Antonius, Yulanda (2015) Penentuan Protein Kandidat Biomarker Kanker Nasofaring (Epstein-Barr Virus) Berdasarkan Analisis Interaksi Protein. Sarjana thesis, Universitas Brawijaya.
Abstract
Epstein-Barr Virus (EBV) merupakan virus yang termasuk dalam famili Human Papilloma Virus. Infeksi EBV terkait dalam beberapa macam penyakit, salah satunya yaitu kanker nasofaring. Kanker nasofaring merupakan tumor ganas yang menyerang jaringan epitel nasofaring. Penyakit ini seringkali hanya menunjukkan gejala umum sehingga sulit dideteksi. Penyakit tersebut spesifik berhubungan dengan ekspresi protein EBNA1, LMP1 dan LMP2. Beberapa metode diagnosis seperti tes darah dan saliva hanya mampu menunjukkan adanya titer virus di dalam darah tanpa menunjukkan penyakit spesifik terkait EBV, contohnya kanker nasofaring. Oleh karena itu, diperlukan suatu biomarker untuk mendeteksi penyakit kanker nasofaring secara spesifik. Identifikasi biomarker dapat dilakukan melalui pendekatan analisis protein menggunakan Topological Analysis, Modularity Analysis dan Functional Analysis. Selanjutnya, ekspresi setiap kandidat protein dikonfirmasi menggunakan data analisis microarray. Hasil analisis menunjukkan bahwa terdapat empat protein yang berpotensi sebagai kandidat biomarker yaitu RPA1, USP7, UBC dan TERF2. RPA1 merupakan protein yang paling berpotensi sebagai kandidat biomarker. Hal tersebut sesuai dengan hasil analisis yang menunjukkan bahwa RPA1 merupakan protein penting yang termasuk dalam fungsional modul serta memiliki perbedaan ekspresi yang cukup besar antara jaringan NPC dengan jaringan normal. Protein RPA1 terlibat pada proses siklus sel dalam mekanisme kanker nasofaring.
| Item Type: | Thesis (Sarjana) |
|---|---|
| Identification Number: | SKR/MIPA/2015/202/051504903 |
| Subjects: | 500 Natural sciences and mathematics > 570 Biology |
| Divisions: | Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam > Biologi |
| Depositing User: | Budi Wahyono Wahyono |
| Date Deposited: | 19 Aug 2015 14:22 |
| Last Modified: | 19 Aug 2015 14:22 |
| URI: | http://repository.ub.ac.id/id/eprint/154232 |
Actions (login required)
 |
View Item |