Noercholis, Achmad (2013) Pengolahan Citra untuk Mendiagnosis Terjadinya Infeksi pada Ikan Berdasarkan Kajian Haematology. Magister thesis, Universitas Brawijaya.
Abstract
Sebagai negara dengan 2/3 luas wilayahnya adalah perairan, Indonesia mempunyai potensi strategis dalam mengembangkan komoditas pangan yang berasal dari wilayah perairan. Namun demikian perkembangan pembangunan mengakibatkan kualitas air jauh menurun, yang berakibat secara langsung terhadap komoditas ikan baik hasil tangkapan di sungai, laut maupun hasil budidaya. Keberhasilan pembudidayaan ikan sangat tergantung pada pola budi daya dan kemampuan pembudidaya dalam menghadapi penyakit ikan. Tidak jarang pembudidaya mengalami kerugian yang sangat besar karena terlambat menyadari penyakit yang muncul pada ikan. Early detection system diperlukan untuk mengantisipasi terjadinya masalah tersebut. Agar penyakit bisa diketahui lebih awal, diperlukan pemeriksaan hematology secara berkala pada ikan. Pemeriksaan hematology pada manusia setingkat lebih maju dibandingkan pemeriksaan hematology ikan karena dilakukan menggunakan alat yang disebut dengan hematology analizer . Prinsip kerja hematology analizer yang digunakan pada manusia berbasiskan pada inti sel darah, sehingga alat tersebut tidak sesuai jika diaplikasikan pada sel darah ikan karena leukosit dan eritrosit pada ikan sama-sama memiliki inti sel sedangkan pada sel darah manusia hanya sel darah putih yang memiliki inti sel. Sehingga diperlukan sebuah konsep baru “ tool diagnostic ” sebagai upaya menemukan metode pembacaan hematology ikan yang mudah, cepat dan akurat. Dalam penelitian ini dibuat sebuah aplikasi untuk mendiagnosis terjadinya infeksi pada ikan dengan melakukan kajian hematology terhadap citra sel darahnya menggunakan pengolahan citra. Parameter hematology yang dikaji adalah jumlah leukosit dan eritrosit dalam 1 mm3 darah ikan. Tahap pengolahan citra yang dilakukan adalah acquisition, preprocessing, pattern analysis, pengenalan , penghitungan dan diagnosis . Pada tahap acquisition dilakukan proses pengambilan citra dan penghitungan jumlah sel darah secara manual. Hasil penghitungan manual digunakan untuk menentukan jemlah sel darah ikan sehat dan digunakan sebagai data pembanding untuk menguji tingkat akurasi sistem yang di bangun. Pada tahap preprocessing proses croping, dinamic contrast, filling, opening dilakukan untuk mengubah citra menjadi citra biner yang tepat memisahkan antara background dengan sel darah. Tahap berikutnya watershed digunakan untuk memisahkan sel-sel yang masih bertumpuk. Pada tahap pattern analysis fitur RAP ( roundness, area dan perimeter ) diekstraksi dari setiap objek yang terdeteksi. Pada tahap pengenalan dan penghitungan dilakukan proses roundness filtering berdasarkan hasil ekstraksi fitur RAP. Pada tahap diagnosis jumlah sel darah hasil penghitungan sistem dibandingkan dengan jumlah sel darah ikan sehat untuk menentukan terjadi infeksi atau tidak. Berdasarkan penerapan algoritma dan pengujian yang telah dilakukan diperoleh bahwa tingkat akurasi penghitungan sel menggunakan pengolahan citra mencapai 96,84% untuk leukosit dan 99,61% untuk eritrosit.
English Abstract
As a country with 2/3 total area is water, Indonesia has potential to develop food commodities derived from water areas. However, development of fur r development resulted in decreased water quality, which directly affected commodity fish that caught in river, sea or farmed. Fish breeding success is highly dependent on pattern of cultivation and ability of fish farmers in face of illness. Often, farmers suffered huge losses due to late realized emerging diseases in fish. Early detection system is needed to anticipate occurrence of problem. So that disease can be caught early, required periodic checks on fish hematology. Examination of hematology at one stage more advanced than humans hematology examination of fish because it is done using a tool called a hematology analyzer. working principle hematology analyzer used in humans based on blood cell nucleus, so that instrument is not appropriate when applied to fish blood cells as leukocytes and erythrocytes in fish have same core, while in human just white blood cells that have a cell nucleus . Thus required a new concept of "tool diagnostic " in an attempt to find a readings method of fish hematology that easy, fast and accurate. In this study an application is made to diagnose infection in fish with a review of hematology against blood cell images using image processing. Hematology parameters studied were number of leukocytes and erythrocytes in 1 mm3 of blood fish. Image processing stage that performed is acquisition, preprocessing, pattern analysis, recognition, counting and diagnosis. In acquisition phase of image retrieval process is carried out and blood cell counts manually. Results of manual counting is used to determine number blood cells of healthy fish and used as benchmark data to test accuracy of aplication. In preprocessing stage cropping, dynamic contrast, filling, opening is done to change image into a binary image to separate blood cells from background. Watershed is used to separate cells that still accumulated. At pattern analysis stage RAP feature (roundness, area and perimeter) were extracted from each detected object. In introduction stage and counting is done roundness filtering process based on results of RAP feature extraction. At diagnosis stage result of application compared with number of blood cell in healthy fish to determine occurrence infection or not. Based on application of algorithms and testing that has been done shows that accuracy of cell counting using image processing reached 96.84% for leukocytes and 99.61% for erythrocytes.
| Item Type: | Thesis (Magister) |
|---|---|
| Identification Number: | TES/621.367/NOE/p/041307070 |
| Subjects: | 600 Technology (Applied sciences) > 621 Applied physics > 621.3 Electrical, magnetic, optical, communications, computer engineering; electronics, lighting |
| Divisions: | S2/S3 > Magister Teknik Elektro, Fakultas Teknik |
| Depositing User: | Endro Setyobudi |
| Date Deposited: | 12 Feb 2014 17:38 |
| Last Modified: | 12 Feb 2014 17:38 |
| URI: | http://repository.ub.ac.id/id/eprint/158657 |
Actions (login required)
 |
View Item |