Fitriyah (2012) Analisis Insilico Desain Kandidat Vaksin Multi-Epitope Spesifik terhadap Reseptor Mannose untuk Menghambat Infeksi Virus Dengue. Magister thesis, Universitas Brawijaya.
Abstract
Demam Berdarah Dengue (DBD) merupakan salah satu permasalahan kesehatan utama dunia terutama untuk negara-negara berkembang di wilayah tropis dan sub tropis seperti Indonesia. DBD merupakan penyakit demam akut yang disebabkan oleh virus dengue (baik serotype 1, 2, 3 dan 4) yang ditransmisikan oleh nyamuk genus Aedes dan ditandai dengan empat gejala klinis yaitu demam yang tinggi, manifestasi perdarahan, hepatomegali dan tanda-tanda kegagalan sirkulasi sebagai akibat dari kebocoran plasma yang dapat menyebabkan kematian. Pencegahan dan pengobatan DBD sampai saat ini masih mengalami hambatan karena obat dan vaksin yang potensial masih terus dalam proses penelitian sehingga masih menggunakan pengendalian vektor. Salah satu hambatan pengembangan vaksin ini disebabkan oleh beragamnya strain dalam empat serotype virus dengue. Dengan demikian kebutuhan untuk mengembangkan vaksin tidak hanya satu melainkan beberapa imunogens yang akan memberikan respon yang seimbang sehingga memberikan kekebalan yang protektif. Tujuan penelitian ini adalah untuk mendesain kandidat vaksin yang spesifik terhadap reseptor mannose untuk menghambat infeksi virus pada empat serotype virus dengue dengan pendekatan teknologi bioinformatika. Metode yang digunakan dalam penelitian meliputi: pencarian data protein, alignment protein dan seleksi varian virus, homologi modeling, analisis docking, analisis interaksi protein virus dengan reseptor, analisis antigenisitas, analisis prediksi epitop dan analisis BLAST. Hasil penelitian menunjukkan bahwa terdapat 7 (tujuh) epitop yang diprediksikan berdasarkan MHC I (HLA-A*24) dan 9 epitop yang diprediksikan berdasarkan MHC II (HLA-DR*12), dimana 16 epitop tersebut berikatan secara spesifik pada reseptor mannose, memiliki antigenisitas yang tinggi dan memiliki kesamaan yang rendah dengan protein manusia.
English Abstract
Dengue Haemorrhagic Fever (DHF) is one of the world ‟ s major health problem especially for developing countries in tropical and subtropical region such as Indonesia. DHF is an acute fever caused by dengue virus (serotype 1, 2, 3 and 4) transmitted by the mosquito of Aedes genus which is characterized by four clinical symptoms are high fever, bleeding, hepatomegaly and the circulatory failure caused by plasma leakage that can cause death . The treatment to cure DHF still have not been encouraging because DHF vaccine being able to cover all variant of dengue viruses still not available yet, so it is still use a vector control Thus the need to develop a vaccine not only one but several immunogens that will provide a balanced response for protective immunity. The aim of this study was to design a specific vaccine candidate against the mannose receptor to inhibit viral infection of the four dengue virus serotype with the bioinformatics technology approach. The method used in the study are: protein data searching, protein alignment and selection of viral variance, homology modeling, docking analysis, interaction between viral protein and receptor analysis, antigenicity analysis, epitope prediction analysis and BLAST analisys. The result of this study showed that there are 7 (seven) epitope were predicted based on MHC I (HLA-A*24) and 9 (nine) epitope were predicted based on MHC II (HLA-DR*12). All of these epitope specifically binds to mannose receptor, have a high antigenicity and low similarity with the human protein.
| Item Type: | Thesis (Magister) |
|---|---|
| Identification Number: | TES/614.588 52/FIT/a/041204240 |
| Subjects: | 600 Technology (Applied sciences) > 614 Forensic medicine; incidence of injuries, wounds, disease; public preventive medicine > 614.5 Incidence of and public measure to prevent specific disease and kinds of diseases |
| Divisions: | S2/S3 > Magister Matematika, Fakultas MIPA |
| Depositing User: | Endro Setyobudi |
| Date Deposited: | 30 Dec 2013 15:00 |
| Last Modified: | 30 Dec 2013 15:00 |
| URI: | http://repository.ub.ac.id/id/eprint/158001 |
Actions (login required)
 |
View Item |