W, AndiKurniawanP (2016) Studi Filogenetik dan Zoogeografi Kadal Ekor Panjang (Takydromus sexlineatus) di Sumatra dan Jawa Berdasarkan Gen 16S rRNA. Sarjana thesis, Universitas Brawijaya.
Abstract
Kawasan Asia Tenggara mencakup hanya 4% dari total luas daratan bumi namun menjadi tempat tinggal flora dan fauna hampir 20-25% dari keseluruhan di bumi, serta menjadi hotspot biodiversitas utama dunia. Selama periode Pleistosen, pulau di Asia Tenggara telah dipengaruhi oleh fluktuasi iklim yang mengakibatkan perubahan geografis serta aktivitas peningkatan dan penurunan level laut. Hal tersebut berdampak pada pola distribusi suatu spesies. Salah satu spesies yang memiliki peranan penting secara ekologi di wilayah Asia Tenggara yaitu reptilia. Kadal ekor panjang atau Takydromus sexlineatus merupakan salah satu spesies yang persebarannya khusus di Asia Tenggara. Untuk mengetahui kekerabatan serta pola distribusi dari T. sexlineatus maka diperlukan analisis filogenetik secara molekuler. Sampel jaringan didapatkan dari Pulau Sumatra dan Jawa. Untuk mendapatkan gen terkonservasi pada mtDNA, maka digunakan gen 16S rRNA. Pada penelitian ini dilakukan 2 tahap. Pada tahap molekuler meliputi ekstraksi, amplifikasi, dan sekuensing DNA. Pada tahap analisis filogenetik meliputi rekonstruksi pohon filogenetik dengan analisis bootstrap dari Maximum-likelihood (ML), Maximum-Parsimony (MP), dan Bayesian Inference (BI). Hasilnya yaitu T.sexlineatus mengelompok menjadi dua populasi besar yaitu Jawa Timur - Jawa Tengah dan Jawa Tengah - Jawa Barat ˗ Sumatra. Terbentuknya dua populasi tersebut disebabkan oleh keadaan fisiografi, iklim, peningkatan permukaan air laut dan pergeseran lempeng tektonik yang menimbulkan diversitas genetik suatu spesies pada populasi yang berbeda.
| Item Type: | Thesis (Sarjana) |
|---|---|
| Identification Number: | SKR/MIPA/2016/220/051606826 |
| Subjects: | 500 Natural sciences and mathematics > 570 Biology |
| Divisions: | Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam > Biologi |
| Depositing User: | Yusuf Dwi N. |
| Date Deposited: | 16 Sep 2016 13:51 |
| Last Modified: | 16 Sep 2016 13:51 |
| URI: | http://repository.ub.ac.id/id/eprint/154732 |
Actions (login required)
 |
View Item |