Klasifikasi Fungsi Senyawa Aktif Data Berdasarkan Kode Simplified Molecular Input Line Entry System (SMILES) Menggunakan Metode Modified K-Nearest Neighbor

Alfiyanti, Yunita Dwi (2018) Klasifikasi Fungsi Senyawa Aktif Data Berdasarkan Kode Simplified Molecular Input Line Entry System (SMILES) Menggunakan Metode Modified K-Nearest Neighbor. Sarjana thesis, Universitas Brawijaya.

Abstract

Senyawa merupakan zat tunggal kimia dari dua atau lebih unsur kimia yang membentuk ikatan dan dapat diuraikan. Senyawa dibagi menjadi senyawa aktif dan senyawa tidak aktif. Senyawa aktif adalah senyawa kimia yang memiliki banyak fungsi. Senyawa memiliki susunan yang sulit diolah pada komputer, untuk itu diciptakan kode yang mudah untuk diproses menggunakan komputer. Kode tersebut adalah SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) yang merupakan notasi kimia modern yang dapat disimpan pada variabel string sehingga memudahkan proses klasifikasi pada sistem. Karakteristik pada SMILES didapat dengan melakukan preprocessing dengan hasil berupa 11 fitur yang terdiri dari atom B, C, N, O, P, S, F, Cl, Br, I dan OH. Fitur-fitur tersebut kemudian digunakan untuk proses klasifikasi menggunakan metode Modified K-Nearest Neighbor yang merupakan pengembangan performansi dari metode KNN yang terdiri dari dua pemrosesan, validasi data latih dan pembobotan. Klasifikasi fungsi senyawa aktif bertujuan untuk mempermudah pengelompokkan senyawa aktif berdasarkan farmakologinya melalui bantuan teknologi informasi dan perosesan ilmu komputer, dimana selama ini pada bidang kedokteran memerlukan waktu yang lama dalam penentuannya karena menggunakan tes laboratorium. Pengujian pada penelitian ini menggunakan dataset sebanyak 260 yang terbagi menjadi 2 kelas kategori yaitu kelas Saraf dan kelas Jantung yang terdiri dari data latih dan data uji sebesar 90% (234 data) dan 10% (26 data). Hasil dari pengujian didapatkan nilai akurasi sebesar 73% dengan nilai k sebesar 3, sedangkan pada pengujian k-fold cross validation nilai akurasi didapatkan ratarata sebesar 62,69%.

English Abstract

Compound is a single chemical substance from two or more chemical elements that make up bonds and can be decomposed. The compound is divided into active compounds and inactive compounds. Active compounds are chemical compounds that have many functions. Compounds have an arrangement that is difficult to process on a computer, for which code is made easy to make using a computer. The code is SMILES (Simple Input System for Molecular Input) which is a modern chemical notation that can be stored in string variables to facilitate the classification process in the system. The characteristics of the SMILES are made by doing preprocessing with the results consisting of 11 features consisting of B, C, N, O, P, S, F, Cl, Br, I and OH atoms. These features are then used for the classification process using the Modified K-Nearest Neighbor method which is the performance development of the KNN method which consists of two developments, training data validation and weighting. Classification of the active compilation function for active complement compilation based on its pharmacology through the help of information technology and computer science degeneration, where so far in the medical field it takes a long time in its determination to use laboratory tests. The test in this study used a dataset of 260 which were divided into 2 categories of classes, namely the Neural class and the Heart class which consist of training data and test data of 90% (234 data) and 10% (26 data). The results of the test were obtained a test value of 73% with a k value of 3, while in the k-fold test cross validation the value of accuracy obtained an average of 62.69%.

Item Type: Thesis (Sarjana)
Identification Number: SKR/FTIK/2018/1048/051901077
Uncontrolled Keywords: Senyawa Aktif, SMILES, Modified K-Nearest Neighbor-Active Compounds, SMILES, Modified K-Nearest Neighbor
Subjects: 500 Natural sciences and mathematics > 546 Inorganic chemistry
Divisions: Fakultas Ilmu Komputer > Teknik Informatika
Depositing User: soegeng sugeng
Date Deposited: 27 Jun 2020 13:15
Last Modified: 19 Oct 2021 08:13
URI: http://repository.ub.ac.id/id/eprint/167165
[thumbnail of Yunita Dwi Alfiyanti.pdf]
Preview
Text
Yunita Dwi Alfiyanti.pdf

Download (7MB) | Preview

Actions (login required)

View Item View Item