Ulum, MuhammadBadiúl (2013) Analisis Struktur dan Interaksi Molekuler Enzim UGPase dengan Substrat UDP-Glukosa pada Tanaman Umbi Secara In-Silico. Sarjana thesis, Universitas Brawijaya.
Abstract
UGPase merupakan enzim kunci yang memengaruhi terbentuknya polisakarida dengan ikatan β 1-4. Interaksi enzim UGPase dengan subtrat (UDP-Glukosa) pada beberapa spesies tanaman umbi terdapat perbedaan. Berdasarkan hal itu, tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui interaksi UGPase dan UDP-G pada beberapa tanaman umbi dan mengetahui hubungan kekerabatan tanaman umbi berdasarkan sekuen gen UGPase. Hasil molecular docking menunjukkan interaksi catalytic domain dari enzim UGPase yang berikatan dengan UDP-G pada substrate binding loop, dengan total energi bebas pada Amorphophallus konjac paling rendah yaitu -5,06 kcal/mol diikuti oleh Ipomoea batatas dan Solanum tuberosum secara berturut-turut sebesar -4,60 dan -3,73 kcal/mol dan distabilkan dengan dua tipe interaksi yaitu interaksi elektrostatik dan hidrogen pada A. konjac dan I. Batatas, serta interaksi hidrofobik pada S. tuberosum. Fenogram menunjukkan bahwa I. batatas dan S. tuberosum berkerabat dekat, ditunjukkan dengan nilai similaritas sebesar 0,62. Sedangkan A. konjac tidak berkerabat dekat dengan I. batatas dan S. tuberosum.
| Item Type: | Thesis (Sarjana) |
|---|---|
| Identification Number: | SKR/MIPA/2013/130/051304722 |
| Subjects: | 500 Natural sciences and mathematics > 570 Biology |
| Divisions: | Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam > Biologi |
| Depositing User: | Hasbi |
| Date Deposited: | 16 May 2013 15:10 |
| Last Modified: | 25 Oct 2021 01:48 |
| URI: | http://repository.ub.ac.id/id/eprint/153390 |
Preview |
Text
M._Badiul_Ulum_0810910057.pdf Download (3MB) | Preview |
Actions (login required)
 |
View Item |