap (JD) yang memiliki eumelanin dominan daripada sampel Banteng Jawa betina dewasa (BD) dan sampel Banteng Jawa anakan jantan (JA) dan betina anakan (BA) berambut terang yang memiliki feomelanin dominan.
English Abstract
Banteng Jawa (Bos javanicus) is an endemic mammal in Java Island that has a change in hair color becomes darker in adult. Melanocortin-1 Receptor (MC1R) is a gene to determnine hair and skin color in mammals. The MC1R gene regulates melanogenesis to produce melanin pigment. An adult male Banteng Jawa have more dominant eumelanin than females and infant that make hair color more darker. This study was aimed to determine the color difference of Javanese Bull hair based on MC1R gene sequence by isolating DNA use PCR methode. the sample used is that have been isolated from blood sample. Amplification DNA using PCR methode with Forward (MC1R_F) 5'- ACA ATG TCA TCG ACG TGC TC -3 'and Reverse (MC1R_R) 5'-AGC TAT GAA GAG GCC AAC GA -3' and continued with sequencing of PCR products as well as analysis done using BioEdit and NCBI BLAST software. The results showed that sample the sample JD (Banteng Jawa Adult Male) has a difference gene of deletion gene mutation thymin in sequence (T) 537 c.537delT which affect to deletion of amino acid phenylalanine (F) in p.179delF in the transmembrane region of MC1R gene region. The mutation of amino acid changes p.179delF is predicted increase eumelanin production and affect to adult male Banteng Java can synthesize more melanin into eumelanin. This study concluded there are differences in DNA gene sequences and amino acids between the sampel Banteng Jawa adult male dark hair that has more eumelanin with sampel Banteng Jawa adult female and sampel Banteng Jawa young male and young female with more bright hair that has more dominant feomelanin.
| Item Type: | Thesis (Sarjana) |
|---|---|
| Identification Number: | SKR/FKH/2018/48/051805215 |
| Uncontrolled Keywords: | Melanin, Pigmentasi MC1R, Banteng Jawa (Bos javanicus), PCR |
| Subjects: | 600 Technology (Applied sciences) > 636 Animal husbandry > 636.9 Other mammals |
| Divisions: | Fakultas Kedokteran Hewan > Kedokteran Hewan |
| Depositing User: | Endang Susworini |
| Date Deposited: | 19 May 2020 00:00 |
| Last Modified: | 19 May 2020 00:00 |
| URI: | http://repository.ub.ac.id/id/eprint/167910 |
Actions (login required)
 |
View Item |