Genetic Similarity between Lempuk Fish and Gobiopterus brachypterus Using 12S rRNA Gene

Throush, FatmaAlarabiR (2012) Genetic Similarity between Lempuk Fish and Gobiopterus brachypterus Using 12S rRNA Gene. Magister thesis, Universitas Brawijaya.

Abstract

Ikan Lempuk adalah salah satu ikan endemik di Jawa. Ikan ini memiliki fungsi utama untuk mengendalikan populasi Alga di Danau Ranu Grati. Karena orang-orang memperkenalkan ikan eksotis (I.E Lohan) ke dalam danau, maka struktur ekosistem danau diubah menuju kepunahan Lempuk, karena Louhan adalah predator untuk Lempuk. Lempuk memiliki dua jenis yang tipe B dan C, dan ikan memiliki morfologi yang mirip dengan Gobiopterus Brachypterus. Selanjutnya kami tertarik untuk mempelajari kesamaan genetik di antara LEMPUK Tipe B, C dan G. Brachypterus. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk menguji kesamaan genetik di antara LEMPUK Tipe B, C dan G. Brachypterus berdasarkan gen 12S RRNA. Metode yang digunakan dalam penelitian ini adalah sequencing PCR. Berdasarkan hasil penelitian menunjukkan bahwa LEMPUK Tipe B dan tipe C adalah spesies yang sama, dengan jarak genetik 0,22% atau kesamaan genetika 99,8%. Lempuk dan G. Brachypterus memiliki jarak genetik 8,5% atau kesamaan genetik 91,5%. Berdasarkan data dapat disimpulkan bahwa ikan Lempuk bukan spesies G. brachypterus.

English Abstract

Lempuk fish is one of endemic fish in Java. This fish have main function to control population of alga in Ranu Grati Lake. Since the people introduce exotic fish (i.e Lohan) into the lake, then the ecosystem structure of the lake was changed toward extinction of Lempuk, because Louhan are predator for Lempuk. Lempuk has two types that are type B and C, and the fish has morphology similar to Gobiopterus brachypterus . Furthermore we interested to study the genetic similarity among Lempuk type B, C and G. brachypterus. Aim of this research was to examine the genetic similarity among Lempuk type B, C and G. brachypterus based on 12S rRNA gene. The methods used in this study were PCR-sequencing. Based on the result showed that Lempuk type B and type C are same species, with genetic distance 0.22% or genetics similarity 99.8%. Lempuk and G. brachypterus has genetic distance 8.5% or genetic similarity 91.5%. Based on the data could be concluded that the lempuk fish is not G. brachypterus species .

Item Type: Thesis (Magister)
Identification Number: TES/597.7/THR/g/041204188
Subjects: 500 Natural sciences and mathematics > 597 Cold-blooded vertebrates > 597.7 Perciformes
Divisions: S2/S3 > Magister Biologi, Fakultas MIPA
Depositing User: Endro Setyobudi
Date Deposited: 20 Feb 2013 11:57
Last Modified: 20 Feb 2013 11:57
URI: http://repository.ub.ac.id/id/eprint/157881
Full text not available from this repository.

Actions (login required)

View Item View Item