Hakin, Rikza (2014) Keragaman Genetis Tanaman Kenaf (Hibiscus Cannabinus L.) Kr 11 Hasil Mutasi Ems (Ethyl Methanesulfonate) Dengan Penanda Molekuler Dan Morfologi. Sarjana thesis, Universitas Brawijaya.
Abstract
Kenaf (Hibiscus cannabinus L.) merupakan sumber serat yang potensial untuk dimanfaatkan dalam dunia industri. Pemanfaatan kenaf dapat ditingkatkan dengan menghasilkan varietas baru kenaf yang menghasilkan biomassa tinggi, salah satunya menggunakan EMS. Tujuan penelitian ini ialah mengetahui keragaman kenaf mutasi EMS secara molekuler dan morfologi. Penelitian dilakukan menggunakan 6 genotip berbeda, yang terdiri dari satu tanaman kontrol (KR 11) dan 5 tanaman mutan. Metode untuk analisa molekuler dilakukan dengan isolasi DNA serta PCR dan sekuensing dua gen barcode, yaitu matK dan rbcL. Sedangkan analisa morfologi dilakukan dengan mengamati karakter kualitatif dan kuantitatif dari karakter daun, bunga maupun batang. Analisa molekuler pada gen matK tidak dapat dilakukan karena ketidakberhasilan proses amplifikasi dengan berbagai kombinasi. Sedangkan amplifikasi pada gen rbcL menunjukkan hasil positif pada 3 genotip yang digunakan, yaitu KR 11, mutan 2 dan mutan 5. Hasil sekuensing gen rbcL menunjukkan adanya 21 kejadian mutasi dan 18 di antaranya merupakan substitusi. Analisa Neighbor Joining menunjukkan bahwa mutan 2 memiliki similaritas paling rendah dengan KR 11 yang merupakan tanaman kontrol. Analisa morfologi yang diamati menunjukkan bahwa perbedaan character state antar genotip terjadi pada karakter tinggi tanaman, diameter batang atas, diameter batang bawah, diameter kayu bawah, jumlah nodus, panjang daun, lebar daun dan panjang tangkai daun. Uji similaritas yang dilakukan dengan Clad97 menunjukkan bahwa genotip mutan 4 memiliki diversitas tertinggi terhadap KR 11 dibandingkan genotip lainnya.
English Abstract
Kenaf (Hibiscus cannabinus L.) is one potential source of fiber plant. To increase production of kenaf plant can be done by construction of new varieties of kenaf that produce high biomass, such as mutation with EMS. The purpose of this study was to determine the genetic diversity of kenaf arised from EMS mutation in molecular and morphological analysis. The study was conducted using 6 different genotypes, KR 11 control and five different mutants. Molecular analysis performed by DNA isolation, PCR and sequencing two kinds of barcode gen, matK and rbcL. Observation of morphological characters was conducted on the qualitative and quantitative character of the leaves, flowers and stems characters. Molecular results indicated that matK gene can not be amplified with many combination. Positive result from rbcL amplification was showed in three different genotypes, KR 11, mutant 2 and mutant 5. Genetic diversity in rbcL gene sequences appeared in the presence of 22 mutations and 19 of them were nucleotide substitution. Most of substitution in rbcL gene sequences was transversion (86%). Neighbor Joining analysis showed that genotype mutant 2 had lowest similarity index with control. The observed morphological analysis based on Kenaf Characterization Guidance showed character state diversity on plant height, stem top diameter, bottom diameter, core bottom diameter, number of nodes, leaf length, leaf width and petiole length. Similarity test using Clad97 showed that mutant 4 had highest diversity index with control between other mutant.
| Item Type: | Thesis (Sarjana) |
|---|---|
| Identification Number: | SKR/MIPA/2014/29/051400754 |
| Subjects: | 500 Natural sciences and mathematics > 570 Biology |
| Divisions: | Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam > Biologi |
| Depositing User: | Budi Wahyono Wahyono |
| Date Deposited: | 10 Feb 2014 09:28 |
| Last Modified: | 21 Oct 2021 04:51 |
| URI: | http://repository.ub.ac.id/id/eprint/153919 |
Preview |
Text
Rikza_Hakin-Keragaman_Genetik_Kenaf_secara_Molekuler-Morfolo.pdf Download (5MB) | Preview |
Actions (login required)
 |
View Item |