Sabilillah, Muhammad Syahidan Fii (2018) Karakterisasi Molekuler Bakteri Yang Berasosiasi Dengan Karang Montipora Foliosa Yang Terkena Penyakit White Syndrome Di Perairan Cagar Alam Pulau Sempu, Kabupaten Malang. Sarjana thesis, Universitas Brawijaya.
Abstract
Penyakit pada karang dapat terjadi ketika kondisi dari karang dalam kondisi yang rentan dan mudah untuk diserang oleh organisme yang ada di dalam perairan. Karang dalam perairan mudah untuk terinfeksi oleh bakteri yang menyebabkan terjadinya syndrome pada karang. Karang yang terinfeksi bakteri dan terkena penyakit white syndrome akan memiliki tanda-tanda bercak putih pada bagian skeleton karang juga hilangnya jaringan dari polyp karang yang menyebabkan terjadinya kematian pada koloni atau kematian sebagian pada koloni karang. Penelitian ini dilakukan untuk mengetahui bakteri apa saja yang ada ketika karang terinfeksi penyakit WS. Pengambilan sampel dilakukan pada jenis karang Montipora yang terjangkit penyakit WS yang dimana diambil pada 3 koloni karang Montipora dengan spesies yang sama pada bulan juni dengan mentatah bagian karang yang terkena WS. Sampel kemudian dihaluskan dan ditimbang 1gr lalu dijadikan larutan stok setiap koloninya. Kemudian dilakukan pengenceran bertingkat pada setiap koloni karang mulai dari 10-1-10-5 dilakukan penanaman pada setiap pengenceran 10-3-10-5 bakteri ditanam pada media agar Zobell 2261E (Peptone, Yeast Extract, Agar, air laut steril) memakai metode spread dan dipindahkan pada media yang sama dengan metode gores pada 4 kuadran untuk menghasilkan bakteri murni. Dilakukan pengkategorian bakteri dengan kategori ukuran, elevasi, margin, bentuk, dan warna. Ditemukan 11 bakteri dengan kategori yang berbeda. Bakteri selanjutnya dipindahkan pada media agar Zobell 2261E miring menggunakan cotton swap. Pada proses agar miring menumbuhkan 8 bakteri isolat. Bakteri dipindahkan ke media Zobell cair menggunakan jarum ose yang kemudian di inkubasi 2 x 24 jam untuk melakukan peremajaan pada bakteri. Studi molecular dilakukan pada 8 sampel bakteri untuk dilakukan proses ekstraksi DNA, PCR, elektroforesis, dan sekuensing serta pengujian BLAST (Basic Local Alignment Search Too) untuk mengetahui informasi genetic pada setiap sampel. Pengujian isolasi dan purifikasi yang di lakukan pada 3 koloni karang yang terinfeksi WS didapatkan 8 sampel bakteri. Hasil dari pengujian BLAST yang dilakukan untuk mengetahui kesamaan dengan strain bakteri yang ada di GenBank menunjukan bahwa bakteri isolat M.1.1.A memiliki nilai kesamaan 92% dengan bakteri Pseudomonas mendocina strain PM20 dengan M.1.1.B 85% dengan bakteri Pseudomonas sp YX8., isolat bakteri M.1.1.C memiliki nilai identifikasi 89% adalah bakteri Pseudomonas sp YX4. isolat bakteri M.1.3.G 93% dari uji BLAST adalah Pseudomonas sp V7,isolat bakteri M.1.2.H Pseudomonas aeruginosa strain ZJY-320 memiliki nilai identifikasi 95%, M.1.1.D dengan nilai identifikasi 99% adalah Pseudomonas Sp. B8, isolat bakteri M.3.1.J memiliki nilai identifikasi 91% menunjukan bakteri Pseudomonas aeruginosa strain P60 dan, isolat bakteri M.1.2.I dengan nilai identifikasi 97% adalah bakteri Halomonas sp. JL703 menurut smith (1999) bakteri Pseudomonas sp mengalami peningkatan ketika karang dalam proses pemulihan. Sedangkan Bakteri Halomonas sp. merupakan bakteri perairan yang tersebar luas mulai dari periaran dangkal maupun pada perairan yang ekstrem (Asy’ari et al., 2014
English Abstract
-
| Item Type: | Thesis (Sarjana) |
|---|---|
| Identification Number: | SKR/FPR/2018/803/051810777 |
| Uncontrolled Keywords: | Karakterisasi Molekuler Bakteri, Karang Montipora Foliosa, Penyakit White Syndrome, Penyakit Karang |
| Subjects: | 500 Natural sciences and mathematics > 551 Geology, hydrology, meteorology > 551.4 Geomorphology and hydrosphere > 551.42 Islands and reefs > 551.424 Reefs |
| Divisions: | Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan > Pemanfaatan Sumberdaya Perikanan dan Kelautan |
| Depositing User: | Sugeng Moelyono |
| Date Deposited: | 20 Mar 2019 03:33 |
| Last Modified: | 20 Mar 2019 03:33 |
| URI: | http://repository.ub.ac.id/id/eprint/13798 |
Actions (login required)
 |
View Item |