Klasifikasi filogenetik subfamilia Bovinae berdasarkan subtitusi sekuens gen Cytochrome b

DwiWahyuIndriati (2007) Klasifikasi filogenetik subfamilia Bovinae berdasarkan subtitusi sekuens gen Cytochrome b. Sarjana thesis, Universitas Brawijaya.

Abstract

Subfamilia Bovinae didominasi oleh spesies yang telah didomestikasi. Studi filogenetik subfamilia ini dilakukan dengan menggunakan marker gen cytochorme b. Proses mutasi yang terjadi pada sekuens gen cytochrome b akan menyebabkan adanya subtitusi pada basanya. Penelitian ini bertujuan untuk melihat klasifikasi subfamilia Bovinae dengan menggunakan data subtitusi yang terjadi pada gen cytochrome b. Sekuens gen cytochrome b diperoleh dari situs NCBI (National Center for Biotechnology Information). Setelah itu, sekuens pada daerah yang homologus disejajarkan dan hasil alignment itu digunakan sebagai dasar penyusunan pohon filogenetik dengan menggunakan analisis Bayesian dengan model kodon NY98. Berdasarkan hasil analisis subtitusi pada cytochrome b, klasifikasi filogenetik subfamilia Bovinae ini dibagi menjadi tiga kelompok tribe yaitu Boselaphini, Tragelaphini, Bovini. Konstruksi filogenetik yang monofiletik ditunjukkan oleh tribe Boselaphini (genus Boselaphus dan Tetracerus) dan tribe Tragelaphini (genus Tragelaphus dan Taurotragus). Tribe Boselaphini memiliki hubungan kekerabatan yang dekat dengan tribe Bovini sedangkan tribe Tragelaphini terpisah dari dua tribe tersebut. Tribe Bovini dibagi ke dalam tiga subtribe yaitu subtribe bovina (genus Bison dan Bos) serta subtribe bubalina (genus Bubalus dan Syncerus).

Item Type: Thesis (Sarjana)
Identification Number: SKR/MIPA/2007/050702006
Subjects: 500 Natural sciences and mathematics > 510 Mathematics
Divisions: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam > Matematika
Depositing User: Unnamed user with email repository.ub@ub.ac.id
Date Deposited: 08 Aug 2007 00:00
Last Modified: 22 Oct 2021 03:21
URI: http://repository.ub.ac.id/id/eprint/151615
[thumbnail of 050702006.pdf]
Preview
Text
050702006.pdf

Download (2MB) | Preview

Actions (login required)

View Item View Item