Hiariej, Adriana (2015) Analisis Variabilitas Genetik Pisang Tongkat Langit (Musa troglodytarum L.) Asal Kepulauan Maluku. Doctor thesis, Universitas Brawijaya.
Abstract
Propinsi Maluku merupakan bagian dari wilayah Timur Indonesia. Maluku yang dijuluki 1000 pulau terdiri dari pulau-pulau kecil yang dipisahkan oleh laut dengan berbagai variasi tanaman endemik. Plasma nutfah pisang sangat besar mencakup pisang liar maupun pisang yang telah dibudidayakan di wilayah ini, di antaranya pisang tongkat langit. Pisang tongkat langit dengan nama ilmiah Musa troglodytarum adalah jenis pisang yang tandannya tidak melengkung ke bawah tetapi tegak ke atas sehingga bagi masyarakat Maluku dikenal dengan nama ”pisang tongkat langit”. Pisang Tongkat langit yang tersebar di kepulauan Maluku bervariasi. Variasi tersebut dapat berupa variasi fenotipik maupun genetik. Variasi fenotip pada tanaman pisang dapat diamati dengan melihat penampilan karakter fenotipik berbagai organ tanaman. Variasi fenotipik di dalam jenis merupakan dasar untuk mengetahui variabilitas dan distribusi makhluk hidup di suatu wilayah.Variasi genetik pada pisang tongkat langit dapat dipelajari dengan penanda molekular. Penanda molekular yang digunanakan adalah gen ribulosa 1-5 biphosphate carboxylase/oxygenase, DNA kloroplas (cpDNA). Pemilihan gen rbcL dalam analisis filogenetik tanaman karena laju substitusi sinonimus nukleotida yang lebih lambat dibandingkan dengan gen yang ada di inti sel. Eksplorasi dilakukan untuk memperoleh sampel pisang tongkat langit dikawasan penyebaran, deskripsi karakter fenotipik, karakter agronomi, lingkungan tumbuh (habitat), menentukan titik koordinat dengan global positioning system dan mengambil daun pisang muda untuk analisis molekuler. Analisis Fenotipik dilakukan dengan mengamati 100 karakter. Konstruksi dendogram dilakukan dengan menggunakan software NTsys. Analisis karakter agronomi (hasil) dilakukan dengan mengukur produksi per pohon per lokasi. Analisis karakter lingkungan dengan menggunakan biplot dan Bray Curtis Index, pemetaan dengan software Arcgis Map 10. Analisis molekuler menggunakan teknik PCR dan sekuensing DNA kloroplas terutama gen rbcL. Analisis data molekuler dilakukan menggunakan software bioedit, Mega 5, DNAsp dan network untuk pola haplotipe. Dari hasil eksplorasi ditemukan 10 pulau dan dua puluh satu titik sampel pisang tongkat langit di kepulauan Maluku yaitu Ambon (AMB), Saparua (SPR), Seram (SRM), Dobo (DBO), Wokam (WKM), Haruku (HRK),Nusalaut (NSL), Tual (TL), Elat (ELT) dan Halmahera (HLM). Habitat populasi pisang tongkat langit dibagi atas 3 kelompok yaitu kelompok 1 terdiri dari habitat populasi pisang tongkat langit asal AMBI,AMB2, SRM1 dan SRM2. Kelompok 2 terdiri dari habitat pisang tongkat langit viii asal HRK1, SPR1, NSL1, TL, EL, WKM, JLO, DBO1 dan kelompok 3 adalah habitat populasi pisang tongkat langit asal TBLO. Populasi pisang tongkat langit asal kepulauan Maluku memiliki variasi fenotipik pada organ vegetatif dan generatif. Pada koefisien similarias 69.3% terbentuk dua kelompok percabangan yang memiliki kesamaan dalam dua puluh satu karakter fenotipik pada organ vegetatif dan generatif. Nilai koefisien similaritas populasi pisang tongkat langit asal kepulauan Maluku berkisar antara 69.3% - 94%. Populasi pisang tongkat langit asal HRK1 memiliki produksi berat buah/tandan tertinggi 22 kg dan produksi terendah pada populasi pisang tongkat langit asal TBLO. Populasi pisang tongkat langit asal JLO memiliki jumlah sisir/tandan tertinggi 14 sisir, jumlah sisir terendah terdapat pada populasi AMB3 dan HRK3. Populasi pisang tongkat langit yang memiliki jumlah buah/tandan banyak adalah populasi AMB1 dan populasi yang memiliki jumlah buah/tandan sedikit adalah populasi TL. Hasil analisis variasi genetik populasi pisang tongkat langit dengan outgroup berdasarkan sekuen rbcl diperoleh 508 situs invariable (monomorphic) sites dan 10 variable (polymorphic) sites dengan nucleotide diversity sebesar 0,00204 dan haplotype diversity sebesar 0,380. Terdapat enam haplotype berdasarkan sekuen gen rbcL. Persebaran haplotype populasi pisang tongkat langit tidak sesuai dengan wilayah persebaran tetapi secara acak. Terjadi subtitusi nonsinonimous dominan pada populasi pisang tongkat langit asal kepulauan Maluku. Kata kunci: Variabilitas Genetik, Pisang tongkat Langit (Musa troglodytarum L.), Maluku.
| Item Type: | Thesis (Doctor) |
|---|---|
| Identification Number: | DIS/584.39/HIA/a/2015/061507892 |
| Subjects: | |
| Divisions: | S2/S3 > Doktor Biologi, Fakultas MIPA |
| Depositing User: | Endang Susworini |
| Date Deposited: | 19 Nov 2015 12:06 |
| Last Modified: | 19 Nov 2015 12:06 |
| URI: | http://repository.ub.ac.id/id/eprint/160504 |
Actions (login required)
 |
View Item |