Permatasari, GaluhWening (2015) Desain Peptida Penghambat Kinerja Reseptor Insulin Sebagai Penginduksi Diabetes Melitus Tipe 2 pada Hewan Model Mencit (Mus musculus). Sarjana thesis, Universitas Brawijaya.
Abstract
Diabetes melitus tipe 2 (DM 2) merupakan penyakit metabolik yang berisiko menyerang setiap usia, dan diakibatkan oleh resistensi insulin. Beberapa penelitian mengenai DM 2 telah banyak dilakukan. Namun, peneliti terkendala dengan hewan model DM2. Peptida S961 mampu bekerja efektif menghambat pelekatan insulin sebagai inhibitor kompetitif, namun harga yang ditawarkan relatif mahal, tergolong protein tak stabil dan memiliki waktu paruh yang pendek. Maka dari itu, penelitian ini bertujuan untuk mendesain peptida modifikasi penginduksi DM 2 melalui penghambatan insulin reseptor yang lebih efektif, stabil serta memiliki paruh waktu yang panjang. Metode yang dilakukan meliputi pengumpulan data, permodelan protein, docking, modifikasi peptida berdasarkan waktu paruh, sifat hidrofobisitas, penyesuaian struktur sekunder, uji antigenisitas, visualisasi interaksi dan simulasi dinamika molekuler. Hasil modifikasi peptida menunjukkan karakteristik yang lebih baik dibanding peptida s961. Hal ini ditunjukkan dengan waktu paruh 100 jam, afinitas peptida sebesar lebih tinggi -95,1 ± 20, tingkat kestabilan peptida modifikasi yakni 28,17 dan berat molekul 4420,8 g/mol. Selain itu, hasil modifikasi menunjukkan tidak terdapat daerah antigenik dan nilai antigenisitas rendah yakni 0,978. Sisi ikatan peptida inhibitor dengan insulin reseptor dan sisi ikatan insulin dan insulin reseptor memiliki kesamaan yang mirip sebesar 70%. Hal ini didukung dengan kestabilan kompleks protein per satuan waktu (RMSD) dan per-residu (RMSF), energi potensial yang lebih baik daripada s961 saat dilakukan simulasi dinamika molekular. Hasil sekuen peptida modifikasi adalah VGSHNN EALYNNCGERGFPIFNGPFAGGLNTLANENAQQKR.Kesa maan struktur s961 dan peptida inhibitor memberikan peluang bahwa peptida hasil modifikasi memiliki kemampuan yang lebih baik ii daripada s961 untuk menghambat insulin reseptor dan menginduksi diabetes melitus tipe 2.
| Item Type: | Thesis (Sarjana) |
|---|---|
| Identification Number: | SKR/MIPA/2015/188/051504889 |
| Subjects: | 500 Natural sciences and mathematics > 570 Biology |
| Divisions: | Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam > Biologi |
| Depositing User: | Budi Wahyono Wahyono |
| Date Deposited: | 19 Aug 2015 11:14 |
| Last Modified: | 19 Aug 2015 11:14 |
| URI: | http://repository.ub.ac.id/id/eprint/154215 |
Actions (login required)
 |
View Item |