Profiling of Intestinal Microbial Diversity by PCR-DGGE Genes Coding for 16S rDNA and Immunity Status of the Orange Spotted Grouper (Epinephelus coioides) Following Probiotic Bacillus subtilis Adminis

Purwandari, Anggraini Ratih (2012) Profiling of Intestinal Microbial Diversity by PCR-DGGE Genes Coding for 16S rDNA and Immunity Status of the Orange Spotted Grouper (Epinephelus coioides) Following Probiotic Bacillus subtilis Adminis. Magister thesis, Universitas Brawijaya.

Abstract

Groupers adalah ikan marikultura penting di Taiwan dan negara-negara Asia Tenggara. Orang oranye berbintik-bintik yang berkembang pesat (epinephelus coioida) telah mengalami masalah penyakit bakteri yang relatif parah. Proliferasi patogen dalam ikan dapat ditekan oleh mikrobiota komensal. Dalam konteks ini, probiotik tampaknya menawarkan alternatif yang menarik. Bacillus subtilis adalah bakteri probiotik yang diberikan dalam diet untuk menekan proliferasi patogen. Dalam penelitian ini, E.Coioides diberi makan selama 6 bulan dengan diet yang mengandung B.SubTilis pada 0 (kontrol), 0,1% dan 1%. Perubahan berat badan dan efisiensi pakan dari kelompok 0,1 dan 1% secara signifikan lebih baik daripada kelompok kontrol. Respons seluler bawaan, ledakan pernapasan ikan memberi makan 1% dan 0,1% diet secara signifikan lebih tinggi dibandingkan dengan kelompok kontrol pada 10 atau 20 hari setelah pemberian makan, dan bahkan lebih signifikan pada 30 hari. Subtilis Bacillus probiotik meningkatkan keanekaragaman mikroba usus ikan yang diukur dengan nomor pita yang terlihat dan indeks keanekaragaman Shannon dalam analisis DGGE. Subtilis probiotik Bacillus juga merangsang populasi spesies bakteri seperti Paenibacillus sp, lactobacillus oeni strain 59 b, dan methilacidophilum infernorum strain v4 yang bermanfaat untuk epinephelus coioida. Dosis terbaik dari subtilis bacillus probiotik berdasarkan pertunjukan pertumbuhan, respons seluler bawaan dan profil mikrobiota dalam usus ikan 0,1%, yang menunjukkan kemanjuran yang sama dengan diet 1%.

English Abstract

Groupers are an important mariculture fish in Taiwan and Southeast Asian countries. The rapidly growing orange spotted grouper ( Epinephelus coioides ) has experienced relatively severe bacterial disease problems. The proliferation of pathogens in fish can be suppressed by commensal microbiota. In this context, probiotic seem to offer an attractive alternative. Bacillus subtilis is a probiotic bacterium that is administered in diet to suppress proliferation of pathogens. In the present study, E.coioides were fed for 6 months with diets containing B.subtilis at 0 (control), 0.1 % and 1 %. Percent weight gain and feed efficiency of the 0.1 and 1 % groups were significantly better than the control group. The innate cellular response, respiratory burst of the fish fed the 1 % and 0.1 % diet was significantly higher compared to the control group on 10 or 20 days after feeding, and even more significant on 30 days. Probiotic Bacillus subtilis increased the fish`s intestinal microbial diversity as measured by visible band number and Shannon diversity index in DGGE analysis. Probiotic Bacillus subtilis also stimulated the population of bacterial species like Paenibacillus sp, Lactobacillus oeni strain 59 b, and Methilacidophilum infernorum strain V4 that beneficial for Epinephelus coioides . The best dose of probiotic Bacillus subtilis based on growth performances, innate cellular responses and profile of microbiota in fish intestines is 0.1 %, which showed equal efficacy as the 1% diet .

Item Type: Thesis (Magister)
Identification Number: TES/597.736/PUR/p/041302611
Subjects: 500 Natural sciences and mathematics > 597 Cold-blooded vertebrates > 597.7 Perciformes
Divisions: S2/S3 > Magister Budidaya Perairan, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan
Depositing User: Endro Setyobudi
Date Deposited: 11 Jun 2013 14:19
Last Modified: 31 Mar 2022 08:45
URI: http://repository.ub.ac.id/id/eprint/157887
[thumbnail of 041302611.pdf] Text
041302611.pdf

Download (4MB)

Actions (login required)

View Item View Item