Saputra, Dani Adi (2017) Studi Genetika Aksesi F1 Hasil Persilangan Konvensional Jeruk Siam Mamuju (Citrus nobilis). Sarjana thesis, Universitas Brawijaya.
Abstract
Jeruk adalah komoditas buah-buahan yang menjanjikan bagi masyarakat Indonesia. Data ekspor dan impor jeruk di Indonesia menunjukkan pada tahun 2015 kebutuhan impor jeruk yang didatangkan dari luar negeri sebesar 106.140 ton. Jenis jeruk Siam Mamuju memiliki potensi yaitu dari segi kualitas rasa dan kemampuan tumbuh tanaman yang dapat diperbanyak pada dataran rendah (lahan gambut) maupun dataran tinggi. Identifikasi morfologi dan molekuler merupakan tahapan akhir dari proses seleksi tanaman jeruk. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui keragaman pada aksesi dan mendapat informasi proporsi sifat genetik yang diwariskan dari kedua tetua pada tiap aksesi F1 hasil persilangan. Hipotesis yang digunakan adalah kontribusi tetua betina lebih besar dibanding kedua tetua jantan pada 2 persilangan jeruk dengan analisa secara morfologi dan molekuler. Penelitian ini telah dilaksanakan di Laboratorium Pemuliaan Balai Penelitian Tanaman Jeruk dan Buah Subtropika (BALITJESTRO) Tlekung, Kecamatan Junrejo Kota Batu, Jawa Timur pada bulan Maret-Juni 2017. Alat yang digunakan antara lain: mortar, pestel, gelas ukur, erlenmeyer, timer, breaker glass, stirer, mikropipet, timbangan analitik, vortex, tabung eppendorf, mesin spektrofotometer, autoclave, waterbath, mesin centrifuge, mesin elektroforesis, mesin PCR dan alat Biodoc Analize. Bahan yang digunakan adalah 40 aksesi tanaman jeruk F1 (hasil persilangan konvensional yaitu Soe (♂) X Siam Mamuju X; Satsuma (♂) X Siam Mamuju (♀)) dan digunakan 3 tetua sebagai kontrol yaitu Siam Mamuju, Keprok Soe, Keprok Satsuma. Bahan kimia yang digunakan yaitu Buffer ekstraksi (CTAB, NaCl, Tris HCl pH 8.0, EDTA), Merkaptoethanol, PVP, CHISAM (Chloroform, Isoamilalkohol), buffer pencuci, buffer TE, RNAse, ethanol, isopropanol, DNA lambda, DNA ladder, ddH2O, agarosa, buffer elektroforesis (TAE/TBE), loading dye, ethidium bromida dan menggunakan 6 primer terdiri dari SSR (TAA15, CAT01, TAA41) dan ISSR (ISSR 3, ISSR 7, ISSR 8). Data yang diperoleh dianalisis secara deskriptif berdasarkan cluster untuk melihat kedekatan tiap aksesi pada ketiga tetua. Hasil identifikasi pada 40 aksesi dengan masing-masing tetua menunjukkan terdapat keragaman. Secara morfologi kuantitatif aksesi P5 hasil persilangan Siam Mamuju dan Satsuma menunjukkan ke 20 aksesi berbeda dengan kedua tetua, pada aksesi P6 menujukkan terdapat 17 aksesi yang dekat dengan tetua Soe, dan 3 aksesi dekat dengan tetua Siam Mamuju. Secara morfologi kualitatif terdapat 9 aksesi P5 yang dekat dengan tetua Siam Mamuju dan 11 aksesi berbeda dengan kedua tetua, pada aksesi P6 menunjukkan 10 aksesi dekat dengan tetua Soe dan 10 aksesi yang dekat dengan tetua Siam Mamuju. Hasil identifikasi molekuler menunjukkan bahwa ke 20 aksesi P5 dekat tetua siam Mamuju dan 20 aksesi P6 juga dekat dengan tetua Siam Mamuju. Diketahui dari seluruh hasil identifikasi bahwa tetua Siam Mamuju memiliki proporsi sifat dominan secara genetik pada 40 aksesi F1.
English Abstract
Orange is a promising fruit commodity for the Indonesian people. Data on exports and imports of oranges in Indonesia indicate in 2015 the need for imported citrus imports from abroad amounted to 106,140 tons. Types of Siam Mamuju oranges have the potential that is in terms of flavor quality and the ability to grow plants that can be propagated in the lowlands and peatlands. The morphological and molecular identification is the final stage of the orange crop selection process which is expected to have the result of crossing with the same proportion between the two elders (male and female breeds), and later can be propagated for the next stage of formation of new superior varieties. The purpose of this study is to determine the diversity of accession and get information on the proportion of genetic traits inherited from the two elders in each accession F1 of the crossing. The hypothesis used is the contribution of female elders greater than the two male elders in 2 citrus crosses with morphological and molecular analysis. This research was conducted at Breeding Laboratory of Citrus and Subtropical Fruits Research Institute (BALITJESTRO) Tlekung, Junrejo Sub- District, Batu City, East Java in March-June 2017. The tools used are: mortar, pestel, measuring cup, erlenmeyer, timer, breaker glass, stirer, micropipet, analytical scale, vortex, eppendorf tube, spectrophotometer machine, autoclave, waterbath, centrifuge machine, electrophoresis machine, PCR machine and Biodoc Analize tool. The materials used were 40 accessions of the F1 oranges (the conventional crosses were (♂) X Siam Mamuju X; Satsuma (♂) X Siam Mamuju (♀)) and used 3 elders as controls ie Siam Mamuju, Keprok Soe, Keprok Satsuma. Chemicals used are Extraction Buffers (CTAB, NaCl, Tris HCl pH 8.0, EDTA), Merkaptoethanol, PVP, CHISAM (Chloroform, Isoamilalkohol), buffer wash, TE buffer, RNAse, ethanol, isopropanol, DNA lambda, DNA ladder, ddH2O , agarose, electrophoretic buffer (TAE / TBE), loading dye, ethidium bromide and using 6 primers consisting of SSR (TAA15, CAT01, TAA41) and ISSR (ISSR 3, ISSR 7, ISSR 8). The data obtained were analyzed descriptively based on the cluster to see the proximity of each accession to the three elders. The identification result on 40 accessions with each elder indicates diversity. The quantitative morphology of accession P5 of the Siam Mamuju and Satsuma crosses indicates to 20 different accessions with the two elders, the accession P6 indicates that there are 17 accessions close to the Soe elders, and 3 accessions close to the Siamese parent Mamuju. In qualitative morphology there are 9 accessions of P5 close to the Siam Mamuju parent and 11 different accessions with both elders, at accession P6 showing 10 accessions close to the Soe elder and 10 accessions close to Siam Mamuju elders. The molecular identification results indicate that access to P5 near the Mamuju siam and 20 accessions of P6 is also close to Siam Mamuju's elders. It is known from all the identification results that Siam Mamuju elders have a genetic dominant proportion of genes on 40 accessions of F1.
| Item Type: | Thesis (Sarjana) |
|---|---|
| Identification Number: | SKR/FP/2017/1042/051801337 |
| Subjects: | 600 Technology (Applied sciences) > 634 Orchards, fruits, forestry > 634.3 Citrus and moraceous fruits > 634.31 Oranges |
| Divisions: | Fakultas Pertanian > Budidaya Pertanian |
| Depositing User: | Yusuf Dwi N. |
| Date Deposited: | 06 Feb 2018 07:01 |
| Last Modified: | 26 Oct 2021 07:41 |
| URI: | http://repository.ub.ac.id/id/eprint/8735 |
Preview |
Text
A. f) Ucapan Terima Kasih.pdf Download (7kB) | Preview |
Preview |
Text
A. h) Kata Penghantar.pdf Download (74kB) | Preview |
Preview |
Text
A. i) Daftar Isi.pdf Download (89kB) | Preview |
Preview |
Text
A. j) Daftar Tabel.pdf Download (147kB) | Preview |
Preview |
Text
A. g) Abstrak.pdf Download (61kB) | Preview |
Preview |
Text
A. k) Daftar Gambar.pdf Download (151kB) | Preview |
Preview |
Text
A. l) Daftar Lampiran.pdf Download (83kB) | Preview |
Preview |
Text
BAB I.pdf Download (93kB) | Preview |
Preview |
Text
BAB II.pdf Download (192kB) | Preview |
Preview |
Text
BAB III.pdf Download (183kB) | Preview |
Preview |
Text
BAB IV.pdf Download (886kB) | Preview |
Preview |
Text
BAB V.pdf Download (69kB) | Preview |
Preview |
Text
Bagian Depan.pdf Download (984kB) | Preview |
Preview |
Text
Daftar Pustaka.pdf Download (184kB) | Preview |
Preview |
Text
H. Lampiran.pdf Download (724kB) | Preview |
Preview |
Text
A. a) Judul Skripsi.pdf Download (101kB) | Preview |
Preview |
Text
A. a) Cover.pdf Download (42kB) | Preview |
Preview |
Other
A. b) Lembar Pengesahan.PDF Download (354kB) | Preview |
Preview |
Text
A. c) Identitas Penguji.pdf Download (85kB) | Preview |
Preview |
Text
A. d) Pernyataan Orsinilitas.pdf Download (4kB) | Preview |
Preview |
Text
A. e) Riwayat Hidup.pdf Download (146kB) | Preview |
Actions (login required)
 |
View Item |