Sinuraya, Sabarita (2011) Analisis Keragaman Genetik Landak Laut Spesies Diadema setosum (Leske) di Pantai Selatan Kabupaten Malang. Magister thesis, Universitas Brawijaya.
Abstract
Metode RAPD dalam penelitian ini digunakan untuk mengetahui keragaman genetik Diadema setosum dari 8 individu yang berasal dari 4 lokasi Laut Pantai Selatan Kabupaten Malang. Hasil dari penelitian ini diharapkan memberikan informasi tentang keragaman genetik populasi Diadema setosum dan faktor lingkungan yang mendukung populasi Diadema setosum dari 4 lokasi di Pantai Selatan Kabupaten Malang, sehingga dapat dijadikan dasar dalam usaha pemanfaatan landak laut secara berkelanjutan sebagai upaya konservasi. Penelitian ini dilakukan di laboratorium Biologi Molekuler Jurusan Biologi FMIPA dan Laboratorium Sentral Ilmu hayati (LSIH) Universitas Brawijaya Malang. Isolasi DNA dalam penelitian ini dilakukan dengan menggunakan modifikasi dari metode Ausubel dan CTAB. DNA yang diperoleh dianalisis dengan metode RAPD menggunakan 2 primer yaitu primer OPA2 dan OPA4. Data hasil RAPD diubah dalam bentuk data biner dan selanjutnya dihitung jarak genetik dan dikelompokkan dalam dendogram berdasarkan metode Unweighted Pair Group Method of Aritmathic (UPGMA) dengan menggunakan software Multi Variate Statistical Package (MVSP). Hasil penelitian menunjukkan bahwa analisis indeks kesamaan antara individu beragam mulai 0,572 sampai 0,935 dimana individu terbagi menjadi 4 kelompok yaitu empat genotip menyebar pada kelompok I, satu genotip pada kelompok II, satu genotip pada kelompok III dan dua genotip pada kelompok IV. Tingkat kesamaan tetinggi sebesar 0,935 pada individu NG1, NG2 (Ngelinyep), sedangkan terendah sebesar 0,613 pada individu KM1, KM2 (Kondang Merak). Sehingga diduga pada populasi Landak laut spesies Diadema setosum yang ada di Pantai Selatan Kabupaten Malang memiliki variasi secara genetik diperkirakan mencapai 43%. Hasil pengukuran faktor lingkungan di sepanjang laut Pantai Selatan Kabupaten Malang masih berada pada batas toleransi untuk Diadeama setosum .
English Abstract
RAPD method in this study used to determine the genetic diversity of Diadema setosum from 8 individuals that came from four marine sites of South Beach Malang. The results of this research is expected to provide information about the genetic diversity of populations Diadema setosum and environmental factors that support Diadema setosum population of 4 locations in South Beach district of Malang, so it can be used as the basis in the business in a sustainable utilization of sea urchins as conservation efforts. This research was conducted in the laboratory of Molecular Biology Department and Central Laboratory of Biological Sciences (LSIH) UB Malang. Isolation of DNA in this study carried out by using a modification of the method of Ausubel and CTAB. DNA was analyzed by RAPD method using two primers, namely primary and OPA4 OPA2. RAPD data changed the results in the form of binary data and then calculated the genetic distance and grouped in a dendogram based on the method of Unweighted Pair Group Method of Aritmathic (UPGMA) using the software Multi Variate Statistical Package (MVSP). The results showed that the analysis of similarity index between individuals ranged from 0.572 to 0.935 in which individuals are divided into 4 groups, namely four genotypes spread in group I, one in group II genotypes, one genotype in group III and the two genotypes in group IV. The highest similarity level of 0.935 on the individual NG1, NG2 (Ngelinyep), while the lowest at 0.613 in individuals KM1, KM2 (Kondang Merak). So allegedly in populations of species of sea urchins Diadema setosum in Malang Regency South Coast has a genetic variation is estimated to reach 43%. Results of measurement of environmental factors along the South Coast marine Malang Regency still at the limit of tolerance for Diadeama setosum .
| Item Type: | Thesis (Magister) |
|---|---|
| Identification Number: | TES/539.951 35/SIN/a/041102353 |
| Subjects: | 500 Natural sciences and mathematics > 539 Modern physics |
| Divisions: | S2/S3 > Magister Biologi, Fakultas MIPA |
| Depositing User: | Endro Setyobudi |
| Date Deposited: | 28 Jul 2011 13:11 |
| Last Modified: | 28 Jul 2011 13:11 |
| URI: | http://repository.ub.ac.id/id/eprint/157520 |
Actions (login required)
 |
View Item |