Winatakusuma, Daniel (2018) Uji Ikatan Ellagitanin Ekstrak Etanol Daun Benalu Mangga (Dendrophtoe Pentandra) Dengan Dna Topoisomerase Ii Α Sebagai Agen Kokemoterapi 5-Fu Pada Kanker Serviks (Secara In Silico). Sarjana thesis, Universitas Brawijaya.
Abstract
Kanker serviks merupakan jenis kanker dengan prevalensi tinggi di Indonesia, penyebab utamanya yaitu virus HPV. Pengobatan kanker serviks yang ada pada saat ini salah satunya dengan kemoterapi, 5-FU merupakan agen kemoterapi yang biasa digunakan. Mekanisme kerja 5-FU melalui penghambatan enzim thymidylate synthase. Salah satu mekanisme 5-FU adalah menghambat enzim thymidyate synthase. Penggunaan 5-FU dosis tunggal memiliki efek samping sehingga perlu dikombinasikan dengan agen kokemoterapi berbahan alam, salah satunya ellagitanin yang terdapat pada berbagai jenis tanaman, termasuk pada benalu mangga (Dendrophtoe pentandra). Ellagitanin dapat bertindak sebagai inhibitor DNA topoisomerase II α pada sel kanker. Tujuan penelitian ini untuk mengetahui potensi ikatan ellagitanin dengan DNA topoisomerase II α dengan menggunakan metode molecular docking, potensi dapat dinilai dari besar afinitas ikatan dan perbandingannya dengan ligan/ obat kontrol. Penelitian ini merupakan jenis penelitian eksperimental sekunder menggunakan data struktur yang diambil dari database Pubchem dan Uniprot. Pyrx 0.8 digunakan untuk mengikatkan ellagitanin dengan DNA topoisomerase II α, Pymol untuk visualisasi struktur antarmolekul kompleks, dan LigPlot untuk identifikasi ikatan yang terbentuk. Pada hasil docking terhadap DNA topoisomerase II α, didapatkan nilai binding affinity ellagitanin sebesar -5,3 kkal/mol sementara binding affinity etoposide (obat kontrol) sebesar -4,8 kkal/mol. Dalam perbandingannya dengan obat kontrol etoposide, ellagitanin memiliki nilai binding affinity yang lebih kuat sehingga ellagitanin dapat dikatakan berpotensi dalam berikatan dengan DNA topoisomerase II α. Mekanisme kerja ellagitanin yang berbeda dengan 5-FU menjadikan efek sinergis dalam menghambat kanker serviks.
English Abstract
Cervical cancer is a type of cancer with high prevalence in Indonesia, the main cause of which is the HPV virus. The treatment of cervical cancer that is currently available is chemotherapy, 5-FU is a commonly used chemotherapy agent. The mechanism of action of 5-FU is through inhibition of the enzyme thymidylate synthase. One of the 5-FU mechanisms is to inhibit the thymidyate synthase enzyme. The use of a single 5-FU dose has side effects so it needs to be combined with natural chemotherapy agents, one of which is ellagitannin found in various types of plants, including the mango parasite (Dendrophtoe pentandra). Ellagitannin can act as a DNA topoisomerase II α inhibitor in cancer cells. The purpose of this study is to determine the potential of ellagitannin bonds with DNA topoisomerase II α using the molecular docking method, the potential can be assessed from the large bond affinity and its comparison with ligands / control drugs. This research is a kind of secondary experimental research by using data from Pubchem and Uniprot databases. Pyrx 0.8 is used to bind ellagitannin with DNA topoisomerase II α, Pymol to visualize complex intermolecular structures, and LigPlot to identify the bonds formed. In the docking result of DNA topoisomerase II α ,the binding affinity score of ellagitannin was -5.3 kcal / mol while etoposide (control drug) was -4,8 kcal/mol. Ellagitanin can bind to DNA topoisomerase II α with a stronger binding affinity than etoposide thus ellagitannin can be said to have the potential to bind to DNA topoisomerase II α. The mechanism of action of ellagitannin that is different from 5-FU makes a synergistic effect in inhibiting cervical cance
| Item Type: | Thesis (Sarjana) |
|---|---|
| Identification Number: | SKR/FK/2018/515/051900977 |
| Uncontrolled Keywords: | kanker serviks, 5-FU, thymidylate synthase, ellagitanin, DNA topoisomerase II α, cervical cancer, 5-FU, thymidylate synthase, ellagitannin, DNA topoisomerase II α |
| Subjects: | 600 Technology (Applied sciences) > 615 Pharmacology and therapeutics > 615.5 Therapeutics |
| Divisions: | Fakultas Kedokteran > Pendidikan Dokter |
| Depositing User: | Nur Cholis |
| Date Deposited: | 06 May 2019 01:06 |
| Last Modified: | 21 Oct 2021 07:24 |
| URI: | http://repository.ub.ac.id/id/eprint/167527 |
Preview |
Text
Daniel Winatakusuma.pdf Download (5MB) | Preview |
Actions (login required)
 |
View Item |