Dewanti, Amalia Citra (2017) Analisa Kekerabatan Sapi Jaliteng (Jawa Bali Banteng) Berdasarkan Sekuen Gen Cyt-b (Cytochrome b) Dengan Metode Polymerase Chain Reaction (PCR). Sarjana thesis, Universitas Brawijaya.
Abstract
Sapi Jaliteng merupakan hasil persilangan antara Banteng Jawa dan Sapi Bali. Kekerabatan genetik dapat digunakan sebagai titik awal untuk meningkatkan kualitas dan kuantitas genetik. Analisis DNA melalui gen Cyt-b (Cytochrome b) mitokondria dapat digunakan untuk mengetahui keragaman genetik. Penelitian ini bertujuan untuk melihat susunan nukelotida Sapi Jaliteng (SJ) serta melihat kekerabatan Sapi Jaliteng dengan Banteng Jawa dan Sapi Bali (SB). Sampel yang digunakan berasal dari Sapi Bali dan Sapi Jaliteng. Amplifikasi gen Cyt-b menggunakan sepasang primer Cytb_F 5‘GCAATTGCCATAGTCCACCT3’ dan Cytb_R 5‘GGATTTGCCGGGGTATAGTT3’ melalui PCR. Produk PCR dilakukan sekuen dengan metode Dideoksi Sanger. Hasil penelitian menunjukkan target gen Cyt-b yang disekuen adalah 212 bp dan hasil penyejajaran didapatkan 168 bp. Jarak genetik berdasarkan sekuen nukleotida ditentukan dengan metode Maximum Composite Likelihood adalah dengan jarak terendah 0,0% dan jarak tertinggi 0,6%. Kesimpulan dari penelitian ini adalah gen Cyt-b dapat digunakan untuk melihat hubungan kekerabatan Sapi Jaliteng (F1 dan F2) terhadap Sapi Bali dan Banteng Jawa.
English Abstract
Jaliteng Cattle was the result of cross breed between Bull of Java and Bali Cattle. Genetic relations can be used as a starting point to improve genetic quality and quantity. DNA analysis with Cyt-b gene (Cytochrome b) of mitochondria can be used to identify genetic diversity. This study was aimed to see the nucleotida of Jaliteng Cattle and determine the relations with Bull of Java and Bali Cattle. Sample used from Bali Cattle and Jaliteng Cattle. The Cyt-b gene was amplified by PCR with Cytb_F 5‘GCAATTGCCATAGTCCACCT3’ and Cytb_R 5‘GGATTTG CCGGGGTATAGTT3’. PCR product has been sequenced with Dideoxy Sanger method. The result showed that sequnece of Cyt-b gene is 212 bp and the alignment is 168 bp. Genetic distances based on nucleotide sequence were determined with Maximum Composite Likelihood method producing the smallest of 0,0% and the highest of 0,6%. This study has concluded that Cyt-b gene can be applied to observe the genetic similarity of Jaliteng Cattle (F1 and F2) with Bali Cattle and Bull of Java.
| Item Type: | Thesis (Sarjana) |
|---|---|
| Identification Number: | SKR/FKH/2017/104/051706287 |
| Uncontrolled Keywords: | Cytochrome b, DNA mitokondria, Jaliteng, PCR |
| Subjects: | 500 Natural sciences and mathematics > 599 Mammalia (Mammals) > 599.6 Ungulates > 599.64 Bovidae > 599.642 Bovinae > 599.642 2 Bos (Oxen) |
| Divisions: | Fakultas Kedokteran Hewan > Kedokteran Hewan |
| Depositing User: | Yusuf Dwi N. |
| Date Deposited: | 22 Aug 2017 03:45 |
| Last Modified: | 27 Oct 2020 15:14 |
| URI: | http://repository.ub.ac.id/id/eprint/1495 |
Actions (login required)
 |
View Item |