The Comparison of discrete sine transform (dst) and principle component analysis (pca) to reduce variable in cluster analysis in microarray data

PrimaAdityawardani (2009) The Comparison of discrete sine transform (dst) and principle component analysis (pca) to reduce variable in cluster analysis in microarray data. Sarjana thesis, Universitas Brawijaya.

Abstract

Microarray merupakan teknologi percobaan baru dalam mempelajari gen dengan mengukur aktivitas atau tingkat ekspresi gen-gen pada waktu yang berbeda-beda. Masalah utama dalam analisis microarray adalah banyaknya peubah pada data microarray , di mana peubah-peubah tersebut saling berkorelasi. Untuk mengekstraksi komponen penting data dan sebagai analisis sebelum melakukan pengelompokan, teknik pereduksian peubah seperti Discrete Sine Transform (DST) dan Analisis Komponen Utama (AKU) sangat penting dilakukan. Untuk mengetahui perbandingan kedua metode tersebut, digunakan dua data penelitian, yaitu data gen jamur yang sedang bersporulasi dan data respon gen pada akar Arabidopsis terhadap Systemic Acquired Resistance (SAR). Setelah mereduksi peubah asal, kemudian dilakukan analisis kelompok. Berdasarkan nilai Cluster Tightness Measure (CTM) kedua metode yang hampir sama, maka dapat disimpulkan bahwa DST dan AKU dapat digunakan untuk mereduksi peubah.

Item Type:	Thesis (Sarjana)
Identification Number:	SKR/MIPA/2009/208/050902246
Subjects:	500 Natural sciences and mathematics > 510 Mathematics
Divisions:	Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam > Matematika
Depositing User:	Unnamed user with email heriprayitno@ub.ac.id
Date Deposited:	14 Aug 2009 10:07
Last Modified:	22 Oct 2021 06:42
URI:	http://repository.ub.ac.id/id/eprint/152166

	Text 050902246.pdf Download (2MB)
	Other (Thumbnails conversion from text to thumbnail_lightbox) lightbox.jpg Download (32kB)
	Other (Thumbnails conversion from text to thumbnail_preview) preview.jpg Download (13kB)
	Other (Thumbnails conversion from text to thumbnail_medium) medium.jpg Download (4kB)
	Other (Thumbnails conversion from text to thumbnail_small) small.jpg Download (1kB)

Actions (login required)

View Item