Clustering Pasien Kanker Berdasarkan Struktur Protein Dalam Tubuh Menggunakan Metode K-Medoids

Rizby, Laily Putri (2018) Clustering Pasien Kanker Berdasarkan Struktur Protein Dalam Tubuh Menggunakan Metode K-Medoids. Sarjana thesis, Universitas Brawijaya.

Abstract

Kanker merupakan penyakit yang kerap menjadi momok bagi sebagian besar orang memang telah memakan banyak korban. Semakin berkembangnya zaman semakin banyak virus yang tersebar di masyarakat. Kanker adalah istilah yang digunakan untuk mengGambarkan ratusan penyakit berbeda dengan fitur tertentu yang sama. Kanker dimulai dengan perubahan dalam struktur dan fungsi sel yang menyebabkan sel membelah dan menggandakan diri tanpa terkontrol. Umumnya kanker dinamai sesuai organ dan jenisnya tempat pertama kali ia berkembang. Mutasi gen yang paling sering ditemukan pada kanker manusia adalah Gen P53. Gen P53 merupakan gen penekan tumor yang mengkode atau mengekspresikan protein 53. Dari berbagai banyak data yang ada perlu dilakukan proses klusterisasi yaitu pengelompokkan jenis kanker berdasarkan kelasnya. Salah satu metode klustering yang mulai banyak digunakan adalah metode K-Medoids. K-medoids atau dikenal pula dengan PAM (Partitioning Around Medoids) menggunakan metode partisi clustering untuk mengelompokkan sekumpulan n objek menjadi sejumlah k cluster. Algoritma ini menggunakan objek pada kumpulan objek untuk mewakili sebuah cluster. Objek yang terpilih untuk mewakili sebuah cluster disebut medoid. Pada penelitian clustering pasien kanker menggunakan metode K-Medoids ini menunjukkan nilai persentase kualitas cluster sebesar 77% pada percobaan pada nilai k 14 dan menggunakan 116 data.

English Abstract

Cancer is a disease that often becomes a scourge for most people has indeed taken many victims. In this era, more viruses are scattered in the community. Cancer is a term used to describe hundreds of different diseases with the same particular features. Cancer begins with changes in the structure and function of cells that cause cells to divide and multiply uncontrollably. Cancer is generally named after the organ and its type where it first developed. The most common mutation of genes found in human cancers is the P53 Genes. The P53 gene is a tumor suppressor gene that encodes or expresses protein 53. From a wide range of data there is a clustering process that classifies types of cancer by its class. One of the most widely used methods of clustering is the K-Medoids method. K-medoids or also known as PAM (Partitioning Around Medoids) using the clustering partition method to group a set of n objects into a number of cluster k. This algorithm uses objects on a collection of objects to represent a cluster. The object chosen to represent a cluster is called the medoid. In clustering research, cancer patients using K-Medoids method showed cluster quality percentage of 77% in experiments at k 14 and using 116 data.

Item Type: Thesis (Sarjana)
Identification Number: SKR/FTIK/2018/37/051800818
Uncontrolled Keywords: Clustering, K-Medoids, Kanker, Protein Tubuh, Silhouette Coefficient
Subjects: 000 Computer science, information and general works > 005 Computer programming, programs, data > 005.4 Systems programming and programs > 005.43 Systems programs
Divisions: Fakultas Ilmu Komputer > Teknik Informatika
Depositing User: Yusuf Dwi N.
Date Deposited: 28 Jun 2018 07:31
Last Modified: 26 Oct 2021 09:14
URI: http://repository.ub.ac.id/id/eprint/11744
[thumbnail of BAB VII.pdf]
Preview
Text
BAB VII.pdf

Download (263kB) | Preview
[thumbnail of Bagian Depan.pdf]
Preview
Text
Bagian Depan.pdf

Download (676kB) | Preview
[thumbnail of Daftar Pustaka.pdf]
Preview
Text
Daftar Pustaka.pdf

Download (265kB) | Preview
[thumbnail of BAB VI.pdf]
Preview
Text
BAB VI.pdf

Download (327kB) | Preview
[thumbnail of BAB V.pdf]
Preview
Text
BAB V.pdf

Download (795kB) | Preview
[thumbnail of BAB I.pdf]
Preview
Text
BAB I.pdf

Download (285kB) | Preview
[thumbnail of BAB II.pdf]
Preview
Text
BAB II.pdf

Download (510kB) | Preview
[thumbnail of BAB III.pdf]
Preview
Text
BAB III.pdf

Download (278kB) | Preview
[thumbnail of BAB IV.pdf]
Preview
Text
BAB IV.pdf

Download (1MB) | Preview

Actions (login required)

View Item View Item