Christian, Nur (2011) Prediksi Kemampuan Insulin Receptor Pasien Diabetes Melitus Tipe-2 dalam Aktivasi Insulin Receptor Substrate-1 (IRS-1) Secara In Silico. Sarjana thesis, Universitas Brawijaya.
Abstract
Insulin receptor (hINSR) termasuk protein Insulin Receptor Family yang memiliki aktivitas kinase intraseluler dalam mengkontrol kadar glukosa darah. Penelitian ini bertujuan untuk memprediksi kemampuan tirosin kinase hINSR pasien DM tipe-2 pada aktivasi IRS-1 berbasis in silico. Metode yang dilakukan meliputi; penjajaran sekuen gen tirosin kinase hINSR dari DNA darah pasien Diabetes Melitus Tipe-2 (DMK9-3F dan 8-3F) dengan software Bioedit version 5.0.6, prediksi struktur tiga dimensi dengan dari Swiss model server, superimpose dilakukan dengan program Pymol 0.99rc6 dan Hex 5.0, dan docking dengan software Hex 5.0. Hasil penelitian menunjukkan satu substitusi dan satu delesi gen tirosin kinase hINSR ekson 22 mutan 8-3F mengakibatkan pengurangan empat lengkung heliks dan tiga koil, sedangkan enam delesi dan enam substitusi pada mutan DMK9-3F menyebabkan perubahan dua lengkung heliks menjadi koil. Perubahan struktur tersebut juga mempengaruhi bagian lain dari protein serta topologi permukaan protein secara keseluruhan. Perubahan tersebut mampu mempengaruhi interaksi tirosin kinase hINSR dengan IRS-1. Hasil docking menunjukkan dibandingkan dengan normal (E=-494,67 kJ/mol), mutan DMK9-3F (E=-458,4 kJ/mol) sedikit lebih sukar membentuk interaksi, sedangkan mutan 8-3F (E=-544,20 kJ/mol) justru lebih spontan membentuk interaksi dibandingkan dengan normal dan mutan DMK9-3F. Meskipun interaksi dapat terjadi secara spontan namun terjadi pengurangan aktivasi IRS-1. Tidak berperannya residu tirosin dalam interaksi diduga sebagai penyebab hambatan aktivasi sinyaling intraseluler insulin yang ditunjukkan dengan gangguan metabolisme glukosa pada pasien. Peneliti juga menduga kondisi prognosis pasien DMK9-3F lebih baik dibandingkan dengan pasien 8-3F.
| Item Type: | Thesis (Sarjana) |
|---|---|
| Identification Number: | SKR/MIPA/2011/114/051102222 |
| Subjects: | 500 Natural sciences and mathematics > 570 Biology |
| Divisions: | Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam > Biologi |
| Depositing User: | Unnamed user with email repository.ub@ub.ac.id |
| Date Deposited: | 03 Aug 2011 10:01 |
| Last Modified: | 22 Oct 2021 07:14 |
| URI: | http://repository.ub.ac.id/id/eprint/152566 |
Preview |
Text
051102222.pdf Download (3MB) | Preview |
Actions (login required)
 |
View Item |