Eksplorasi Alel Carrier Bovine Leucocyte Adhesion Deficiency (BLAD) melalui Analisa Polimorfisme Gen CD18 dengan Teknik PCR-RFLP pada Sapi Perah Peranakan FH Betina di Kecamatan Batu

Pratama, Aldryan Cristianto (2020) Eksplorasi Alel Carrier Bovine Leucocyte Adhesion Deficiency (BLAD) melalui Analisa Polimorfisme Gen CD18 dengan Teknik PCR-RFLP pada Sapi Perah Peranakan FH Betina di Kecamatan Batu. Sarjana thesis, Universitas Brawijaya.

Abstract

Sapi perah PFH merupakan salah satu hewan ternak yang banyak dipelihara sebagai salah satu komoditas peternakan yang cukup menjanjikan karena selain menghasilkan susu, mereka juga memproduksi daging. Faktor genetik adalah salah satu faktor utama yang berkontribusi untuk meningkatkan produktivitas dan peningkatan jumlah ternak sapi perah. Namun, ada beberapa kelainan genetik yang mematikan dan sering ditemukan pada sapi perah. Salah satu kelainan genetik pada sapi perah yang sering terjadi adalah bovine leucocyte adhesion deficiency (BLAD). Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui cara mengidentifikasi adanya alel carier BLAD pada sapi perah peranakan FH betina dan cara perhitungan frekuensi sapi perah peranakan FH betina dengan heterozigot BLAD yang ada di Kecamatan Batu. Sampel yang digunakan berupa 60 sampel darah sapi perah peranakan FH betina yang dilakukan ekstraksi dan diisolasi DNAnya. Amplifikasi DNA dilakukan dengan metode PCR menggunakan primer forward (BLAD_F) 5’-TCA ACG TGA CCT TCC GGA GG-3’ dan primer reverse (BLAD_R) 5’-CCC AGA TTC TTG ACG TTG AC-3’. Amplifikasi ruas gen CD18 pada kromosom 1 exon 2 dengan panjang sesuai target 106bp telah berhasil dilakukan dengan tingkat keberhasilan 100%. Kemudian dilanjutkan dengan melakukan RFLP produk PCR dengan enzim restriksi NCOI. Analisis RFLP terhadap dengan enzim pemotong NCOI menunjukkan hasil 2 potongan pita 66bp dan 40bp, Hal ini menunjukkan bahwa Frekuensi alel normal sebesar 1 dan alel mutan sebesar 0 dengan frekuensi genotif heterozigot 0%. Deteksi dini kelainan genetik BLAD diperlukan pada suatu populasi sapi perah untuk mencegah penyebaran kelainan genetik tersebut.

English Abstract

PFH dairy cows are one of the many livestock raised as one of the livestock commodities which is quite promising because besides producing milk, they also produce meat. Genetic factors are one of the main factors that contribute to increasing productivity and increasing the number of dairy cattle. However, there are several deadly genetic disorders that are often found in dairy cows. One of the genetic abnormalities in dairy cows that often occurs is bovine leucocyte adhesion deficiency (BLAD). This study aims to determine how to identify the presence of BLAD carier alleles in female PFH dairy cows and how to calculate the frequency of female PFH dairy cows with BLAD heterozygotes in Batu District. The sample used consisted of 60 blood samples of female FH dairy cows extracted and DNA isolated. DNA amplification was carried out by PCR method with forward primer (BLAD_F) 5'-TCA ACG TGA CCT TCC GGA GG-3 primary and reverse primary (BLAD_R) 5'-CCC AGA TTC TTG ACG TTG AC-3 ’. Amplification of the CD18 gene segment on chromosome 1 exon 2 with a target length of 106bp has been successfully carried out with a success rate of 100%. Then proceed with RFLP on PCR products with the NCOI restriction enzyme. RFLP analysis of NCOI cutting restriction enzymes shows that there are 2 pieces of 66bp and 40bp band. This shows that the normal allele frequency is 1 and the mutant allele is 0 with heterozygous genotive frequency of 0% in the population. Early detection of genetic disorders is needed in a dairy cow population to prevent the spread of genetic disorders.

Other obstract

-

Item Type:	Thesis (Sarjana)
Identification Number:	SKR/FKH/2020/40/052003843
Uncontrolled Keywords:	Sapi PFH, Gen CD18, enzim restriksi NCOI, PCR RFLP, PFH dairy cattle, CD18 gene, restriction enzyme NCOI, PCR RFLP
Subjects:	600 Technology (Applied sciences) > 636 Animal husbandry > 636.2 Cattle and related animals > 636.21 Cattle for specific purposes
Divisions:	Fakultas Kedokteran Hewan > Kedokteran Hewan
Depositing User:	Budi Wahyono Wahyono
Date Deposited:	10 Aug 2020 06:35
Last Modified:	03 Oct 2024 02:26
URI:	http://repository.ub.ac.id/id/eprint/181311

Text Aldryan Cristianto Pratama.pdf Download (4MB)

Actions (login required)

View Item