Analisis Keragaman Filogenetik Bakteri Asam Laktat Asal Feses Orangutan (Pongo pygmaeus) Berdasarkan Sekuen 16s rRNA

Azhar, AdindaDarayani (2016) Analisis Keragaman Filogenetik Bakteri Asam Laktat Asal Feses Orangutan (Pongo pygmaeus) Berdasarkan Sekuen 16s rRNA. Sarjana thesis, Universitas Brawijaya.

Abstract

Bakteri Asam Laktat (BAL) adalah salah satu probiotik yang terdapat dalam saluran pencernaan dan memiliki kemampuan untuk melawan bakteri patogen. Penggunaan probiotik diharapkan dapat menjadi pilihan utama dalam menangani kasus penyakit gangguan pencernaan khususnya pada primata. Metode molekuler untuk klasifikasi dan identifikasi bakteri berdasarkan filogenetik menggunakan parameter yang tidak bergantung pada kondisi pertumbuhan dan media yang digunakan sehingga mampu menghasilkan hasil yang lebih akurat. Metode molekuler untuk klasifikasi dan identifikasi bakteri yang umumnya digunakan saat ini adalah analisis sekuen gen 16s rRNA atau 23s rRNA. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui karakteristik molekuler dan kekerabatan bakteri asam laktat asal feses orangutan berdasarkan analisa sekuen 16s rRNA. Isolat bakteri yang digunakan berasal dari penelitian Prasthani (2012) yang diambil dari Taman Safari Indonesia (TSI) II Prigen-Pasuruan sebanyak enam sampel. Karakterisasi BAL dilakukan secara molekuler dengan amplifikasi gen 16s rRNA dengan teknik PCR menggunakan primer universal 16s rRNA. Analisa sekuen dilakukan dengan metode BLAST melalui National Center for Biotechnology Information (NCBI) (online) untuk mengetahui profil kekerabatan (filogenetik) antara hasil sekuensing dengan gen BAL yang berada di Gene Bank. Hasil penelitian menunjukan BAL hasil isolasi feses orangutan dari enam sampel berdasarkan sekuen 16s rRNA merupakan Pediococcus sp., Enterococcus sp., Lactobacillus acidophilus, dan Lactobacillus casei. Analisis filogeni menunjukkan bahwa spesies BAL yang diisolasi dari feses orangutan merupakan ingroup dan memiliki kekerabatan yang dekat.

Item Type: Thesis (Sarjana)
Identification Number: SKR/FKH/2016/66/051610774
Subjects: 600 Technology (Applied sciences) > 636 Animal husbandry > 636.08 Specific topics in animal husbandry > 636.089 Veterinary medicine
Divisions: Fakultas Kedokteran Hewan > Kedokteran Hewan
Depositing User: Nur Cholis
Date Deposited: 08 Nov 2016 14:35
Last Modified: 20 Oct 2021 03:03
URI: http://repository.ub.ac.id/id/eprint/127211
[thumbnail of COVER.pdf]
Preview
Text
COVER.pdf

Download (1MB) | Preview
[thumbnail of BAB_VI_KESIMPULAN_DAN_SARAN.pdf]
Preview
Text
BAB_VI_KESIMPULAN_DAN_SARAN.pdf

Download (1MB) | Preview
[thumbnail of LAMPIRAN.pdf]
Preview
Text
LAMPIRAN.pdf

Download (1MB) | Preview
[thumbnail of BAB_I_PENDAHULUAN.pdf]
Preview
Text
BAB_I_PENDAHULUAN.pdf

Download (1MB) | Preview
[thumbnail of BAB_V_PEMBAHASAN.pdf]
Preview
Text
BAB_V_PEMBAHASAN.pdf

Download (1MB) | Preview
[thumbnail of DAFTAR_PUSTAKA.pdf]
Preview
Text
DAFTAR_PUSTAKA.pdf

Download (1MB) | Preview
[thumbnail of BAB_II_TIPUS.pdf]
Preview
Text
BAB_II_TIPUS.pdf

Download (1MB) | Preview
[thumbnail of BAB_III_KERANGKA_KONSEP.pdf]
Preview
Text
BAB_III_KERANGKA_KONSEP.pdf

Download (1MB) | Preview
[thumbnail of BAB_IV_METODE_PENELITIAN.pdf]
Preview
Text
BAB_IV_METODE_PENELITIAN.pdf

Download (1MB) | Preview

Actions (login required)

View Item View Item