Fajrin, MaulinaNur (2015) Filogenetik Dan Biogeografi Bancet Hijau (Occidozyga Lima) Di Jawa Dan Sumatera Menggunakan Gen 16s Rrna. Sarjana thesis, Universitas Brawijaya.
Abstract
Perbedaan kondisi ekologi pada wilayah persebaran Occidozyga lima (Bancet Hijau) diantaranya adalah di dua pulau yang termasuk dalam Sunda Besar yaitu Jawa dan Sumatera, menyebabkan spesies ini memiliki karakter morfologi yang bervariasi. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui kekerabatan antar spesies Occidozyga lima di Jawa dan Sumatra dan hubungannya dengan perubahan daratan Jawa dan Sumatra menggunakan gen 16s rRNA. Tahapan penelitian ini meliputi isolasi DNA sampel, amplifikasi, sekuensing, analisis perbedaan jarak sekuen dan analisis filogenetik menggunakan Maximum Parsimony (MP), Maximum Likelihood (ML) dan Bayesian Inference (BI) bootstrap 1000 kali dari hasil amplikon sekuen 16S rRNA. Hasil analisis filogenetik menunjukkan bahwa terbentuk populasi Jawa – Lampung yang merupakan sister species dengan O. lima asal Jawa, sedangkan populasi Medan merupakan sister species dari O. lima asal Malaysia, didukung dengan nilai bootstrap yang tinggi. Barrier geografis dan sejarah peristiwa alam mempengaruhi terbentuknya keragaman genetik akibat isolasi geografis yang dibuktikan dengan hasildivergensi jarak sekuenyang menunjukkan bahwa O. lima asal Jawa dan O. lima asal Malaysia merupakan spesies yang tidak identik atau berbeda. Keragaman genetik akibat perbedaan geografi populasi menyebabkan O. lima menjadi spesies yang tidak jelas atau spesies cryptic.
| Item Type: | Thesis (Sarjana) |
|---|---|
| Identification Number: | SKR/MIPA/2015/242/051505487 |
| Subjects: | 500 Natural sciences and mathematics > 570 Biology |
| Divisions: | Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam > Biologi |
| Depositing User: | Budi Wahyono Wahyono |
| Date Deposited: | 20 Aug 2015 14:13 |
| Last Modified: | 20 Aug 2015 14:13 |
| URI: | http://repository.ub.ac.id/id/eprint/154276 |
Actions (login required)
 |
View Item |