Ayuwanti, Agnes Arimbi (2019) Identifikasi Gen Pertumbuhan Panjang Rambut Kelinci (Oryctolangus Cuniculus) Ras American Fuzzy Lop Dan Rex Berdasarkan Sequence Gen LHX2 (LIM Homeobox 2) Dengan Metode Polymerase Chain Reaction (PCR). Sarjana thesis, Universitas Brawijaya.
Abstract
Kelinci (Oryctolagus cuniculus) ras American Fuzzy Lop dan Rex merupakan kelinci hias yang cukup banyak dipelihara. Kedua kelinci tersebut memiliki perbedaan panjang rambut, dimana kelinci American Fuzzy Lop memiliki rambut panjang sedangkan kelinci Rex memiliki rambut pendek. Perbedaan panjang ini dapat dipengaruhi salah satunya oleh ekspresi gen LIM Homeobox 2 (Lhx2). LIM Homeobox 2 (Lhx2) termasuk ke dalam DNA inti yang merupakan gen pengontrol pertumbuhan panjang rambut. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui adanya perbedaan sekuen gen Lhx2 pada Kelinci American Fuzzy Lop dan Rex dengan metode PCR. Sampel yang digunakan adalah DNA yang di isolasi dari sampel darah kelinci American Fuzzy Lop dan Rex menggunakan QIAamp® DNA Mini Kit. Primer yang digunakan pada metode PCR adalah sepasang primer forward dan reverse. Primer forward 5’- CTG AAC GGC AGG AGA AAG AC -3’ dan primer reverse 5’- CAT CCA CGC CGT TGT AGT AAG GA -3’. Hasil dari proses PCR nantinya akan dilakukan sekuensing menggunakan metode Sanger. Sekuen gen dan asam amino tersebut akan dianalisa menggunakan software Bioedit dan NCBI BLAST. Terdapat perubahan sekuen gen Lim homeobox 2 (Lhx2) pada kelinci Rex, dan American Fuzzy Lop yaitu Rex1 dan Rex 2 urutan nukleotida ke 18 dan sampel AFL1, AFL2, Rex1, Rex2 pada urutan nukleotida ke 1,2,3 dan 21 menujukan adanya gap (garis putus) menunjukkan bahwa terjadi mutasi gen serta terdapat mutasi transisi dan transversi pada urutan 170-180 Analisa sekuen gen Lhx2 terdapat dua perbedaan basa antara keempat sampel dan database. Adanya pergantian basa pada sekuen keempat sampel tersebut merupakan silent mutation karena tidak mengubah struktur asam amino gen Lhx2 sehingga perubahan sekuen DNA Lhx2 yang terjadi pada sampel AFL1, AFL2, Rex1 dan Rex2 tidak merubah ekspresi dari gen Lhx2. Dapat disimpukan bahwa sekuen gen Lhx2 yang dipilih bukan merupakan sekuen yang dapat mempengaruhi morfogenesis pertumbuhan rambut secara langsung Hal ini bukan disebabkan kurang spesifiknya gen yang digunakan sebagai indikator dalam perbedaan panjang pendeknya rambut, melainkan hal tersebut juga dapat dipengaruhi oleh multiple gen yaitu gen shh yang terekspresi pada fase anagen saja
English Abstract
Rabbits (Oryctolagus cuniculus) American Fuzzy Lop and Rex have different lengths of hair, where American Fuzzy Lop rabbits have long hair while Rex rabbits have short hair. This difference in length can be affected either by the expression LIM gene Homeobox 2 (Lhx2). LIM Homeobox 2 (Lhx2) is included in the DNA nucleus which is the hair length growth control gene. This study aims to determine the differences in Lhx2 gene sequences of American Fuzzy Lop and Rex rabbits by PCR method. The sample used was DNA obtained from isolation of American Fuzzy Lop and Rex rabbit blood samples using QIAamp® DNA Mini Kit. The primers used in the PCR method are a pair of forward and reverse primers. Primary forwarded 5'- CTG AAC GGC AGG AGA AAG AC-3 'and the reverse 5'- CAT CCA CGT AGT AGT AAG GA-3 reverse primer.There is a change in the sequence of Lim homeobox 2 (Lhx2) gene in Rex and American Fuzzy Lop rabbits, namely Rex1 and Rex 2 to the 18th nucleotide sequence and samples of AFL1, AFL2, Rex1, Rex2 on the nucleotide sequence 1,2,3 and 21 indicate a gap dashed line shows that there is a gene mutation and there are transitions and transversion mutations in the order of 170-180 Analysis of the Lhx2 gene sequence there are two base differences between the four samples and the database. The change of bases in the four sample sequences is silent mutation because it does not change the structure of the amino acid Lhx2 gene so that changes in the Lhx2 DNA sequence that occur in AFL1, AFL2, Rex1 and Rex2 samples do not change the expression of the Lhx2 gene. It can be concluded that the selected Lhx2 gene sequence is not a sequence that can directly affect the morphogenesis of hair growth. This is not due to the lack of specificity of the gene used as an indicator of differences in hair length, but it can also be influenced by multiple genes, namely the expression gene shh in the anagen phase only
Other obstract
-
| Item Type: | Thesis (Sarjana) |
|---|---|
| Identification Number: | SKR/FKH/2019/169/051909699 |
| Uncontrolled Keywords: | Kelinci, Lhx2, Polymerase Chain Reaction, Rabbit, Lhx2, PCR |
| Subjects: | 600 Technology (Applied sciences) > 636 Animal husbandry > 636.9 Other mammals > 636.932 2 Other mammals (Oryctolagus (Old World rabbit)) |
| Divisions: | Fakultas Kedokteran Hewan > Kedokteran Hewan |
| Depositing User: | Nur Cholis |
| Date Deposited: | 22 Sep 2020 03:25 |
| Last Modified: | 21 Oct 2021 06:34 |
| URI: | http://repository.ub.ac.id/id/eprint/177029 |
Preview |
Text
AGNES ARIMBI AYUWANTI (2).pdf Download (1MB) | Preview |
Actions (login required)
 |
View Item |